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  • 研究人員創建精準N糖蛋白質組學分析方法

    復旦大學化學系教授楊芃原團隊、中科院計算技術研究所研究員賀思敏團隊、國家蛋白質科學中心(上海)研究員黃超蘭團隊合作,創建了基于質譜的高通量糖基化肽段分析方法,為精準N糖蛋白質組學提供了新技術。9月5日,相關研究成果發表于《自然—通訊》。 糖基化是最復雜的蛋白后修飾之一。與其他蛋白后修飾相比,糖基化不但會產生宏觀不均一性(每個蛋白上可能有多個后修飾位點),更會產生海量的微觀不均一性(每個位點上可能有幾十甚至上百種不同的后修飾基團)。此外,糖鏈本身的離子化效率很低。這些因素的結合使得糖基化分析的通量和質量遠低于蛋白質組學的常規分析水平。 該研究通過開發基于階梯能量的一步質譜采集法,提高了糖肽鑒定的通量開發了具有自主產權的糖肽檢索引擎,從糖鏈、肽段、糖肽三個層面對糖肽數據庫檢索進行精確質控,從而大幅提升了N糖蛋白質組學分析的通量和質量。同時,研究人員首次將重標元素應用于糖肽鑒定準確度分析,為該領域的質控分析提供了新的方......閱讀全文

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    復旦大學等創建精準N糖蛋白質組學分析方法

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    研究人員開發定量蛋白質組學數據的下游分析工具

    原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/507985.shtm

    復旦楊芃原組等開發精準糖蛋白質組新分析方法

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    基因組學做不了的事-蛋白質組學更精準打擊癌癥

    近日,國際人類蛋白質組組織公布了2020年度權威獎勵獲獎名單,中國科學院院士、軍事科學院軍事醫學研究院研究員賀福初榮獲蛋白質組學杰出成就獎。 賀福初院士率先提出人類蛋白質組計劃的科學目標與技術路線,倡導并領銜了人類第一個關于組織、器官的蛋白質組計劃,揭示了人體首個器官(肝臟)蛋白質組。2014年

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    質譜組學,引領精準

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    胃癌在全球腫瘤死亡原因中排名第三,其中我國的患病人數就占到一半。在很多人的印象中,胃癌就是一種病,但細分的話,它包括彌漫型胃癌等很多種,這些不同類型的胃癌甚至還可以進一步細分。那么,彌漫型胃癌究竟分幾種?患者手術后化療是否有效?預后如何呢?

    Cell:組學“全景”分析推動前列腺癌精準治療

      最近來自美國UCLA的癌癥研究人員開發了一組復雜的分析工具對患有轉移性前列腺癌的病例進行分析,繪制了幫助前列腺癌細胞增殖和抵抗治療的復雜基因和蛋白質網絡的詳細圖譜。研究人員還開發了一種計算方法來分析病人個體化數據幫助每位病人選擇最有效的治療藥物。  相關研究結果發表在國際學術期刊Cell上。  

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    蛋白質組與蛋白質組學簡介2

    3 甲基化干擾實驗用來檢測蛋白質的結合位點。甲基化修飾的DNA探針可以干擾蛋白質的結合。結合位點上未被修飾的DNA片段才能與蛋白結合,然后將DNA從被修飾的堿基處切割,電泳分離,結合蛋白的DNA在結合位點上不能被修飾,不能切斷,可確定結合位點的位置。 4 Dnase I 足紋分析 蛋白

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    新探針可實現對蛋白質N端組學深度富集檢測

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