單細胞測序新技術：同時分析單個細胞的轉錄組和甲基...
單細胞測序新技術：同時分析單個細胞的轉錄組和甲基化組 單細胞轉錄組和甲基化組分析已經成為了單細胞研究的強大工具。然而，由于細胞之間存在較大的差異，又不能同時檢測一個細胞的轉錄組和甲基化組，在單細胞中揭示DNA甲基化與基因表達的直接關聯還比較困難。 近日，加州大學范國平教授和同濟大學薛志剛教授領導團隊解決了這個問題。他們在GenomeBiology雜志上發布了自己開發的新測序方法——scMT-seq。這種方法能夠同時分析單個細胞的轉錄組和甲基化組。 研究人員用這種方法對感覺神經元進行研究，揭示了細胞間的轉錄組和甲基化組異質性。不過，這些差異大多不是啟動子甲基化造成的。舉例來說，啟動子帶CpG島的基因，表達水平與基因體甲基化正相關。這項研究表明，scMT-seq可以用來檢測單細胞中的轉錄組、甲基化組和單核苷酸多態性信息，進而解析表觀遺傳學基因調控機制。 單細胞基因組學領域近年來發展得非常迅速，為人......閱讀全文
單細胞測序新技術：同時分析單個細胞的轉錄組和甲基...
單細胞測序新技術：同時分析單個細胞的轉錄組和甲基化組 單細胞轉錄組和甲基化組分析已經成為了單細胞研究的強大工具。然而，由于細胞之間存在較大的差異，又不能同時檢測一個細胞的轉錄組和甲基化組，在單細胞中揭示DNA甲基化與基因表達的直接關聯還比較困難。 近日，加州大學范國平教授和同濟大學薛志剛教授
單細胞測序新技術：同時分析轉錄組和甲基化組
單細胞轉錄組和甲基化組分析已經成為了單細胞研究的強大工具。然而，在單細胞中揭示DNA甲基化與基因表達的直接關聯還比較困難。這是因為細胞之間存在較大的差異，又不能同時檢測一個細胞的轉錄組和甲基化組。加州大學范國平教授和同濟大學薛志剛教授領導團隊解決了這個問題。他們在Genome Biology雜志上發
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序，它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序，它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達，能準確區分細胞群體，并進行細胞分類間比較，以及能找到稀有的細胞的表達情況。
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序，它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序，它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達，能準確區分細胞群體，并進行細胞分類間比較，以及能找到稀有的細胞的表達情況。
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序，它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序，它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達，能準確區分細胞群體，并進行細胞分類間比較，以及能找到稀有的細胞的表達情況。
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序，它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序，它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達，能準確區分細胞群體，并進行細胞分類間比較，以及能找到稀有的細胞的表達情況。
空間轉錄組和單細胞轉錄組測序聯合應用的典型案例
單細胞轉錄組測序技術的如火如荼，伴隨著空間轉錄組測序技術的蓬勃發展，可以看到，在現有的高通量檢測技術領域，這兩種技術已為科學研究的發展提供了前所未有的技術支撐。從2019年單細胞多組學被評為《Nature Methods》年度技術進展，到2020年空間轉錄組技術也被評為年度技術進展，相信在接
PNAS突破：單個細胞核轉錄組測序
研究人員成功地從單個腦細胞細胞核中分離出全部的信使RNA并對其進行了測序。這項發表在《美國科學院院刊》(PNAS)上的新研究，將幫助研究人員更好地了解一些器官在健康和疾病狀態下的功能機制，為開發出個體化治療提供了又一塊跳板。 動物和植物中的大多數細胞都包含有一個細胞核，里面儲存著細胞的DN
科學家開發單細胞全轉錄組測序新技術
北京大學生物動態光學成像中心黃巖誼、湯富酬課題組在《美國科學院院刊》（PNAS）上發表題為“Microfluidic single-cell whole-transcriptome sequencing”的論文。該研究利用微流控芯片技術實現了高質量單細胞的全轉錄組測序樣品準備，全面提高了單細胞全
單細胞轉錄組測序研究熱點和發文錦囊
從Top50期刊2000余篇文獻統計： 在剛剛發布的“十四五”規劃中，“基因與生物技術”作為前沿科技攻關領域之一。而在這個領域，近年來最具里程碑的技術突破必然不能忽略“單細胞轉錄組測序”。本文通過對PubMed數據庫中Top50期刊的共計2357篇單細胞轉錄組測序的引文進行數據分析，幫助讀者了
玉米單細胞轉錄組測序，11種細胞類型
近日，廣東省科學院南繁種業研究所生物育種研究室在玉米單細胞轉錄組測序研究方面取得新進展。相關研究在線發表于《作物學報》（The Crop Journal）。廣東省科學院南繁種業研究所李旭輝博士為該論文第一作者，齊永文研究員為通訊作者。玉米是全球重要的糧食和能源作物，而其產量形成的基礎依賴其特殊的根系
高通量單細胞轉錄組測序發展與展望
單細胞轉錄組測序技術這幾年的發展之快，運用之廣已眾所周知。為更好的在國內推廣該技術，也為更好的將該技術運用到廣大科研工作者的實際工作中，上海生物芯片有限公司生物信息團隊通過對該技術的整理和歸納，在《生命科學》雜志上發表了名為“高通量單細胞轉錄組測序發展與展望”綜述文章，希望能進一步提升科研工作者對該
轉錄組測序和全轉錄組測序的區別
全轉錄組廣義上是指細胞在特定狀態下所能轉錄出來的?所有RNA的總和，包括mRNA和非編碼RNA?。借助高通量測序技術，可以全面獲取樣本中轉錄產物信息，結合競爭性內源RNA ( ceRNA)機制， 進行聯合分析，深入挖掘轉錄水平調控網絡。轉錄組測序的研究對象為特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有
人類腦細胞的單細胞轉錄組測序研究成果
人腦是由多種不同類別細胞組成的極其復雜的器官。傳統的細胞分類方法只能根據少數已知的細胞的標記分子（marker）對細胞進行分類，對每一類細胞的認識也非常有限。斯坦福大學的著名學者Stephen Quake及其團隊利用單細胞測序技術，對466個人大腦皮層的單細胞進行了轉錄組測序，通過數據分析發
單細胞轉錄組高級分析之細胞譜系分析
基于單細胞轉錄組數據的細胞軌跡分析常見形式有細胞變化軌跡分析和細胞譜系分析，在上一篇中，我們詳細介紹了常規擬時間序列分析的相關內容（具體內容查看鏈接）。在這里，我們主要就細胞譜系分析進行介紹和解讀。細胞譜系分析，最簡明的理解就是細胞領域的進化樹，通常指的是某類祖源細胞，在特定條件下，有多個發育軌跡和
上海歐易生物醫學－單細胞轉錄組測序和分析申報ANTOP獎啦
帶著三月的未完成，在四月奔跑起來，即使道路泥濘，也會收獲遍野的爛漫。2023年ANTOP獎的申報和評審工作如火如荼的開展。由上海歐易生物醫學科技有限公司申報的“高通量單細胞轉錄組測序杰出分析”ANTOP獎，現在進入大眾評審階段，誠邀各位伙伴們的投票！ 獎項名稱：高通量單細胞轉錄組測序杰出分析獎
單細胞轉錄組測序構建胸腺器官發生的分子圖譜
2019年10月8日，四川大學胡洪波研究組、解放軍總醫院第五醫學中心劉兵研究組與暨南大學基礎醫學院蘭雨研究組合作在Immunity雜志在線發表了題為“Single-cell RNA Sequencing Resolves Spatiotemporal Development of Pre-thy
突破性單細胞表觀基因組與轉錄組分析新技術
由英國及比利時的研究人員開發出的一種新方法，使得在單細胞中同時研究表觀基因組及轉錄組成為可能。發布在《自然方法》（Nature Methods）上的實驗方案，可幫助科學家們精確描繪出DNA甲基化改變與基因表達之間的關系。 近年來單細胞測序技術發展迅速，被廣泛用于研究細胞間的基因表達譜（轉錄組）
最新測序技術能用單個細胞分析基因組
美國物理學家組織網9月18日報道，最近，來自美國加利福尼亞大學圣地亞哥分校、克雷格·文特爾研究院和Illumina公司的科學家對現代基因測序算法進行了改良，只需從一個細菌細胞中提取的DNA（脫氧核糖核酸）就可組裝成接近完整的基因組，準確率達到90%，而傳統的測序方法至少需要10億個
華大基因再出手－單細胞轉錄組學測序技術的系統分析
單細胞轉錄組測序(Single-cell RNA-seq)是在單細胞水平對轉錄組（mRNA）進行測序的一項新技術，可發現細胞群體中真正起作用的細胞，特別適合對高度異質性的干細胞、腫瘤細胞及胚胎發育早期的細胞群體進行研究，認識細胞分子機制和基因調控網絡。單細胞RNA-seq技術需要在測序前制備文庫
新型微流控芯片可提高單細胞轉錄組測序效率
近日，中國科學院深圳先進技術研究院醫工所微納系統與仿生醫學研究中心研究員陳艷和南加州大學教授鐘江帆合作，在針對稀有細胞樣本的單細胞測序技術方面取得新進展。相關研究成果以Improving single-cell tranome sequencing efficiency with a microfl
單細胞轉錄組測序（scRNAseq）的十個問答解惑
高通量組學研究已經發展了快20年，從最開始的基因芯片到二代測序，從編碼基因到lncRNA，circRNA，從三代測序的出現到單細胞組學研究的火熱，相信在這個領域中共事的小伙伴們都深有感觸。大家都知道高通量單細胞測序現在很火，但是不是所有的研究都適用，是不是所有的樣本都能進行單細胞測序呢？本期小編
單細胞轉錄組測序（scRNAseq）的十個問答解惑
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單細胞轉錄組制備儀的功能
fluidigm C1 單細胞自動制備儀用于 mRNA 測序 更完整的流程 ?-首尾相連的流程對單細胞進行全轉錄組分析 最高的通量 ?-每次運行可前所未有的平行處理 96 個單細胞 更容易的操作 ?-直接從單細胞開始，簡化的樣本制備，只需 3 小時手工操作時間，沒有 片段化和純化步驟 更節省的成
單細胞基因組，一個新時代的到來
單細胞基因組旨在通過組學方法研究單個細胞。近年來隨著技術的發展，這一年輕的領域正在迅速成熟起來。單細胞基因組研究的前身可以追溯到用芯片檢測單細胞的基因表達。不過，新一代DNA測序才是單細胞基因組學的大功臣，這些技術的出現讓單細胞基因組研究最終一飛沖天。 2012年7月，Nature Biote
我國學者發表基于單細胞轉錄組測序數據的小鼠細胞圖譜
在國家自然科學基金項目（項目編號：31722027）等資助下，浙江大學醫學院干細胞與再生醫學中心郭國驥教授團隊在單細胞組學技術及哺乳動物全細胞表達譜系分析研究中取得突破性進展。相關成果以“Mapping the Mouse Cell Atlas by Microwell-seq”（利用微孔板測序
我國學者發表基于單細胞轉錄組測序數據的小鼠細胞圖譜
在國家自然科學基金項目（項目編號：31722027）等資助下，浙江大學醫學院干細胞與再生醫學中心郭國驥教授團隊在單細胞組學技術及哺乳動物全細胞表達譜系分析研究中取得突破性進展。相關成果以“Mapping the Mouse Cell Atlas by Microwell-seq”（利用微孔板測序
Nature－methods發布單細胞測序新技術
來自瑞典Ludwig癌癥研究所及Karolinska研究所的研究人員，在最新一期(9月22日)的《自然方法》(Nature Methods)雜志上報告了一項獲得重大改良的新技術，可以利用它來分析單細胞中的基因表達——這一性能與從基礎研究到未來癌癥診斷的一切事物均存在關聯。 資深作者Ri
Nature新技術：CRISPR+單細胞測序=？
CRISPR-Cas9“基因剪刀”的基因組編輯技術是生物研究和新型靶向藥物研發的有力工具。比如利用CRISPR篩選基因（pooled CRISPR screens），可以通過CRISPR gRNAs靶向成百上千個不同的基因，同時編輯許多細胞，然后實驗篩選編輯細胞，gRNA可以幫助確定哪些基因對于生物
安諾開年力作：單細胞轉錄組測序登陸Nature子刊
X染色體失活（XCI）是指雌性哺乳類細胞中，兩條X染色體的其中之一失去活性的現象，過程中X染色體會被包裝成異染色質，進而因功能受抑制而沉默化。Xist RNA是能引發X染色體沉默的長片段ncRNA，盡管Xist對XCI是必要的，但其對胚胎植入前的印記XCI的精確作用尚存爭議。近日，安諾優達與法國