從微陣列數據發現癌癥相關基因的新分析法
日前,美國德克薩斯大學和達特茅斯學院的研究人員開發出一種識別癌癥基因的新型基因表達分析方法。相關研究結果以“How to get the most from microarray data: advice from reverse genomics”為題發表在2014年3月21日的《BMC Genomics》雜志。研究結果向當前的微陣列數據分析范式發出了挑戰,表明這種新方法能夠提高對癌癥相關基因的識別能力。 典型的微陣列基因表達分析,是通過比較相鄰正常組織和腫瘤組織的基因表達。在這些分析中,表達具有強大統計差異的基因被鑒定出來。然而,許多基因在腫瘤中是異常表達的,作為腫瘤發生的一個副產品。這些“過客”基因在正常組織和腫瘤組織之間的表達是有差異的,但是它們并不是腫瘤發生的“驅動者”。因此,傳統的癌癥基因識別方法不是非常有效,需要更好的分析方法,來發現更多真正的癌癥相關“驅動”基因。 本文第一作者、社區及家庭醫學副教授Iva......閱讀全文
特定的tRNA基因的表達促進腫瘤轉移
Cell重大發現:tRNAs促進腫瘤轉移轉運RNAs(tRNAs)最初被認為是基因表達的靜態參與者,但是6月2號,洛克菲勒大學的H. Goodarzi研究團隊在Cell上發表的文章證明,tRNA也是基因表達的動態調節器,可影響疾病進展。接下來讓我們一起來看看他們的研究成果吧。H. Goodarzi研
真菌細菌如何影響基因表達和腫瘤存活
共聚焦顯微鏡下可見白色念珠菌生物膜代謝物刺激SCC25細胞 一項由巴西S?o Paulo州立大學(UNESP)的一組研究人員進行的體外研究顯示了真菌和細菌如何激活與頭頸部腫瘤相關的基因,由于生物膜的代謝(這些微生物以一種有結構和協調的方式自組織的群落)通過有利于腫瘤發展和抵抗治療所需的細胞
特定的tRNA基因的表達促進腫瘤轉移
Cell重大發現:tRNAs促進腫瘤轉移轉運RNAs(tRNAs)最初被認為是基因表達的靜態參與者,但是6月2號,洛克菲勒大學的H. Goodarzi研究團隊在Cell上發表的文章證明,tRNA也是基因表達的動態調節器,可影響疾病進展。接下來讓我們一起來看看他們的研究成果吧。H. Goodarzi研
如何檢測腫瘤抑制基因的表達或功能狀態?
檢測腫瘤抑制基因的表達或功能狀態可以采用以下幾種方法:免疫組織化學(IHC):利用特異性抗體檢測腫瘤組織切片中腫瘤抑制基因所編碼蛋白的表達水平和定位。實時定量 PCR(qPCR):通過檢測腫瘤抑制基因的 mRNA 水平來評估其表達情況。基因測序:包括 Sanger 測序和新一代測序技術(NGS),可
用兩種抗癌藥物同時治療乳腺腫瘤-改變腫瘤基因的表達
伊利諾伊大學Zeynep Madak-Erdogan教授及其研究團隊在一項新的研究中發現,同時用兩種抗癌藥物治療乳腺腫瘤可以通過兩條不同的基因通阻止腫瘤細胞產生內分泌抵抗。 ERα(+)乳腺癌腫瘤患者中大多數病人的死亡是由于其腫瘤細胞對內分泌治療產生了抗性進而導致腫瘤轉移的發生。因此,我們迫
科學家研制出腫瘤基因表達高效評估芯片
本報訊(記者潘希)日前,中科院深圳先進技術研究院醫工所陳艷帶領研究團隊,研制了用于腫瘤細胞基因表達水平評估的高通量微流控芯片,這一技術可發展成為癌癥的早期診斷和分析的新型技術。相關研究成果在線發表于該領域知名期刊《芯片實驗室》上。 微流控技術是在微米級結構中操控納升至皮升體積流體的技術與科
銳博生物:特定的tRNA基因的表達促進腫瘤轉移
Cell重大發現:tRNAs促進腫瘤轉移 轉運RNAs(tRNAs)最初被認為是基因表達的靜態參與者,但是6月2號,洛克菲勒大學的H. Goodarzi研究團隊在Cell上發表的文章證明,tRNA也是基因表達的動態調節器,可影響疾病進展。接下來讓我們一起來看看他們的研究成果吧。 H.
除了基因檢測,還有哪些方法可以檢測腫瘤抑制基因的表達或功能狀態?
除了基因檢測,以下方法也可用于檢測腫瘤抑制基因的表達或功能狀態:免疫熒光法(IF):類似于免疫組織化學,但是在熒光顯微鏡下觀察熒光標記的抗體與目標蛋白的結合情況,能更清晰地顯示蛋白的定位和表達。酶聯免疫吸附測定(ELISA):定量檢測體液(如血液、腦脊液等)中腫瘤抑制基因編碼的蛋白含量。轉錄組分析:
昆明動物所成功揭示泛腫瘤存在基因表達紊亂共有模式
挖掘腫瘤大數據有助于識別和總結腫瘤發生、發展過程的分子變化規律。然而,腫瘤組織高度異質性、批次效應等因素是腫瘤數據分析的重要難題,而目前常用的轉錄組數據分析方法對于腫瘤離群值極度敏感,容易產生假陰性結果。針對此,中國科學院昆明動物研究所科研人員開發了一種新的不依賴均一化、非參的高維大數據分析算法
昆明動物所成功揭示泛腫瘤存在基因表達紊亂共有模式
挖掘腫瘤大數據有助于識別和總結腫瘤發生、發展過程的分子變化規律。然而,腫瘤組織高度異質性、批次效應等因素是腫瘤數據分析的重要難題,而目前常用的轉錄組數據分析方法對于腫瘤離群值極度敏感,容易產生假陰性結果。針對此,中國科學院昆明動物研究所科研人員開發了一種新的不依賴均一化、非參的高維大數據分析算法
連接非編碼突變和腫瘤基因表達的轉錄組全網絡
腫瘤基因組中充滿了非編碼突變,這些突變對腫瘤的影響研究還不是很清晰。加州大學圣地亞戈分校的科學家Wei Zhang and Ana Bojorquez-Gomez,Trey Ideker,在最近國際頂級期刊Nature Genetics發表文章 A global transcriptiona
什么是基因表達調控?基因表達調控有什么意義
意義:1.適應環境、維持生長和增殖:生物體賴以生存的外環境是在不斷變化的,為了生存,所有活細胞都必須對外環境變化作出適當反應,調節代謝,以適應環境變化。生物體適應環境、調節代謝的能力與蛋白質分子的生物學功能有關。而蛋白質的水平又受基因表達的調控。2.維持個體發育與分化:多細胞生物調節基因的表達除為適
人腦基因表達圖集
小鼠的全基因組基因表達的高分辨率圖已經問世幾年時間了,但是,對于人腦而言,此前只發表過相對來說比較粗糙的分布圖。這是由于與小鼠相比,人腦規模增大了1000倍,以及死后組織供應有限和質量較差等因素所導致的。現在,Michael?Hawrylycz及其在“艾倫腦科學研究
什么是基因表達?
基因表達(gene expression)是指將來自基因的遺傳信息合成功能性基因產物的過程。基因表達產物通常是蛋白質,所有已知的生命,都利用基因表達來合成生命的大分子。
什么是基因表達?
基因表達(gene expression)是指將來自基因的遺傳信息合成功能性基因產物的過程。基因表達產物通常是蛋白質,所有已知的生命,都利用基因表達來合成生命的大分子。
電流激活基因表達
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/505925.shtm
基因的表達過程
基因的表達過程是將DNA上的遺傳信息傳遞給mRNA,然后再經過翻譯將其傳遞給蛋白質。在翻譯過程中tRNA負責與特定氨基酸結合,并將它們運送到核糖體,這些氨基酸在那里相互連接形成蛋白質。這一過程由tRNA合成酶介導,一旦出現問題就會生成錯誤的蛋白質,進而造成災難性的后果。值得慶幸的是,tRNA分子與氨
基因表達的概念
基因表達(gene expression)是指將來自基因的遺傳信息合成功能性基因產物的過程。基因表達產物通常是蛋白質,所有已知的生命,都利用基因表達來合成生命的大分子。
基因表達的步驟
基因表達可以通過對其中的幾個步驟,包括轉錄,RNA剪接,翻譯和翻譯后修飾,進行調控來實現對基因表達的調控。基因調控賦予細胞對結構和功能的控制,基因調控是細胞分化、形態發生以及任何生物的多功能性和適應性的基礎。基因調控也可以作為進化改變的底物,因為控制基因表達的時間、位置和量可以對基因在細胞或多細胞生
什么是基因表達?
因的表達過程是將DNA上的遺傳信息傳遞給mRNA,然后再經過翻譯將其傳遞給蛋白質。在翻譯過程中tRNA負責與特定氨基酸結合,并將它們運送到核糖體,這些氨基酸在那里相互連接形成蛋白質。這一過程由tRNA合成酶介導,一旦出現問題就會生成錯誤的蛋白質,進而造成災難性的后果。值得慶幸的是,tRNA分子與氨基
基因表達的定義
基因表達(gene expression)是指將來自基因的遺傳信息合成功能性基因產物的過程。基因表達產物通常是蛋白質,所有已知的生命,都利用基因表達來合成生命的大分子。
基因差異表達技術
真核生物中,從個體的生長、發育、衰老、死亡,到組織的得化、調亡以及細胞對各種生物、理化因子的應答,本質上都涉及基因的選擇性表達。高等生物大約有30000個不同的基因,但在生物體內任意8細胞中只有10%的基因的以表達,而這些基因的表達按特定的時間和空間順序有序地進行著,這種表達的方式即為基因的差異表達
-環境影響基因表達
日復一日、年復一年,我們的基因不斷地和我們所生活的環境、鄰居、家人,以及我們自己的心態“對話”。這些社會性互動的結果會進入我們細胞的控制室,改變基因的強弱表達,從而影響我們的習性、行為、生理、心理與健康。美國知名科學作家戴維·多布斯日前撰寫了《基因的社會生活——改變你的分子組成》一文,介紹了科學
基因表達的機制
轉錄轉錄過程由RNA聚合酶(RNAP)進行,以DNA為模板,產物為RNA。RNA聚合酶沿著一段DNA移動,留下新合成的RNA鏈。基因組DNA由兩條反向平行和反向互補鏈組成,每條鏈具有5'和3'末端。這兩條鏈分別稱為“模板鏈”(產生RNA轉錄物的模板)和“編碼鏈”(含有轉錄本序列的DN
基因表達的調控
轉錄調控可分為三種主要途徑:1)遺傳調控(轉錄因子與靶標基因的直接相互作用);2)調控轉錄因子與轉錄機制相互作用,3)表觀遺傳調控(影響轉錄的DNA結構的非序列變化)。通過轉錄因子直接調控靶標DNA表達是最簡單和最直接的轉錄調控改變轉錄水平的方法。基因的編碼區周圍通常都具有幾個蛋白質結合位點,具有調
基因表達的步驟
基因表達可以通過對其中的幾個步驟,包括轉錄,RNA剪接,翻譯和翻譯后修飾,進行調控來實現對基因表達的調控。基因調控賦予細胞對結構和功能的控制,基因調控是細胞分化、形態發生以及任何生物的多功能性和適應性的基礎。基因調控也可以作為進化改變的底物,因為控制基因表達的時間、位置和量可以對基因在細胞或多細胞生
基因表達的機制
轉錄轉錄過程由RNA聚合酶(RNAP)進行,以DNA為模板,產物為RNA。RNA聚合酶沿著一段DNA移動,留下新合成的RNA鏈。基因組DNA由兩條反向平行和反向互補鏈組成,每條鏈具有5'和3'末端。這兩條鏈分別稱為“模板鏈”(產生RNA轉錄物的模板)和“編碼鏈”(含有轉錄本序列的DN
靶向治療肺癌,從表觀遺傳學水平抑制腫瘤基因表達
非小細胞肺癌是世界范圍內導致癌癥致死的主要殺手,應用拓撲異構酶II抑制劑依托泊苷只對一小部分患有非小細胞肺癌的病人具有良好療效,因此,改變藥物作用靶點愈來愈成為藥物治療該疾病的重中之重。之前有研究表明,EZH2能與PRC2共同作用對H3K27進行三甲基化,從而起到基因沉默的作用,因此甲基轉移酶
組蛋白修飾分工調控基因表達水平和基因表達噪音
基因表達過程依賴于轉錄因子、染色質調控因子和染色質等生物大分子在布朗運動過程中的隨機碰撞,因此,即使是基因型和分化類型完全相同的細胞在相同環境下也存在基因表達的差異,被稱為基因表達噪音。研究基因表達噪音,對研究干細胞增殖分化、個體發育、病原菌的抗藥性以及農作物的穩產有著重要的意義,而其在人類早期
上海生科院開發出腫瘤基因組等位基因特異性表達新算法
7月13日,國際學術期刊Bioinformatics在線發表了中國科學院上海生命科學研究院計算生物學研究所李亦學研究組的最新研究論文cisASE: A likelihood-based method for detecting putative cis-regulated allele-spec