解析斑鱉的全基因組序列及其適應性進化基礎
斑鱉（Rafetus swinhoei）是目前地球上現存體型最大的鱉類物種，其背甲長度可達1.5米、體重可達115公斤。此外，斑鱉也是全球目前最瀕危的龜鱉類物種。在2019年初，全球已經明確記錄的斑鱉個體僅僅只有4只。然而，2019年4月13日，我國的雌性個體意外死亡（這也是當時全球唯一確定性別的雌性斑鱉個體），令人十分惋惜。 為了避免雌性斑鱉基因組遺傳信息的永遠丟失，也為了推動斑鱉的調查和保護工作的繼續，中國科學院昆明動物研究所和長沙生態動物園研究人員在雌性死亡斑鱉的病理解剖檢查過程中采集了該個體的組織樣品，通過結合Nanopore長讀長序列、BGI-seq短讀長序列以及染色體構象捕獲技術（Hi-C）等測序數據，成功組裝出了該個體染色體水平的高質量參考基因組序列。組裝的基因組大小為2.24Gb，Scaffold N50長度為131.98Mb。通過聯合采用從頭預測、同源比對以及轉錄本輔助注釋等策略成功預測出了26646個高......閱讀全文
解析斑鱉的全基因組序列及其適應性進化基礎
斑鱉（Rafetus swinhoei）是目前地球上現存體型最大的鱉類物種，其背甲長度可達1.5米、體重可達115公斤。此外，斑鱉也是全球目前最瀕危的龜鱉類物種。在2019年初，全球已經明確記錄的斑鱉個體僅僅只有4只。然而，2019年4月13日，我國的雌性個體意外死亡（這也是當時全球唯一確定性別
斑鱉的全基因組序列解析：其與中華鱉親緣關系密切
記者12日從中國科學院昆明動物研究所獲悉，該所和長沙生態動物園合作，成功組裝出了全球最瀕危龜鱉類物種斑鱉的高質量參考基因組序列，并解析其適應性進化基礎。研究人員發現，斑鱉與中華鱉親緣關系密切，然而在54.4百萬年前開始分道揚鑣。 斑鱉是目前地球上現存體型最大的鱉類物種，其背甲長度可達1.5米、
全基因組測序揭示喀斯特植物適應性進化機制
中國南方喀斯特起源古老、分布廣泛，被認為是生態與進化研究的“天然實驗室”。中國科學院華南植物園研究員康明團隊等完成了首個喀斯特植物懷集報春苣苔的全基因組測序。相關研究近日在線發表于《新植物學家》。 喀斯特植物是我國植物多樣性和特有性的重要組成部分，但迄今為止對喀斯特植物的多樣性起源和適應性進
花椒基因組進化和適應性演化研究獲進展
中國熱帶農業科學院香料飲料研究所（以下簡稱香飲所）熱帶香辛飲料種質資源研究室在中國花椒基因組進化和適應性演化研究方面取得重要進展。研究團隊在實現竹葉花椒和紅花椒基因組的高質量拼接和染色體錨定的基礎上，揭示了花椒獨特的花器官退化、利己素合成和適應性表型創新的遺傳基礎，表明花椒基因組進化和表型創新與晚新
研究揭示植物基因組倍性變化和適應性進化機制
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/518047.shtm
研究揭示植物基因組倍性變化和適應性進化機制
日，中山大學生命科學學院教授施蘇華、副教授何子文團隊以紅樹植物杯萼海桑所在支系為對象，全面分析基因組進化軌跡，探索倍性變化（多倍化-重二倍化過程）在基因組進化中的作用，研究全球氣候變化背景下的植物適應性進化機制。相關成果發表于《自然-通訊》。 該研究基于高質量的基因組數據，使用共線性分析、非同
基因組內簡單重復序列在對蝦適應性進化中的作用
近日，由中國科學院海洋研究所李富花課題組主導完成的科研論文Simple sequence repeats drive genome plasticity and promote adaptive evolution in penaeid shrimp，在Communications Biolog
植物適應性進化研究獲進展
“進化是否可以預測”是生物學中的一個基本科學問題。大量觀察和研究表明，不同物種或者同一物種的不同群體，可以在一定條件下獨立進化出相似的表型。這種現象稱為“平行進化”。由于探究同樣的表型變異是否由同一個或同一群基因控制，可以在一定程度獲取進化可預測性（predictability）的信息。因此，關
百歲蘭基因組和適應性進化機制研究新進展
百歲蘭（Welwitschia mirabilis）又名千歲蘭，是買麻藤類單種科百歲蘭科孑遺植物，系裸子植物中唯一的草狀木本，是罕見的植物。化石記錄百歲蘭曾廣泛分布在巴西、葡萄牙等地。隨著大陸板塊分裂，氣候驟變，自然居群幸存于如今的安哥拉與納米比亞沙漠。百歲蘭是《瀕危野生動植物種國際貿易公約》（
專家破解大白鯊全基因組－發現抗癌進化機制
香港《星島日報》報道，日前，一個國際科研團隊破解了大白鯊的全基因組，發現其依靠在進化過程中產生的基因序列變化，獲得了一種抗癌能力，壽命可長達七十歲。 資料圖：大白鯊。 美國諾瓦東南大學和康奈爾大學的研究人員18日在美國《國家科學院學報》發表論文說，大白鯊體型龐大，身長五至六米，體重可超過三噸
基因組測序揭示龜鱉軀體發育及進化機制
龜鱉類有著漫長且成功的演化歷史，是形態學上最為特化的爬行動物之一。全球共有龜鱉類動物13科、89屬、270余種，被分為兩個特征明確的支系 ——側頸龜亞目和曲頸龜亞目。中華鱉和綠海龜分別是曲頸龜中鱉類和海龜類的典型代表，對其進行基因組學研究，有助于理清龜鱉類系統發育及其軀體進化機制。 日
游隼和獵隼基因組研究成果發表
獵隼 游隼 3月25日，由英國卡迪夫大學、深圳華大基因研究院等聯合完成的游隼、獵隼基因組研究成果，在《自然—遺傳學》雜志上在線發表。據悉，這是猛禽基因組成果首次被發表。該研究為科研工作者從全基因組水平探究游隼和獵隼的捕食性提供了一個全新視角，對深入探究游隼和獵隼的起源、進化及其他生物學特性具
世界首次發表猛禽基因組成果
由英國卡迪夫大學、華大基因等聯合完成的游隼、獵隼基因組研究成果，近日在《自然》雜志在線發表。該研究為科研工作者從全基因組水平探究游隼和獵隼的捕食性提供了一個全新的視角，對深入探究游隼、獵隼的起源、進化及其他生物學特性研究具有重要價值。這是世界上首次猛禽基因組成果被發表。 游隼和獵隼都屬于猛
真骨魚類全基因組加倍后重復基因進化研究引起關注
基因和基因組加倍在進化過程中起了重要作用。1970年，Ohno提出脊椎動物進化早期的兩次基因組加倍導致了脊椎動物基因組大小和復雜性的增加，同時也為脊椎動物的進化多樣性提供了基礎。大量的比較基因組學研究顯示，真骨魚類還經歷了第三次基因組加倍，這一加倍被稱為魚類特有的基因組加倍。然而，在物種形成過程
昆明動物所等揭示動物適應性進化的第二套基因組學機制
動物適應青藏高原極端環境的過程中，逐漸形成了耐低氧、耐高寒、耐粗飼料等復雜性狀的適應性。以往針對高原適應遺傳機制的研究大多數局限在動物自身遺傳物質的變異，很少了解與動物宿主共進化的第二套基因組（即腸道微生物組）的重要貢獻，特別是能量代謝方面。 中國科學院昆明動物研究所研究員施鵬領導的團隊和中國
什么是基因組進化？
基因組不僅僅是生物體基因的總和，基因組還含有其它可以考慮特定基因及其產物的特征。復制在基因組的塑造過程中起了重要作用。復制的范圍包括短串聯重復序列的延伸、基因簇的復制、整個染色體甚至整個基因組的復制。這種復制可能是創造遺傳新性狀的基礎。
基因組的進化特征
基因組不僅僅是生物體基因的總和，基因組還含有其它可以考慮特定基因及其產物的特征。復制在基因組的塑造過程中起了重要作用。復制的范圍包括短串聯重復序列的延伸、基因簇的復制、整個染色體甚至整個基因組的復制。這種復制可能是創造遺傳新性狀的基礎。
中國學者解析甜瓜全基因組變異圖譜及進化機制
近日，Nature Genetics線發表了中國農科院與其它機構合作完成的兩篇重量級文章，文章分別構建了甜瓜全基因組變異圖譜和解析了西瓜果實品質性狀進化分子機制。 鑒于該兩項研究的重要性，Nature Genetics雜志還同期發表了題為“Sweet genes in melon and w
我國科學家對桃進行全基因組重測序－繪制進化路線
我們平時吃的桃是如何進化而來的？近日，一項針對桃的全基因組重測序研究揭開了這一謎底。該研究對84份桃種質進行重測序，在全基因組水平上繪制了從光核桃到普通桃的進化路線，并鑒定了與人工選擇相關的候選基因，揭示了桃的進化歷史及人類活動對果樹的影響。 這項研究由中國農業科學院鄭州果樹研究所王力榮研究團
大白鯊如何獲得抗癌能力的？全基因組破譯發現進化機制
一個國際科研團隊破解了大白鯊的全基因組，發現這種處于海洋食物鏈頂端的大型脊椎動物在進化過程中產生的基因序列變化使它獲得了一種抗癌能力，其壽命可長達70歲。 領銜該研究的美國諾瓦東南大學和康奈爾大學研究人員18日在美國《國家科學院學報》上發表論文說，大白鯊體型龐大，身長5到6米，體重可超3噸，壽
大規模釀酒酵母適應性進化研究揭示癌癥演變
微小的基因突變也可能導致細胞系統失控。然而，并非所有突變都是壞的，適應性進化過程的選擇突變，反而能促進酵母種群和癌癥快速而無節制的生長。 癌細胞克隆繁殖時，許多突變會傳給子代細胞。一些突變基因是“搭車”湊熱鬧的，基本無害，另一部分“老司機”突變與腫瘤生長密切相關。 “老司機們”是癌癥潛在的
研究構建藏族人群全基因組水平的適應性遺傳變異圖譜
8月7日，《國家科學評論》（National Science Review）在線發表了中國科學院上海營養與健康研究所——馬普計算生物學研究所徐書華團隊的研究成果“Prioritizing natural selection signals from the deep-sequencing gen
華大基因、卡迪夫大學聯合發表Nature子刊新文章
來自英國卡迪夫大學、深圳華大基因研究所等處的研究人員近日完成了對游隼和獵隼的基因組測序，提供了關于捕食生物生活方式演變的一些新認識，相關論文“Peregrine and saker falcon genome sequences provide insights into evolution o
OPGEN全基因組圖譜應用系列——鞭蟲全基因組測序
鞭蟲是一種常見的土壤傳播寄生蟲，地理分布廣，感染率高，寄生于人體盲腸，導致人體慢性感染，對人類危害巨大。鞭蟲的全基因組測序研究由著名的桑格研究院（Wellcome Trust Sanger Institute）完成，發表在世界頂級期刊《Nature Genetics》上。該研究通過對2種不同
植物所等在植物適應性進化研究中取得進展
在物種形成或物種入侵到新生境時，往往只涉及祖先物種里的少數群體或個體，從而導致形成的新物種或入侵群體的遺傳多樣性下降，即所謂“瓶頸效應”。盡管瓶頸效應使得新物種或入侵群體遺傳多樣性很低，但這些群體仍能夠適應新生境。這種很低的遺傳多樣性和很強的適應能力之間的巨大反差被稱為“生物入侵的遺傳悖論”。對
達爾文進化論中的適應性包括哪些方面
達爾文進化論的主要內容達爾文進化論主要包括四個子學說：一，一般進化論：物種是可變的，現有的物種是從別的物種變來的，一個物種可以變成新的物種。這一點，早已被生物地理學、比較解剖學、比較胚胎學、古生物學和分子生物學等學科的觀察、實驗所證實，我們現在甚至可以在實驗室、野外直接觀察到新物種的產生。所以，這是
武漢植物園在水生單子葉植物的起源和演化研究中取得進展
澤瀉亞綱是水生單子葉植物中最為原始的類群之一，全球性廣泛分布，在研究被子植物的系統發育、地理分布格局成因中起著重要作用。 中科院武漢植物園水生植物適應性進化學科組博士研究生陳凌云在王青鋒研究員的指導下，通過細胞核、葉綠體和線粒體部分基因的測序，結合化石證據和系統進化分
基因組研究揭示駱駝沙漠適應性機制
沙漠生存動物能忍受普通生物不能容忍的高溫、缺水的環境，過去人們對動物的沙漠適應性基因機制知之甚少。近日，內蒙古農業大學、深圳華大基因研究院以及沙特阿拉伯阿卜杜拉國王科技城國家生物技術中心等多家單位的科研人員成功破譯了駱駝科的三個物種：雙峰駝、單峰駝、羊駝的基因組序列，首次從基因層面剖析了駱駝科的
科學家構建藏族人群全基因組水平的適應性遺傳變異圖譜
8月7日，《國家科學評論》（National Science Review）在線發表了中國科學院上海營養與健康研究所——馬普計算生物學研究所徐書華團隊的研究成果“Prioritizing natural selection signals from the deep-sequencing gen
研究發現簡單重復序列對蝦適應性進化的關鍵作用
??3月9日，記者從中國科學院海洋研究所獲悉，由該所李富花課題組主導完成的科研論文《簡單重復序列促進對蝦基因組可塑性和適應性進化》在Nature子刊《通訊-生物學》（《Communications Biology》）在線發表。該研究成果為闡明生物體內SSR的功能和甲殼動物對環境的適應進化研究提供了新