人腦多區域時空發育轉錄組圖譜獲解析
科學家通過單細胞和時空轉錄組研究，首次解析迄今為止跨時間點最廣（GW6-GW23）、面積最大（最大4cm x 3cm）的人腦多區域時空發育轉錄組圖譜，為解碼人腦發育及區域特化研究提供了新見解。日前，相關研究成果發表在《細胞》上。 腦是人類最復雜和神秘的器官。解剖學上，腦可以被劃分為不同的區域，包括端腦、間腦、中腦以及小腦等。不同腦區具有特殊的輸入輸出連接，執行各種重要的功能。人腦“黑匣子”的奧秘讓整個世界為之重視并探索，然而，在人類腦發育過程中，區域特化的研究，腦細胞類型的變化特征和空間分布特點仍面臨許多難關。 為深入研究發育中人腦神經元的區域特征，研究者對33個人類胚胎多個發育時間點（GW6 -GW23）、不同腦區進行單細胞轉錄組研究，鑒定出免疫細胞、神經前體細胞、谷氨酸能神經元、GABA能神經元、少突膠質細胞前體細胞、星形膠質細胞前體細胞、中胚層來源細胞等19個主要亞型，繪制了人腦發育中的動態變化圖譜。由于空間組織對......閱讀全文
AI揭示影響人腦發育基因組突變
科技日報北京2月21日電 美國研究人員使用人工智能（AI）模型揭示了可能影響人類認知進化的基因組突變。這項人類基因組學的開創性研究可能會促進發現復雜腦部疾病的新療法。該研究發表在新一期的《科學進展》上。 認知是人類進化的一個決定性特征，使人類有別于其他靈長類動物。盡管自人類與黑猩猩分道揚鑣以來發生
AI揭示影響人腦發育基因組突變
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494310.shtm 科技日報北京2月21日電?（記者張夢然）美國研究人員使用人工智能（AI）模型揭示了可能影響人類認知進化的基因組突變。這項人類基因組學的開創性研究可能會促進發現復雜腦部疾病的新療法
研究揭示人胚胎發育轉錄組
原始態（Na?ve state）多能性相關研究是近年來干細胞及重編程領域的研究熱點和難點，與傳統的primed狀態相比，Na?ve態捕獲了體內植入前胚胎發育的階段，具有更強的可塑性，在早期胚胎發育研究及未來臨床應用中具有更廣闊的前景。在近10年的研究中，科學家們取得了一系列重要進展，已建立了較為
光線強弱影響人腦發育
據美國科學促進會（AAAS）網站報道，最新科學研究發現，生活在不同緯度的人腦袋大小有較大差異，而生活在地球極地附近的人腦袋最大。 長期以來，相比地球的赤道地區，地球極地的白天越來越短、越來越暗，因此，生活在地球最北部和最南部地區的人看上去進化了許多貓頭鷹的特質。研究
靈長類原腸胚期至早期器官發育轉錄組圖譜繪制
安徽醫科大學國家衛生健康委配子及生殖道異常研究重點實驗室教授蔣祥祥，與中科院動物研究所王紅梅、郭帆團隊，美國得克薩斯大學西南醫學中心吳軍團隊合作，繪制了食蟹猴CS8-CS11時期（E20-E29）胚胎的單細胞轉錄組圖譜。相關研究成果近日發表于《自然》。 上世紀早期，科學家將人類胚胎發育的前60
成都生物所青稞籽粒發育轉錄組研究取得新進展
青稞（Hordewn vulgare L. var. nudum Hook, f. 2N=14），即裸大麥，屬于禾本科小麥族大麥屬，是大麥的變種之一，因其在成熟時穎果易與稃分離而得名。青藏高原藏區人民把裸大麥叫做青稞。青稞是青藏高原藏區的主要農作物，是重要的口糧，也是重要的食品加工原料及牲畜飼料
花生轉錄組denovo測序揭示果針發育相關的功能基因
近日，由廣東省農業科學院作物研究所梁炫強研究員、陳小平博士，山東省農業科學院花生研究所所長禹山林研究員及國際半干旱熱帶作物研究所(ICRISAT)基因組中心負責人Rajeev Kumar Varshney等完成的花生轉錄組de novo測序的結果發表于Plant Biotechnology
焦建偉研究組及合作團隊解析人腦發育時空圖譜及規律
作為人類最復雜的器官，腦在解剖學上被劃分為不同的區域，包括端腦（主要由新皮層（Cor）構成），間腦（Dien），中腦（Mid）以及小腦（Cere）等。這些不同腦區具有特殊的輸入輸出連接，發揮各種重要的功能。在人腦發育過程中，通過內在基因程序產生了復雜的細胞類型。在這些細胞類型中，有些已經有了明確
轉錄組測序和全轉錄組測序的區別
全轉錄組廣義上是指細胞在特定狀態下所能轉錄出來的?所有RNA的總和，包括mRNA和非編碼RNA?。借助高通量測序技術，可以全面獲取樣本中轉錄產物信息，結合競爭性內源RNA ( ceRNA)機制， 進行聯合分析，深入挖掘轉錄水平調控網絡。轉錄組測序的研究對象為特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有
光線強弱影響人腦生長發育－極地附近人腦袋最大
據美國科學促進會(AAAS)網站7月26日報道，最新科學研究發現，生活在不同緯度的人腦袋大小有較大差異，而生活在地球極地附近的人腦袋最大。 長期以來，相比地球的赤道地區，地球極地的白天越來越短、越來越暗，因此，生活在地球最北部和最南部地區的人看上去進化了許多貓頭鷹的特質。研究人員通過對世界
轉錄組測序原理
而轉錄組測序即是利用高通量測序技術，將細胞或組織中的全部或部分mRNA, miRNA, lnc RNA 進行測序分析的技術。通過RNA-seq，也就是轉錄組測序，可以幫助我們了解各種比較條件下所有基因的表達差異包括：正常組織與腫瘤組織；藥物治療前后的表達差異；發育過程中，不同發育階段，不同組織的表達
轉錄物組的定義
轉錄組也稱“轉錄物組”。是一個基因組轉錄的所有RNA。
轉錄組高通量測序
（第二代高通量測序技術-454） 轉錄組即特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和，是研究細胞表型和功能的一個重要手段。與基因組不同的是，轉錄組的定義中包含了時間和空間的限定。同一細胞在不同的生長時期及生長環境下，其基因表達情況是不完全相同的。羅氏GS-FLX-Titaniu
轉錄物組的定義
轉錄組也稱“轉錄物組”。是一個基因組轉錄的所有RNA。
轉錄組高通量測序
（第二代高通量測序技術-454） 轉錄組即特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和，是研究細胞表型和功能的一個重要手段。與基因組不同的是，轉錄組的定義中包含了時間和空間的限定。同一細胞在不同的生長時期及生長環境下，其基因表達情況是不完全相同的。羅氏GS-FLX-Titanium第二代
轉錄組高通量測序
（第二代高通量測序技術-454） 轉錄組即特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和，是研究細胞表型和功能的一個重要手段。與基因組不同的是，轉錄組的定義中包含了時間和空間的限定。同一細胞在不同的生長時期及生長環境下，其基因表達情況是不完全相同的。羅氏GS-FLX-Titaniu
轉錄組高通量測序
（第二代高通量測序技術-454） 轉錄組即特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和，是研究細胞表型和功能的一個重要手段。與基因組不同的是，轉錄組的定義中包含了時間和空間的限定。同一細胞在不同的生長時期及生長環境下，其基因表達情況是不完全相同的。羅氏GS-FLX-Titaniu
轉錄組測序流程步驟
以真核轉錄組測序為例，實驗流程為總RNA提取-mRNA分離-建庫試劑-定量-文庫回收-橋式擴增-上機測序；項目分析流程為數據產出數據=數據去雜-轉錄組拼接-SSR分析及SNP分析-基因功能注釋-基因表達差異分析-差異基因表達模式聚類-差異基因富集分析。
空間轉錄組和單細胞轉錄組測序聯合應用的典型案例
單細胞轉錄組測序技術的如火如荼，伴隨著空間轉錄組測序技術的蓬勃發展，可以看到，在現有的高通量檢測技術領域，這兩種技術已為科學研究的發展提供了前所未有的技術支撐。從2019年單細胞多組學被評為《Nature Methods》年度技術進展，到2020年空間轉錄組技術也被評為年度技術進展，相信在接
科學家解析人腦發育時空圖譜及規律
作為人類最復雜的器官，腦在解剖學上被劃分為不同的區域，包括端腦【主要由新皮層（Cor）構成】、間腦（Dien）、中腦（Mid）和小腦（Cere）等。這些不同腦區具有特殊的輸入輸出連接，發揮不同的功能。在人腦發育過程中，通過內在基因程序產生了復雜的細胞類型。在這些細胞類型中，有些已有明確的特征，但
轉錄組測序與轉錄表達譜測序的異同
轉錄組測序可以得到特定條件下所有mRNA轉錄本的豐度信息，從而發現新的轉錄本和可變剪接體基因表達譜(gene expression profile)：指通過構建處于某一特定狀態下的細胞或組織的非偏性cDNA文庫,大規模cDNA測序,收集cDNA序列片段、定性、定量分析其mRNA群體組成,從而描繪該特
轉錄物組學的定義
中文名稱轉錄物組學英文名稱transcriptomics定 義研究基因組轉錄產生的全部轉錄物的種類、結構和功能的學科。應用學科遺傳學（一級學科），總論（二級學科）
轉錄物組學的定義
中文名稱轉錄物組學英文名稱transcriptomics定 義研究基因組轉錄產生的全部轉錄物的種類、結構和功能的學科。應用學科遺傳學（一級學科），總論（二級學科）
全轉錄組測序文章
研究背景? ? ?? 長鏈非編碼RNA（Long noncoding RNA，lncRNA）普遍被認為是一類不能編碼蛋白的長鏈RNA。由于其序列較長，所以可以有較大的潛力形成多種復雜構象，從而通過不同生物學途徑發揮其作用。此外，由于其不具備蛋白編碼能力，因此此類RNA也主要由其堿基序列形成的高級
遺傳發育所發現調控擬南芥分枝和種子角果發育的轉錄因子
Dof轉錄因子家族是一類植物特有的轉錄因子家族，它們參與調控了多種生長發育過程。在以前的研究中發現，大豆GmDOF4和GmDOF11可提高種子的脂肪酸含量并增加種子千粒重。本研究篩選了在擬南芥種子/花中高表達的Dof轉錄因子AtDOF4.2并進一步研究其功能。 AtDOF4.
全基因組及轉錄組測序案例分析
案例：應用全基因組測序和 RNA 測序來描繪常見的變異型免疫缺陷綜合癥（CVIDs）的基因圖譜 背景：常見的變異型免疫缺陷綜合癥（CVIDs）是機體免疫應答反應中不能產生抗體的最主要原因。CVIDs 變異度很高，大概 5% 的病人是由基因改變引起的。 目的：利用 Illumina HiSeq25
心理所發表人腦連接組學評述論文
隨著世界范圍內“腦計劃”研究的大范圍開展，宏觀尺度上的腦連接組學或腦網絡科學所面臨的挑戰越來越明顯。當前的技術非常難于為“建模活體人腦結構－功能”提供穩定、可靠、精確而完整的實驗數據，因此基于數學物理模型的計算神經科學就非常重要。為計算建模提供高精度的人腦多模態成像數據是當前不同尺度下人腦連接組
轉錄組的重編寫：RNA編輯
前 言 基因的功能探索是生命科學研究的永恒主題。近幾年以CRISPR-Cas9技術的發展讓直接在高等生物體內進行基因的功能研究成為可能。但除了DNA之外， DNA的轉錄產物--RNA在生命活動中也發揮著極其重要的作用，且與癌癥等多種疾病的發生密切相關。因此，對RNA進行功能研究和錯誤RNA
轉錄組的重編寫：RNA編輯
基因的功能探索是生命科學研究的永恒主題。近幾年以CRISPR-Cas9技術的發展讓直接在高等生物體內進行基因的功能研究成為可能。但除了DNA之外， DNA的轉錄產物--RNA在生命活動中也發揮著極其重要的作用，且與癌癥等多種疾病的發生密切相關。因此，對RNA進行功能研究和錯誤RNA的糾正，成為了
空間轉錄組測序樣本準備指南
一、外泌體研究熱度持續攀升 外泌體（exosome）是活細胞分泌的30-200nm的囊泡，在電鏡下具有非常明顯單層膜結構，通常為茶托型或一側凹陷的半球形。其主要來源于細胞內溶酶體微粒內陷形成的多囊泡體，經多囊泡體外膜與細胞膜融合后釋放到胞外基質中。多種細胞在正常及病理狀態下均可分泌外泌體，