RNA干擾相關知識Argonaute(AGO)
Argonaute(AGO):一類龐大的蛋白質家族,是組成RISCs復合物的主要成員。AGO蛋白質主要包含兩個結構域:PAZ和PIWI兩個結構域,但具體功能尚不清楚。研究表明,PAZ結構域結合到siRNA 的3’的二核苷酸突出端;一些AGO蛋白質的PIWI結構域賦予slicer以內切酶的活性。PAZ和PIWI兩個結構域,對于siRNA和目標mRNA相互作用,從而導致目標mRNA的切割或者翻譯抑制過程,是必不可少的。同時,不同的AGO蛋白質有著不同的生物學功能。例如,在人當中,AGO2“籌劃”了RISCs對于目標mRNA的切割過程;而AGO1 和AGO3則不具備這個功能。......閱讀全文
RNA干擾相關知識Argonaute(AGO)
Argonaute(AGO):一類龐大的蛋白質家族,是組成RISCs復合物的主要成員。AGO蛋白質主要包含兩個結構域:PAZ和PIWI兩個結構域,但具體功能尚不清楚。研究表明,PAZ結構域結合到siRNA 的3’的二核苷酸突出端;一些AGO蛋白質的PIWI結構域賦予slicer以內切酶的活性。PAZ
什么是Argonaute(AGO)?
Argonaute(AGO):一類龐大的蛋白質家族,是組成RISCs復合物的主要成員。AGO蛋白質主要包含兩個結構域:PAZ和PIWI兩個結構域,但具體功能尚不清楚。研究表明,PAZ結構域結合到siRNA 的3’的二核苷酸突出端;一些AGO蛋白質的PIWI結構域賦予slicer以內切酶的活性。PAZ
RNA干擾相關知識Microprocessor
Microprocessor:一種核內的復合物,主要由Drosha和Pasha兩者組成,在miRNA的生物合成中促使原始的miRNA成為miRNA前體。
RNA干擾相關知識Slicer
Slicer:在切割型RISC中的內切酶的另外一種表述方法。
RNA干擾相關知識RNARITS)
RNA-induced initiation of transcriptional gene silencing(RITS):是一種組織染色質變型的復合物。RITS復合物也包含Dicer加工形成的siRNA和AGO蛋白質,通過結合到異染色質的基因池上來促使異染色質上基因的沉默。
RNA干擾相關知識RNARISC
RNA-induced silencing complex(RISC):一種RNA-蛋白質復合物,通過與目標mRNA完全或者部分的互補配對來實施切割或者翻譯抑制功能。SiRNA組裝siRISC,miRNA組裝miRISC。RISCs(無論siRISC還是miRISC)包括兩種類型:切割型和不切割型。
RNA干擾相關知識Holo-RISC
Holo RISC:是在果蠅中發現的有著RISC活性的最大的RNA-蛋白質復合物(80S)。Holo RISC的生物學活性牽涉到幾乎所有的RISC的成員,RLC成員,和一些其他通路上的蛋白質分子。Holo RISC的存在,表明了RISC組裝不是孤立的,同時還是一個有序的過程。以RISC為中心的RNA
RNA干擾相關知識Dicer(DCR)
Dicer(DCR):是RNAase Ⅲ家族中的一員,主要切割dsRNA或者莖環結構的RNA前體成為小RNAs分子。對應地,我們將這種小RNAs分子命名為siRNAs和miRNA。Dicer有著較多的結構域,最先在果蠅中發現,并且在不同的生物體上表現出很高的保守性。
RNA干擾相關知識Core-RISC
Core RISC:是介導目標mRNA切割過程或者翻譯抑制的最小的RNA-蛋白質復合物。在人和果蠅身上發現的分子量少于200kDa的RISCs可能就是core RISC的重要代表。AGO蛋白質和Core RISC密切相關。
RNA干擾相關知識MicroRNA(miRNA)
MicroRNA(miRNA):是含有莖環結構的miRNA前體,經過Dicer加工之后的一類非編碼的小RNA分子(~21-23個核苷酸)。MiRNA,以及miRISCs(RNA-蛋白質復合物)在動物和植物中廣泛表達。因之具有破壞目標特異性基因的轉錄產物或者誘導翻譯抑制的功能,miRNA被認為在調控發
RNA干擾相關知識Small-interfering-RNA(siRNA)
Small interfering RNA(siRNA):是一種小RNA分子(~21-25核苷酸),由Dicer(RNAase Ⅲ家族中對雙鏈RNA具有特異性的酶)加工而成。SiRNA是siRISC的主要成員,激發與之互補的目標mRNA的沉默。
Argonaute(AGO)蛋白的結構和功能
Argonaute(AGO):一類龐大的蛋白質家族,是組成RISCs復合物的主要成員。AGO蛋白質主要包含兩個結構域:PAZ和PIWI兩個結構域,但具體功能尚不清楚。研究表明,PAZ結構域結合到siRNA 的3’的二核苷酸突出端;一些AGO蛋白質的PIWI結構域賦予slicer以內切酶的活性。PAZ
RNA干擾相關知識RISC-loading-complex(RLC)
RISC loading complex(RLC):是一種促使RISC形成的復合物。RLC有方向性地調節小RNA雙螺旋,為以后的RISC組裝作好鋪墊。siRISC loading complexes (siRLCs)在果蠅中研究最多。有研究者認為在果蠅中的siRLCs包含DCR2-R2D2異型二聚體
上海交大Hepatology文章解析癌轉移新機制
來自上海交通大學醫學院、上海人類基因組研究中心的研究人員在新研究中證實,Argonaute2通過上調黏著斑激酶(focal adhesion kinase,FAK)的表達,促進了肝癌轉移。相關研究論文發表在4月22日國際著名肝臟疾病雜志Hepatology(最新影響因子11.665)上。
RNA干擾(RNA-interference,RNAi)基礎知識(1)
Rnai最近由于RNA 干擾(RNA interference,RNA i)的發現使反義領域的研究增多。這種自然發生的現象最早是在秀麗線蟲中發現的(1),是序列特異性地使轉錄后的基因沉默的有力機制。由于最近兩年在 RNA i領域取得的進步,已經有許多這方面的綜述發表(2-4)。RNA 干擾是
RNA干擾(RNA-interference,RNAi)基礎知識(3)
SiRNASmall interfering RNA (siRNA):是一種小RNA分子(~21-25核苷酸),由Dicer(RNAase Ⅲ家族中對雙鏈RNA具有特異性的酶)加工而成。SiRNA是siRISC的主要成員,激發與之互補的目標mRNA的沉默。ShRNAshRNA 短發夾RNAshRNA
RNA干擾(RNA-interference,RNAi)基礎知識(2)
1RNA i的發現RNA i是在研究秀麗新小桿線蟲(C. elegans)反義RNA (antisenseRNA )的過程中發現的,由dsRNA 介導的同源RNA 降解過程。1995年,Guo等發現注射正義RNA (senseRNA )和反義RNA 均能有效并特異性地抑制秀麗新小桿線蟲par
細菌Argonaute蛋白生成和加載DNA引導鏈的分子機制
近期,《分子細胞》(Molecular Cell)雜志在線發表了中國科學院生物物理研究所王艷麗課題組及其合作者關于細菌Argonaute(Ago)蛋白獨立生成和加載DNA引導鏈的最新研究成果,題為Autonomous Generation and Loading of DNA Guides by
細菌Argonaute蛋白生成和加載DNA引導鏈的分子機制被發現
3月2日,《分子細胞》(Molecular Cell)雜志在線發表了中國科學院生物物理研究所王艷麗課題組及其合作者關于細菌Argonaute(Ago)蛋白獨立生成和加載DNA引導鏈的最新研究成果,題為Autonomous Generation and Loading of DNA Guides
科學家揭示外源核酸誘導的原核生物短Ago蛋白系統發揮功能的分子機理
RNA介導的轉錄后基因調控在生命個體抵御外源入侵的過程中起到重要作用。Argonaute(Ago)蛋白是存在于古菌、細菌和真核生物中的一種蛋白。它為非編碼小RNA提供錨位點,達到降解靶基因或者抑制翻譯的目的。對比真核生物的Ago,原核生物的Ago展現出多樣性,分為三個家族——長A型、長B型和短Ago
Nature:外源核酸誘導的原核生物短Ago蛋白系統發揮功能的分子機理
RNA介導的轉錄后基因調控在生命個體抵御外源入侵的過程中起到重要作用。Argonaute(Ago)蛋白是存在于古菌、細菌和真核生物中的一種蛋白。它為非編碼小RNA提供錨位點,達到降解靶基因或者抑制翻譯的目的。對比真核生物的Ago,原核生物的Ago展現出多樣性,分為三個家族——長A型、長B型和短A
RNA干擾主體實驗的相關介紹
siRNA表達載體構建好后,即可進行RNA干擾主體實驗。 RNA干擾主體實驗的重點在于: 成功將siRNA表達載體導入目的細胞 如果目的細胞的質粒轉染效率較低(低于70%),則應采用腺病毒或慢病毒載體,利用病毒載體的高感染率、高表達特性,更好地開展RNA干擾主體實驗。 設置好分組和對照
吳立剛課題組Nature子刊發布RNAi新工具
來自中科院上海生命科學研究院的研究人員報告稱,他們設計出了一種替代性的小干擾RNA(small interfering RNA,siRNA)前體,將之命名為saiRNA (single-stranded, Argonaute 2 (Ago2)-processed interfering RNA)
韓春雨發表的NgAgo又有新功能!
CRISPR/Cas 系統具有編輯 DNA 和 RNA 靶標的強大能力。然而,CRISPR/Cas 系統對特定識別位點、PAM 的需求限制了其在基因編輯中的應用。一些 Argonaute (Ago) 蛋白在 5' 磷酸化或羥基化引導 DNA (gDNA) 的引導下具有核酸內切酶功能。Ng
我國學者揭示Agos蛋白指導導向DNA鏈切割靶標DNA鏈機制
近日,《Proceedings of the National Academy of the Sciences of the United States of America,PNAS》雜志在線發表題為“Two symmetric arginine residues play distinct
研究揭示Agos蛋白指導導向DNA鏈切割靶標DNA鏈的機制
2018年12月27日,《美國國家科學院院刊》(PNAS)雜志在線發表題為Two symmetric arginine residues play distinct roles in Thermus thermophilus Argonaute DNA guide strand-mediated
最新發現兩種腸道微生物的Ago酶,能夠常溫切割DNA
2019年7月30日,中科院動物研究所王皓毅團隊和中科院北京生命科學研究院趙方慶團隊合作,在 Cell Discovery 雜志發表了題為:Argonaute proteins from human gastrointestinal bacteria catalyze DNA-guided cl
RNA干擾的體外轉錄的相關介紹
以DNA Oligo為模版,通過體外轉錄合成siRNAs,成本相對化學合成法而言比較低,而且能夠比化學合成法更快的得到siRNAs。不足之處是實驗的規模受到限制,雖然一次體外轉錄合成能提供足夠做數百次轉染的siRNAs,但是反應規模和量始終有一定的限制。而且和化學合成相比,還是需要占用研究人員相
RNA干擾技術(RNA-interference,RNAi)
1995年,康乃爾大學的Su Guo博士在試圖阻斷秀麗新小桿線蟲(C. elegans)中的par-1基因時,發現了一個意想不到的現象。她們本是利用反義RNA技術特異性地阻斷上述基因的表達,而同時在對照實驗中給線蟲注射正義RNA(sense RNA)以期觀察到基因表達的增強。但得到的結果
RNA干擾的簡介
RNAi研究取得了突破性進展,被《Science》雜志評為2001年的十大科學進展之一,并名列2002年十大科學進展之首。由于使用RNAi技術可以特異性剔除或關閉特定基因的表達,所以該技術已被廣泛用于探索基因功能和傳染性疾病及惡性腫瘤的基因治療領域。