測序牛人發布蛋白單分子測序技術
人類生命的藍圖是三十億堿基對組成的人類基因組。而DNA編碼的蛋白質是幾乎所有生命過程的主要執行者。 現在，美國亞利桑納州立大學Biodesign研究所的Stuart Lindsay及其同事，在納米孔DNA測序技術的基礎上，開發了能夠精確鑒定氨基酸的蛋白單分子測序技術。這一技術不僅可以用來在臨床上測序蛋白質和檢測新生物指標，還有望給醫療領域帶來徹底的改變，在單分子水平上精確監控患者對治療的應答情況。 Lindsay及其團隊讓單鏈肽段穿過納米孔，納米孔兩邊的電極可記錄每個氨基酸通過時產生的電信號。他們使用一種機器學習算法，讓電腦能夠識別代表不同氨基酸的特征信號。這些信號可以作為可靠的指紋，幫助人們鑒別氨基酸的種類，以及氨基酸發生的微妙改變。 從基因組到蛋白組 蛋白對于細胞的生長、分化和修復至關重要，它們能夠催化化學反應，抵御疾病，具有各種各樣的重要功能。 與線蟲等簡單生物相比，人類的基因數相......閱讀全文
氨基酸的測序的方法和原理
建議參考王鏡巖的生物化學攜蘇丹來奔以色列纈氨酸 蘇氨酸 蛋氨酸（甲硫氨酸) 賴氨酸苯丙氨酸 異亮氨酸 色氨酸 亮氨酸
氨基酸的測序的方法和原理
氨基酸測序分為N端測序和C端測序，原理是用氨肽酶（N端測序法）或羧肽酶（C端測序法）將肽鏈從一端依次切下，并在一段時間內檢測切下的氨基酸的種類（時間過長則會出現多種氨基酸），并且重復該過程。必需氨基酸有9種：甲硫氨酸、纈氨酸、賴氨酸、異亮氨酸、苯丙氨酸、亮氨酸、色氨酸、蘇氨酸（可以用“甲借來一本兩色
氨基酸的發現與研究
1806年，法國科學家 L.N.Vanquelin和J.P.Robiquet從天門冬(asparagus)的汁液中分離到天冬酰胺?(asparagine,Asn)。1827年,A.Plisson從蜀葵(hollyhock)(Althaenrosea)根的分離物天冬酰胺中,分離到天冬氨酸。1868年R
基因測序未來研究方向
研究人員對基因測序數據的需求越來越大。Eric Green、Edward Rubin和Maynard Olson三位科學家對未來40年基因測序技術的應用進行了展望。四十年前，也就是1997年前，兩篇論文首次報道了確定DNA片段中化學堿基順序的簡易方法。在此之前，分子生物學家們只能檢測DNA片段，而不
限制性氨基酸的研究意義
蛋白質的種類不向，其具有的營養價值一般也不相同。蛋白質的營養價值，主要決定于它能在多大的程度上滿足機體的總氮平衡或正氮平衡和必需氨基酸的需要。一般來講，對于量的保證要容易些，大多數情況下，只需要提供給足夠的蛋白質就可以了。但是，質的要求，則必須參照機體的需要以及蛋白質本身所能提供的必需氨基酸盼量兩個
PNAS：新測序方法助力癌癥研究
在去年圣誕節期間的加拿大落基山脈冰攀之旅中，兩位來自華盛頓大學的年輕研究人員：Michael Schmitt和Jesse Salk突發奇想，談到了一個簡單但功能強大，可用于檢測癌細胞，獲得更好結果的新方法――如果他們能降低DNA測序中的錯誤率，那么就可以更好的檢測出這些細胞中的變異，這種改進
DNA測序技術的研究與發展
70年代末，WalterGilbert發明化學法、FrederickSanger發明雙脫氧終止法手動測序，同位素標記80年代中期，出現自動測序儀（應用雙脫氧終止法原理）、熒光代替同位素，計算機圖象識別90年代中期，測序儀重大改進、集束化的毛細管電泳代替凝膠電泳2001年完成人類基因組框架圖
tRF測序應用于Biomarker研究
南京醫科大學第一附屬醫院腫瘤科副主任醫師殷詠梅教授長期從事消化道腫瘤和乳腺腫瘤的內科治療，近來，其實驗室利用tRF&tiRNA測序，發現在曲妥單抗敏感和耐受的乳腺癌細胞中，tRNA來源的小非編碼RNA分子tRF&tiRNA表達差異顯著。其中tRF-30-JZOYJE22RR33和tRF-27-ZDX
近期基因測序研究領域新成果！
本文中，小編整理了多篇研究報道，共同聚焦科學家們在測序研究領域取得的新成就，與大家一起學習！圖片來源：Nature 【1】Nature：中國科學家使用單細胞測序來揭示人類胚胎植入的秘密 doi：10.1038/s41586-019-1500-0 近日，中國多家機構的一個研究團隊利用單細胞測
直接分辨單個氨基酸分子小小納米孔破解蛋白質測序難題
蛋白質是生命活動的主要承擔者。測量組成蛋白質的氨基酸的排列順序被稱為蛋白質測序。由于缺乏普適、高效的測序技術，人類對蛋白質的了解還極其有限，生命世界的諸多奧秘仍待破解。近日，浙江大學化學系馮建東團隊提出了基于固體納米孔的氨基酸識別方法。他們構建了直徑為1納米左右的人工納米孔，可進行單個氨基酸分子的精
直接分辨單個氨基酸分子小小納米孔破解蛋白質測序難題
蛋白質是生命活動的主要承擔者。測量組成蛋白質的氨基酸的排列順序被稱為蛋白質測序。由于缺乏普適、高效的測序技術，人類對蛋白質的了解還極其有限，生命世界的諸多奧秘仍待破解。近日，浙江大學化學系馮建東團隊提出了基于固體納米孔的氨基酸識別方法。他們構建了直徑為1納米左右的人工納米孔，可進行單個氨基酸分子的精
簡述限制性氨基酸的研究意義
蛋白質的種類不向，其具有的營養價值一般也不相同。蛋白質的營養價值，主要決定于它能在多大的程度上滿足機體的總氮平衡或正氮平衡和必需氨基酸的需要。一般來講，對于量的保證要容易些，大多數情況下，只需要提供給足夠的蛋白質就可以了。但是，質的要求，則必須參照機體的需要以及蛋白質本身所能提供的必需氨基酸盼量
應用Arraystar－ChIRP測序和RNA測序于糖尿病性腎病研究
美國德克薩斯大學安德森癌癥研究中心Farhad R. Danesh教授主要從事腎臟病理的基礎與臨床研究。近期，其實驗室通過Arraystar RNA-seq發現lncRNA分子——Tug1在糖尿病小鼠體內低表達。表達譜芯片及Arraystar CHIRP-seq等證明，Tug1能夠直接結合PGC
應用Arraystar－ChIRP測序和RNA測序于糖尿病性腎病研究
美國德克薩斯大學安德森癌癥研究中心Farhad R. Danesh教授主要從事腎臟病理的基礎與臨床研究。近期，其實驗室通過Arraystar RNA-seq發現lncRNA分子——Tug1在糖尿病小鼠體內低表達。表達譜芯片及Arraystar CHIRP-seq等證明，Tug1能夠直接結合PGC
應用Arraystar－ChIRP測序和RNA測序于糖尿病性腎病研究
美國德克薩斯大學安德森癌癥研究中心Farhad R. Danesh教授主要從事腎臟病理的基礎與臨床研究。近期，其實驗室通過Arraystar RNA-seq發現lncRNA分子——Tug1在糖尿病小鼠體內低表達。表達譜芯片及Arraystar CHIRP-seq等證明，Tug1能夠直接結
X染色體的測序及研究
2003年6月，美國的研究人員在Nature雜志上發表了已完成的對人類Y染色體的詳細分析。2005年3月17日，在Nature雜志上發表的一篇文章宣告基本完成對人類X染色體的全面分析。對X染色體的詳細測序是在英國Wellcome Trust Sanger研究中心領導下，世界各地多所著名學院超過250
將基因測序與醫學研究相結合
由于科技的進步，基因組測序的價格從2001年的1億美元降至如今的幾千美元。因為價格較低，現在很多人僅僅因為受到好奇心的驅使就開始嘗試基因測序技術。 但是基因測序尚未普及。國家人類基因組研究所的Leslie G. Biesecker表示，能夠體驗這一先進科技的人數不超過五位數。部分原因是很多人對
亞氨基酸是不是氨基酸？
形態類似于氨基酸(amino acid)的分子中不是含有氨基（—NH2），而是含有亞氨基(-NH-)和羧基，這樣的的化合物稱為亞氨基酸（imino acid)，也叫亞氨酸，比如脯氨酸和羥脯氨酸。
Nature：史上最大型RNA測序研究成果
來自日內瓦大學醫學院的研究人員領導一個歐洲科學家小組，發布了一張人類功能性遺傳變異的綜合圖譜。這一研究發表在9月15日的《自然》(Nature)和《自然生物技術》(Nature Biotechnology)雜志上，提供了有史以來RNA水平上最大的人類基因組與基因活性關聯數據集。 了解每
近期最受關注的基因組測序研究
想象一下有人遞給你一杯奶昔，要你鑒別出里面所有的東西。或許你能夠辨別出有一點點的草莓或是酸奶的味道。但總體上它的味道就像是無法分辨的成分構成的混成品。 現在再想象一下，這杯奶昔是由來自大腦的2萬個碾碎了的細胞所組成。你可以通過測試來確定樣本中有什么分子，這就是科學家們現在所做的事情。這當然會提
新型DNA測序方法助力干細胞分化研究
生物醫學領域的一個重要研究課題是解釋為何擁有完全相同DNA的細胞會分化成不同的功能細胞。美國的一支聯合研究小組近日發現，環繞DNA的染色質蛋白在這一過程中扮演了重要角色。《自然》網站日前預先發表了相關論文。染色質蛋白的功能不僅僅限于包裹基因物質，它們可以影響DNA雙螺旋的各個部分的打開和關閉狀態，從
高通量測序技術研究進展介紹
第二代測序技術， 又稱新一代測序技術， 是相應于以Sanger 測序法為代表的第一代測序技術而得名。第二代測序中3種主流測序技術分別為依次出現的 Roche/454 焦磷酸測序(2005 年)、Illumina/Solexa 聚合酶合成測序(2006 年)和 ABI/SOLiD 連接酶測序(
大麥6號染色體基因測序研究
2013年11月15日，成立于1875年的嘉士伯實驗室和華大基因旗下子公司――深圳華大科技服務有限公司（簡稱“華大科技”）宣布，雙方將聯合開展大麥6號染色體基因組破譯工作，旨在為培育大麥新品種提供具有價值的資源。 基因序列信息是開展快速及現代育種的核心，有助于挖掘有利遺傳突變，加速農作物育種改
單細胞研究指南：測序方法大比拼
??多細胞生物的每個細胞都攜帶著相同的遺傳學信息。不過，近年來蓬勃發展的單細胞研究告訴我們，每一個細胞都是獨一無二的。不同類型的細胞激活特定組合的機制，即使是同類型細胞，基因表達也會出現差異。??那么，細胞之間的哪些差異有生物學意義，哪些差異來自于技術偏好呢？要獲得可靠的結果又需要研究多少細胞呢？這
單細胞研究指南：測序方法大比拼
多細胞生物的每個細胞都攜帶著相同的遺傳學信息。不過，近年來蓬勃發展的單細胞研究告訴我們，每一個細胞都是獨一無二的。The Scientist雜志最近聯系了單細胞研究領域的一些專家，請他們分享了在單細胞中進行轉錄研究的秘訣。希望幫助研究者們更好地構建文庫，處理和分析結果數據。 那么，細胞之間的哪
最新DNA甲基化測序技術比較研究
在不同疾病中，DNA甲基化具有不同的模式。DNA甲基化的具體模式通常與諸如疾病亞型、疾病預后以及藥物反應等臨床信息具有一一對應的聯系。在多種癌癥的治療過程中，DNA甲基化生物標志物可以幫助臨床醫生選擇恰當的治療方式。 對于擁有成千上萬個樣本的大量病人來說，全基因組映射與DNA甲基化分析是非常合
單細胞研究指南：測序方法大比拼
多細胞生物的每個細胞都攜帶著相同的遺傳學信息。不過，近年來蓬勃發展的單細胞研究告訴我們，每一個細胞都是獨一無二的。不同類型的細胞激活特定組合的機制，即使是同類型細胞，基因表達也會出現差異。 那么，細胞之間的哪些差異有生物學意義，哪些差異來自于技術偏好呢？要獲得可靠的結果又需要研究多少細胞呢？這
康成tRF測序應用于Biomarker研究
南京醫科大學第一附屬醫院腫瘤科副主任醫師殷詠梅教授長期從事消化道腫瘤和乳腺腫瘤的內科治療，近來，其實驗室利用tRF&tiRNA測序，發現在曲妥單抗敏感和耐受的乳腺癌細胞中，tRNA來源的小非編碼RNA分子tRF&tiRNA表達差異顯著。其中tRF-30-JZOYJE22RR33和tRF-27-Z
單分子測序推動復雜動植物的研究
Pacific Biosciences公司近日風光無限，發布了新系統，帶動股價大漲。同時，它的單分子實時（SMRT）測序技術也助力了多個植物和動物基因組的研究。這些成果近期發表在多個期刊上，展現了SMRT測序的獨特魅力。 最新一期的《Nature》雜志發表了Oropetium thomaeum
單細胞RNA測序，眾多研究都pick它
多細胞測序和單細胞測序，你pick誰？如今，大多數研究人員也許會選擇后者，因為不一樣的角度，會帶來不一樣的見解。 多細胞測序和單細胞測序，你pick誰？如今，大多數研究人員也許會選擇后者，因為不一樣的角度，會帶來不一樣的見解。單細胞測序的最初動力來自癌癥研究，可幫助人們了解腫瘤異質性和腫瘤微環