測序技術發展過快？基因組學千萬大獎告吹
X獎基金會近日決定取消了獎金高達1000萬美元的基因組學Archon X獎(Archon Genomics X Prize)，因為基因組測序成本的直線下降已使得競爭毫無意義。 X獎基金會的主席兼CEO Peter Diamandis在上周四宣布了關閉競賽的決定。他表示，這是因為如今每個基因組的測序費用不到5,000美元，并能在幾天內完成。“我們認為競賽不能激勵技術改變，而這一目標正是我們的主席Craig Venter博士、我們的贊助商Stewart and Marilyn Blusson以及X獎委員會的初衷。基于這一理由，我們決定有史以來第一次取消X獎。” 基因組學X獎致力于推動測序技術改進 基因組學X獎于2006年啟動，旨在刺激測序創新，其目標是在10天內對100個人類基因組進行測序，每個基因組的費用控制在1萬美元以下。之后，目標調整為對100個百歲老人進行測序，以便創建出醫療級別的基因組......閱讀全文
解碼“基因組學之父”桑格：測序，測序，測序
“桑格當之無愧地被稱為‘基因組學之父’，他的工作為人類讀取和理解基因代碼奠定了基礎，徹底變革了生物學并極大促進了當今的醫學發展。”、 有一天，65歲的英國生物化學家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的試驗，轉身走出實驗室，宣布自己正式退休。那一年是1983
－Science：宏基因組學測序技術
宏基因組學技術(Metagenomic approaches)正快速拓寬我們對微生物代謝能力(microbial metabolic potential)的認識。 長期以來，對微生物(microorganism)功能開展的研究主要依賴的都是以在實驗室里培養的單一物種(individua
采用新一代測序法的宏基因組學研究
直到不久之前，宏基因組學研究還因為高費用、低流通量以及在應用Sanger-方法克隆步驟中出現的結果不準確而受到限制。而今借助于新一代序列測定方法即可獲得宏基因組樣品全面的圖像。宏基因組學研究（metagenomics）是指研究一種復雜微生物群體在其生命空間的全部基因信息。研究的主要目的在于刻畫
測序技術發展過快？基因組學千萬大獎告吹
X獎基金會近日決定取消了獎金高達1000萬美元的基因組學Archon X獎(Archon Genomics X Prize)，因為基因組測序成本的直線下降已使得競爭毫無意義。 X獎基金會的主席兼CEO Peter Diamandis在上周四宣布了關閉競賽的決定。他表示，這是因為如今
表觀基因組學研究指南（一）
今年九月，對于基因組研究者們來說是一個具有紀念意義的月份，因為美國人類基因組研究院(NHGRI)資助的ENCODE項目在Nature，Genome Biology，Genome Research等雜志上公布了三十多份論文，還有在Science，Cell，以及the Journal of Bi
表觀基因組學研究指南（三）
今年九月，對于基因組研究者們來說是一個具有紀念意義的月份，因為美國人類基因組研究院(NHGRI)資助的ENCODE項目在 Nature，Genome Biology，Genome Research等雜志上公布了三十多份論文，還有在Science，Cell，以及the Journal
基因組學:－跨越癌癥研究國界
1982年11月，在尼日利亞海軍醫院外足球場上踢球的一名軍官，突然摔倒死亡。這名男子被帶到急診室時，當時還是一個新人的 Olufunmilayo Funmi Olopade醫生正在值班。“我們搞不明白為什么他死亡，這讓我感到震驚，從那時開始我意識到，我需要做更多的工作來理解和幫助人們。”Ol
作物基因組學研究進展
摘要：農作物基因組學研究的發展，對于有效利用現代分子生物學手段進行物種的遺傳改良發揮了重要作用。隨著測序技術的發展，已經實現對重要農作物，如水稻、小麥、玉米、大豆、油菜、棉花、蔬菜等作物基因組的測序或重測序，在此基礎上完成對控制重要農藝性狀基因的克隆和鑒定。本文綜述了２０１７年度主要農作物基因組
全基因組測序的竹亞科及生物學性狀的比較基因組學研究
禾本科（禾草）是被子植物最大科之一，約有12000種，是水稻、小麥、玉米等人類糧食和牲畜飼料的主要來源，也為人類提供了加工淀粉、制糖、釀酒、造紙、編織和建筑等方面的重要原料。同時，禾本科又是植物遺傳學和基因組學研究的模式類群。竹亞科（竹子）是禾本科的12個亞科之一，與早熟禾亞科、稻亞科組成BOP
新一代測序將如何改變法醫基因組學
Bruce Budowle博士是北德克薩斯大學健康科學中心(UNTHSC)應用遺傳學研究所的執行主任。自2009年成立以來，該研究所集中了一大批致力于完善遺傳學方法的知名科學家，以增強幾個研究領域，包括法醫DNA。在UNTHSC的法醫科學項目(全美只有14個)
宏基因組學技術測序木乃伊的肺結核基因組
來自華威大學的研究者使用宏基因組學技術發現215年之久的木乃伊的肺結核基因組。 由Mark Pallen帶領的研究團隊試圖用技術來發現組織學標本中的肺結核的DNA。 宏基因組學是一種從樣本中檢測DNA序列的技術，并且樣本不需要培養或擴增。這種方法避免了與細菌培養或DNA擴增
基因組學推進腫瘤研究未來發展
——訪億明達腫瘤業務營銷副總裁約翰·萊特 基因組學正在改變腫瘤研究，其最終目標是推進癌癥的診斷、治療、監控及最終的篩查方式。 癌癥通常按照形態進行分類，這指的是病理學家在顯微鏡下看到的內容。“如今，癌癥分類依據已經開始從形態特征轉變為更有效的治療方式，其中的主要轉變在很大程度上歸功于基因組研
作物基因組學研究進展（三）
⑸棉花基因組研究棉花是重要的天然纖維和油料作物，也是研究多倍體進化和作物馴化的重要模式植物。南京農業大學張天真等課題組通過將栽培棉與野生棉對比，繪制出了棉花表觀遺傳基因的“甲基化基因圖譜”，對野生棉和栽培棉之間超過１２００萬個的差異甲基化胞嘧啶進行分析，鑒定出５１９個表觀等位基因（ｅｐｉａｌｌｅｌｅ
作物基因組學研究進展（一）
作物基因組學研究進展農作物基因組學研究的發展，對于有效利用現代分子生物學手段進行物種的遺傳改良發揮了重要作用。隨著測序技術的發展，已經實現對重要農作物，如水稻、小麥、玉米、大豆、油菜、棉花、蔬菜等作物基因組的測序或重測序，在此基礎上完成對控制重要農藝性狀基因的克隆和鑒定。本文綜述了２０１8年度主要農
作物基因組學研究進展（二）
⑵小麥基因組研究小麥是全球最重要的糧食作物之一，小麥的穩產和增產對我國乃至全世界糧食安全的影響舉足輕重。近年來由于全球氣候變化、環境變化的影響，小麥生產面臨嚴峻的挑戰，對于小麥的育種和品種改良工作提出了新的要求。普通小麥（Ｔｒｉｔｉｃｕｍ ａｅｓｔｉｖｕｍ Ｌ．）是３個不同亞基因組形成的異源
三代測序的DNA提取和宏基因組學分析（一）
改進的人類腸道微生物組的高分子量DNA提取，納米孔測序和宏基因組學裝配Improved high-molecular-weight DNA extraction,nanopore sequencing and metagenomicassembly from the human gut microb
三代測序的DNA提取和宏基因組學分析（二）
優勢與局限這種DNA提取方法已被優化用于從人類糞便樣本中提取高分子量(HMW)DNA，但也已在模擬微生物群落和細菌分離株上得到驗證。我們希望該方案可以適用于其他樣品類型，盡管可能需要對裂解前和裂解后步驟進行修改以解釋特定于樣品的制備和污染物清除的問題是必要的。機械裂解方法（如珠子擊打）仍然是連續裂解
雜交稻基因組學研究獲進展
中科院上海生科院植物生理生態研究所韓斌院士課題組聯合中國水稻所楊仕華等團隊，在雜交稻基因組學及雜種優勢遺傳機制研究中獲重要進展，2月5日，相關成果在線發表于《自然—通訊》雜志。 據介紹，雜交水稻育種技術的成功是我國近幾十年來取得的一項重要科技成就。伴隨著汕優63、兩優培九等一大批高產雜交稻品種
研究指出基因組學引領生物育種變革
記者從近日舉行的第五屆國際農業基因組會議暨深圳國際食品谷研討會上獲悉，現代農業研究已邁入生物組學大數據時代，特別是基因組學及其衍生技術在生物育種中發揮著重要的引領作用。 基因組學是對生物體所有基因進行集體表征、定量研究及不同基因組比較研究的一門交叉生物學學科。基因組學主要研究基因組的結構、功能
雜交稻基因組學研究獲進展
中科院上海生科院植物生理生態研究所韓斌院士課題組聯合中國水稻所楊仕華等團隊，在雜交稻基因組學及雜種優勢遺傳機制研究中獲重要進展，2月5日，相關成果在線發表于《自然—通訊》雜志。 據介紹，雜交水稻育種技術的成功是我國近幾十年來取得的一項重要科技成就。伴隨著汕優63、兩優培九等一大批高產雜交稻品種
家犬基因組學研究獲新進展
科學界對于家犬的起源和馴化一直爭議不斷。近日，中科院院士張亞平帶領團隊發現，家犬中亞起源的假說與基于全基因組重測序數據分析的家犬東亞南部起源模式相沖突。相關成果日前在線發表于美國《國家科學院院刊》。 2015年，美國學者Shannon等人通過分析大量的家犬群體全基因組DNA芯片數據，提出了家犬
Nature發布比較基因組學研究重要發現
來自杜克大學醫學院、Brigham婦女醫院和哈佛醫學院的研究人員，發現了一個機制可以解釋：一些遺傳突變在一種基因組中會致病，而在另一種基因組中則為良性的原因。 在發表于6月29日《自然》（Nature）雜志上的研究論文中，研究人員比較了成千上萬的人類致病突變與大約100個動物物種的相似序列。
英國基因組學研究進展迅速
隨著基因數據的逐漸增多，臨床醫生能夠更好地治療患者，同時減少醫療事故的發生。英國國家醫療服務體系(National Health Service，NHS)中的許多遺傳學中心現在都在使用芯片和外顯子測序。 近日，英國衛生大臣Jeremy Hunt和生命科學部長George Freeman將宣布新
華大智造宣布超高通量基因測序儀落地南澳基因組學中心
2023年4月27日，華大智造宣布超高通量基因測序儀DNBSEQ-T7落地南澳基因組學中心（SAGC），該中心將基于DNBSEQ-T7測序平臺開展各項科學研究，助力全面推動澳大利亞基因組學研究發展和成果轉化。??南澳基因組學中心成立于2020年7月，是國際領先的基因組學中心之一，致力于支持整個澳洲及
Oxford－Nanopore便攜式高通量測序儀，打開基因組學新市場
Oxford Nanopore Technologies（“Oxford Nanopore”）推出PromethION 2（“P2”）Solo測序儀，這是全球可及性最高的高通量測序設備，有可能大大提高針對人類遺傳學和其他更大數據集的準確、快速和負擔得起的測序的可及性。 P2 Solo是市場上唯
華大基因攜手愛丁堡大學，共促基因組學研究
2012年7月24日，深圳華大基因研究院與英國愛丁堡大學簽署合作協議，宣布雙方將在基因組領域展開廣泛的科研合作，通過匯聚中英兩國研究專長，加速基因組學在人類健康和農業及其他相關領域的創新和發展。 在簽署的合作備忘錄中，雙方將著眼于對人類和其他生物的科學認識，通過共同努力，對遺傳信息進行深入
全國玉米功能基因組學研究協作平臺建立
近日，由中國農業科學院生物技術研究所、安徽農業大學和齊魯師范學院共同主辦的第四屆全國玉米功能基因組學術研討會在海南三亞召開。會議旨在通過創新共享玉米EMS突變體庫種質材料，搭建全國玉米功能基因組研究協作平臺，協力推動我國玉米功能基因組學研究邁上新臺階。 中國農業科學院生物技術研究所所長李新海致開
桫欏保護基因組學研究取得新進展
中國科學院華南植物園研究員康明團隊在國家自然科學基金、廣東省重點領域研發計劃、廣東基礎與應用基礎研究旗艦項目等項目的資助下，基于三種桫欏屬植物的全基因組重測序數據，在樹蕨保護基因組學研究方面取得新進展。相關成果近日發表于《植物雜志》（The Plant Journal）。 樹蕨是一類形態獨特的
基因測序未來研究方向
研究人員對基因測序數據的需求越來越大。Eric Green、Edward Rubin和Maynard Olson三位科學家對未來40年基因測序技術的應用進行了展望。四十年前，也就是1997年前，兩篇論文首次報道了確定DNA片段中化學堿基順序的簡易方法。在此之前，分子生物學家們只能檢測DNA片段，而不
基因組學研究成果讓斑馬魚研究“快馬加鞭”
基因組學研究成果讓斑馬魚研究快馬加鞭（Genomics: Zebrafish earns its stripes）作者：謝訓衛人類發育，生理功能及疾病發生的過程涉及到成千上萬的基因和其變異體，但是大部分的基因和其變異體的功能依然是未知的。過去的20年里，斑馬魚逐漸成為研究人類基因功能的重要模式動物。