美國加州大學洛杉磯分校物理學院院長訪問上海生科院
9月20日，美國加州大學洛杉磯分校物理學院院長Joseph Rudnick教授及該學院黃煥中教授訪問中科院上海生命科學研究院。 上海生科院院長助理廖侃研究員介紹了上海生科院的建設發展、研究領域、科研成果、人才隊伍、國際合作等情況。計算生物學所楊力研究員向來賓介紹了研究所概況。Rudnick院長也介紹了加州大學洛杉磯分校物理學院相關情況。雙方就生命科學與物理學的交叉、結合等共同感興趣的話題展開了交流。 來賓此行還參觀了計算生物學所量化生物學平臺，并訪問了生化與細胞所叢堯研究員實驗室。 參觀計算生物學所技術平臺 訪問叢堯研究員實驗室......閱讀全文
“計算生物學與生物信息學術研討會”在基因組所召開
隨著生命科學研究及基因測序等相關技術的飛速發展，計算生物學的重要性和復雜性在當前生物學數據量的不斷增長中日益顯現，并逐漸成為現代生物學研究的核心方法之一。為了推動國內相關研究單位間計算生物學和生物數據庫等領域的交流與合作，10月27日至28日，中科院北京基因組研究所召集國內外眾多
安捷倫科技生物信息學套裝新增整合生物學分析功能
安捷倫科技生物信息學套裝新增整合生物學分析功能 GeneSpring 現可實現通路水平的多組學及新一代測序數據分析 2012 年 3 月 27 日，加利福尼亞州圣克拉拉市——安捷倫科技公司(紐約證交所：A)今日發布了其廣受歡迎的生物信息學軟件的重要擴展版本
安捷倫科技將生物信息學系統擴展為綜合生物學套裝
??? 2010年 11 月 15 日，北京 — 安捷倫科技公司（紐約證交所：A）今日發布了，這是廣泛使用的生物信息學軟件的擴展版，能夠對多種類型的生物學數據進行可視化和分析。目前 GeneSpring GX 11.5 是首款可同時對外顯子芯片、蛋白組學和代謝組學實驗進行解讀的軟件，該工具
第五屆全國生物信息學大會召開
第五屆全國生物信息學與系統生物學學術大會日前在哈爾濱召開，來自海內外的600余位生物信息學專家、學者出席會議。與會專家以“高通量時代的生物信息學與系統生物學”為主題，分別就利用基因組信息學分類細菌的新方法、細菌基因組組織形式、系統生物學在醫學發展中的應用和研究策略以及基因組非編碼
北京生命科學論壇第八次會議召開
探尋數學與生物學的交叉學科生長點 北京生命科學論壇——數學與生物學交叉應用研究學術研討會近日在京召開。此次會議由中國科學院北京生命科學研究院與中國科學院數學與系統科學研究院共同主辦。會議以數學與生物學交叉應用為主題，中科院院士陳潤生、馬志明擔任本次大會主席。 據了解，以倡導學科交叉融合為宗旨，以
計算生物學所量化生物學平臺正式投入運行
近日，中科院上海生命科學研究院計算生物學研究所量化生物學平臺（Omics Core）正式投入運行。平臺配備有Illumina HiSeq 2000測序系統和相關儀器設備，該測序系統將文庫DNA/cDNA片段附著到特殊處理的光學透明玻璃表面（即Flow cell），并采用可逆終止法邊
陳潤生院士等獲頒中國生物信息學終身成就獎
9月27日，第九屆全國生物信息學與系統生物學學術大會在上海開幕。在為期2天半的會議期間，來自全國各地的700余名專家學者代表，將圍繞“新冠病毒研究與轉化醫學信息學”“單細胞組學分析方法與應用”“人工智能與生物信息學”和“腦科學與生物信息學”等生物信息學諸多傳統與新興領域進行研討與交流。 中國科
生物信息學教程
Sequence - Evolution - FunctionComputational Approaches in Comparative GenomicsbyEugene V. KooninNational Center for Biotechnology Information, Bethes
中科院七研究所聯手迎接新的測序時代
9月10日，中國科學院北京生命科學研究院(籌)第一屆生物信息學研討會在京舉行。記者從會上獲悉，正在籌備的中科院北京生命科學研究院將把中科院京區7個相關研究所整合起來“迎接新的測序時代”。會上，籌備工作組研究員康樂介紹了中國科學院北京生命科學研究院 (籌)的情況。 據康樂介紹，中國科學院北京生命科學
許錦波當選國際計算生物學學會Fellow
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503301.shtm近日，國際計算生物學學會（ISCB）發布消息，計算生物學家、清華大學智能產業研究院卓越訪問教授許錦波當選ISCB Fellow，當選理由為“通過開創全新計算方式及軟件程序，為蛋白質結構
生物信息學新進展
計算機技術和人類基因組計劃的發展，應運而生了一門新興的學科——生物信息學，該學科包含了兩個交叉領域的工作：用于建立現代生物學所需信息系統框架（支持生物學的信息管理系統、分析工具和通訊網絡）的研究開發工作，即傳統意義上的生物信息學（bioinformatics）；旨在理解基本生物學問題的基于計算的研究
生物信息學技術的原理
生物信息學在生命科學研究中起著越來越重要的作用。利用生物信息學對蛋白質組的各種數據進行處理和分析，也是蛋白質組研究的重要內容。生物信息學是蛋白質組學研究中不可缺少的一部分。生物信息學的發展，已不僅是單純的對基因組、蛋白質組數據的分析，而且可以對已知的或新的基因產物進行全面分析。在蛋白質組數據庫中儲存
學科“交叉”比交叉學科更重要
■王義遒 ◎ 形成交叉學科要有相對固定、共同且比較復雜的科學或技術研究對象。 ◎ 不同學科的領頭人必須對母學科有相當深入的理解，能掌握其精神實質和處理問題方法的精髓，并具有一定的融合能力。 ◎ 交叉學科成員應與母學科保持經常性聯系，不斷從母學科中獲得新知識、新技術的滋養，并在交叉學科中發揮
奇拉實驗室在計算生物學所成立
王學才和Kirstin Augsburg共同為實驗室揭牌 9月16日上午，奇拉實驗室在上海生命科學研究院計算生物學所內正式掛牌成立。計算生物學所執行所長金力、黨總支書記兼副所長王學才、德國駐滬總領事館文化事務與新聞領事Kirstin Augsburg、領事Fredric Jor
NSF斥巨資－計算機助力植物生物學研究
就像谷歌地球能夠讓你從空中放大自己的家一樣，有朝一日，或許只需要點擊幾下鼠標，研究人員便能夠在植物的整個生態系統與分子結構之間任意切換。1月30日，美國國家科學基金會（NSF）向5家研究機構提供了5000萬美元的資金，這些錢將用于研制那些聯系和分析多領域數據的軟件和硬件，旨在實現解答有關植物復雜問題
生物學,崛起的下一代計算平臺
Synhego公司距離Facebook總部僅五分鐘車程，從外觀來看，它和硅谷的其他創業公司并無差異，但是在它米色的辦公園區里，一模一樣的黑色服務器機架整齊地排列著，燈光閃爍，發出呼呼的排氣聲，然而這些金屬架子里并沒有零件在驅動網絡的運行。這些機器正在利用分子改寫生代碼。 Crispr是一種
生物醫學遭遇大數據－復合型人才缺乏待解決
目前獲取海量數據變得越來越方便，但一家機構與另一家產生的資料有很多差別，把這些信息集中分析時就需要一個共同的標準。 標準化雖然艱難，但與會的業內人士普遍認為，當務之急是解決生物醫學和信息科學兼通的復合型人才缺乏困境。 大數據時代正在深刻影響生物醫學研究：海量數據需要在不同系統
生物信息學技術的技術原理
生物信息學在生命科學研究中起著越來越重要的作用。利用生物信息學對蛋白質組的各種數據進行處理和分析，也是蛋白質組研究的重要內容。生物信息學是蛋白質組學研究中不可缺少的一部分。生物信息學的發展，已不僅是單純的對基因組、蛋白質組數據的分析，而且可以對已知的或新的基因產物進行全面分析。在蛋白質組數據庫中儲存
生物信息學—促動BT與IT雙贏
? 無論是與結構基因組學對應的“基因時代”，還是與功能基因組學、蛋白質組學相應的“后基因時代”；無論你稱呼21世紀是“信息時代”、“后信息時代”，還是“生物時代”，所有這一切，都將BT(生物技術)與IT(信息技術)緊密結合起來。而這其中，無疑“生物信息學”占據了天時地利、出盡了風頭，雖然它自身及其相
計算生物學研究所“蛋白建模”學習班舉辦
Juergen Schlitter教授講課中 6月7日至11日，中科院上海生命科學研究院計算生物學研究所、中科院計算生物學重點實驗室舉辦了為期一周的“Protein Modeling” 學習班。學習班面向生科院各所研究生開放，來自全院的多名研究生參加了學習培訓。 學習班由
高校如何發力交叉學科研究
促進交叉學科研究是世界高水平研究型大學的共同發展趨勢與重要發展策略。近年來，隨著我國高校“雙一流”建設深化推進，國家政策層面對高校開展交叉學科研究的重視程度不斷提升。《統籌推進世界一流大學和一流學科建設實施辦法》《關于高等學校加快“雙一流”建設的指導意見》《關于深入推進世界一流大學和一流學科建設
聚焦交叉學科：尷尬源自分化思維
在國際上，交叉學科的地位越來越重要，但在我國，交叉學科研究和管理方面均存在諸多問題：科研前景廣闊但難以申請項目，研究成果豐碩但評價標準難以統一，學科地位顯要卻缺乏人才培養體系。 為此，本報將刊發系列報道，從交叉學科的科研環境、科研人員生存現狀和完善學科管理體系三方面問題入手，探討和反思交叉
擺脫簡單疊加－交叉學科如何真正融合
國家納米中心主任趙宇亮院士長期從事納米材料的安全性研究。他在國際上率先提出納米材料安全性問題，創建了我國首個納米生物效應與安全性實驗室，是國際公認的納米毒理學和納米藥物領域的開拓者。 這位曾經的核物理學家深切地感受到科學交叉融合的重要性——在過去的十多年間，他一直
擺脫簡單疊加－交叉學科如何真正融合
國家納米中心主任趙宇亮院士長期從事納米材料的安全性研究。他在國際上率先提出納米材料安全性問題，創建了我國首個納米生物效應與安全性實驗室，是國際公認的納米毒理學和納米藥物領域的開拓者。? ? 這位曾經的核物理學家深切地感受到科學交叉融合的重要性——在過去的十多年間，他一直從事納米藥物運輸技術的研究
交叉學科發展仍需營造良好生態
近年來，隨著我國科技研發與人才培養形式的變化，以及創新型國家建設的發展需求，交叉學科的重要性日益凸顯。“厚實學科基礎，培育新興交叉學科生長點”也成為我國在國家層面對于學科發展提出的要求。 應該說，我國交叉學科的發展歷史雖然不及某些西方國家悠久，但早在上世紀80年代，我國已經看到交叉學科的重要性
“面向蛋白質科學的高性能計算研究”項目通過驗收
驗收會現場 4月17日至18日，中國科學院計劃財務局會同信息化工作領導小組辦公室和高技術研究與發展局組織專家，在北京對中科院知識創新工程重大項目——“面向蛋白質科學的高性能計算研究”及該項目下設的9個課題進行了現場驗收。 通過四年的努力，項目在高性能計算機系統新技術、領域應用加速新方
Science：生物信息學，神秘的新職業
今天的生物信息學家迎來了好時候。由于各個部門生成了幾乎無窮無盡的生物數據，因此形成了對于生物、統計學和計算機科學交叉領域中有經驗的專業人才的高度需求。科學家如果能夠分析大量信息并將其清晰地展示給決策制定者，就會發現自己的工作和職業生涯前途無量，尤其是在大型制藥和生物技術部門。 “在大數據時代，
生物芯片用于生物信息學研究
人類基因組計劃是人類為了認識自己而進行的一項偉大而影響深遠的研究計劃。目前的問題是面對大量的基因或基因片斷序列如何研究其功能，只有知道其功能才能真正體現HGP計劃的價值--破譯人類基因這部天書。后基因組計劃、蛋白組計劃、疾病基因組計劃等概念就是為實現這一目標而提出的。生物信息學將在其中扮演至關重要的
Cystatin基因家族的生物信息學分析
實驗概要半胱氨酸蛋白酶抑制劑(cystatin)基因廣泛存在于植物物種中。該類基因能夠起到抑制某些病原微生物和昆蟲體內半耽氨酸蛋白酶的作用，在植物的防衛體系中起到重要作用。我們利用已經分離出植物cystatin基因的cystatin結構域為檢索序列在基因組水平上對擬南芥和水稻中的cystatin基因
生物信息學中的HSP的含義
熱休克蛋白（英文：heat shock protein ）又稱應激蛋白，是機體細胞在一些理化因素刺激后高效表達的一組蛋白質，因最先發現于果蠅唾液腺的熱應激反應中而得名，此后的研究表明，熱休克蛋白廣泛存在于人、動物、微生物和植物的細胞中，是一類在遺傳上高度保守的分子，能保護細胞并促進細胞對各種刺激所造