Nature介紹2015值得關注的質譜技術:DIA策略
2014年末,《Nature Methods》雜志將年度技術授予了激光層照熒光顯微技術(Light-sheet fluorescence microscopy)。同時,雜志也介紹了2015年值得關注的技術,包括非編碼RNA、新一代CRISPR、DIA質譜以及微小晶體的結構等。 傳統的蛋白質組學采用數據依賴采集(DDA)策略,將蛋白質樣品消化成肽段,離子化并通過質譜進行分析。在全掃描質譜圖中,高于噪音的肽段信號被選擇性裂解,產生隨機(MS/MS)質譜,能夠與數據庫中的圖譜相匹配。盡管這種方法非常強大,但它隨機抽取肽段進行裂解,總是偏向于那些信號最強的峰。因此,低豐度肽段的定量仍是挑戰。 早在兩年前,《Nature Methods》就將年度技術頒給了靶向蛋白質組學(targeted proteomics)技術。在最成熟的定向分析技術——選擇反應監測(SRM)中,質譜儀能非常靈敏地檢測到特定肽段,具有高的定量準確性。......閱讀全文
Nature介紹2015值得關注的質譜技術:DIA策略
2014年末,《Nature Methods》雜志將年度技術授予了激光層照熒光顯微技術(Light-sheet fluorescence microscopy)。同時,雜志也介紹了2015年值得關注的技術,包括非編碼RNA、新一代CRISPR、DIA質譜以及微小晶體的結構等。 傳統的
常見的質譜掃描模式丨DDA--DIA
Data Dependent Acquisition DDA 1 之前已經提到,DDA可以同時獲得被測代謝物的一級質譜和碎片信息,母離子的篩選主要依靠研究者預先設定的條件,如信噪比,同位素分布,離子強度,選擇top-n等等。該方法由于采用了較窄的m/z(通常為~1Da)窗口進行篩選目標離子減
【福利】一文了解三大創新技術(附白皮書下載),參與贏質譜積木模型
高靈敏度是質譜儀非常廣泛的技術性能要求。與儀器的質量精度相比,一個經常被忽視的領域,是飛行時間高分辨質譜較低占空比從而使系統靈敏度降低。基于SCIEX ZenoTOF? 7600系統的Zeno? trap(Zeno 阱),使得進行MS/MS掃描時,在全質量范圍內提升占空比好于90%。這可以等同于
SCIEX發布全新數據非依賴性采集技術—Zeno-SWATH-DIA
弗雷明翰市,美國馬薩諸塞州——作為生命科學分析技術創新者,SCIEX在2022年美國質譜年會(ASMS) 期間正式發布Zeno??SWATH??數據非依賴性采集(Zeno SWATH DIA)技術,標志著其在生物標志物發現及轉化應用中又向前邁進了重要一步。 Zeno SWATH DIA實現了高保真
定量蛋白質組學質譜采集技術進展(三)
然而PRM 的分析通量不如SRM。PRM 能同時監測最多10 ~15 個母離子,而SRM 能同時監測上百個離子對,因為高分辨質譜的有效掃描速度通常只有10 ~15 Hz,遠慢于SRM 的有效掃描速度。但是這一問題正逐步得到解決,多重累積(Multiplexing, MSX)技術的發展和使用有
質譜技術在蛋白質組研究中的分析方法
2003年人類基因組精細圖繪制完成,是人類科學史上一個里程碑式的事件。后基因組時代的研究重點自然落在了蛋白質頭上。為啥?因為中心法則告訴我們,基因的產物——蛋白質,是生命活動的最終執行者。與基因組類比,研究生物體內全套蛋白質的科學,就是蛋白質組學。基因組計劃完成的同年,人類蛋白質組計劃啟動,令人激動
技術推廣-DIA+PRM技術,全蛋白篩選及目標蛋白驗證一體化
隨著質譜儀器的不斷更新換代,蛋白組學的技術也不斷的革新,從最早的2-D電泳技術到基于LC-MSMS的蛋白定性;從Labelfree 技術到標記定量iTRAQ/TMT技術以及時下備受推崇的DIA/SWATH技術、PRM/MRM技術,每一次的技術革新都使得蛋白組學研究更上一階。 當下蛋白組學研究中
質譜技術在蛋白質組研究中的分析方法介紹
2003年人類基因組精細圖繪制完成,是人類科學史上一個里程碑式的事件。后基因組時代的研究重點自然落在了蛋白質頭上。為啥?因為中心法則告訴我們,基因的產物——蛋白質,是生命活動的最終執行者。與基因組類比,研究生物體內全套蛋白質的科學,就是蛋白質組學。基因組計劃完成的同年,人類蛋白質組計劃啟動,令人
全信息串聯質譜MSE-簡介
未知物的(一級)母離子與(二級)碎片離子數據是對其進行質譜分析所必須的信息。除了具備DDA串聯質譜采集方法外,沃特世質譜更提供了獨有的全信息串聯質譜(MSE)技術。那么MSE技術是如何獲得串聯信息,并做到信息收集的最優化與最大化呢??全信息串聯質譜(MSE)能提供什么樣的信息?1. 未知分析物的定性
HUPO見聞:SWATH對DDA將產生巨大沖擊
????? 近一段時間,一直不斷有Mann的新技術出現,THERMO的儀器基本上都是Mann首先發出的文章;而Aebersold自從回到瑞士以后在技術方面出的東西不多,今年ASMS質譜年會發布了和AB共同研究的SWATH技術。因未參會,一直
ASMS-2024-|-SCIEX全新ZT-Scan-DIA質譜采集技術引領生命科學前沿
2024年6月3日在2024 ASMS(美國質譜學會年會)上,全球生命科學分析技術創新者SCIEX推出了ZT Scan DIA for LC-MS/MS,這是全新一代數據非依賴采集(DIA)技術,將四極桿維度和Zeno Trap阱獲得的豐富MS2數據相結合。?DIA以非依賴性的方式檢測樣品中的所有化
ASMS-2024-|-SCIEX全新ZT-Scan-DIA質譜采集技術引領生命科學前沿
在2024 ASMS(美國質譜學會年會)上,全球生命科學分析技術創新者SCIEX推出了ZT Scan DIA for LC-MS/MS,這是全新一代數據非依賴采集(DIA)技術,將四極桿維度和Zeno Trap阱獲得的豐富MS2數據相結合。DIA以非依賴性的方式檢測樣品中的所有化合物,已成為從發現科
蛋白質組質譜新方法一覽
2003年人類基因組精細圖繪制完成,是人類科學史上一個里程碑式的事件。后基因組時代的研究重點自然落在了蛋白質頭上。為啥?因為中心法則告訴我們,基因的產物——蛋白質,是生命活動的最終執行者。與基因組類比,研究生物體內全套蛋白質的科學,就是蛋白質組學。基因組計劃完成的同年,人類蛋白質組計劃啟動,令人激動
SCIEX發布ZenoTOF-7600+新品!ZT-Scan-DIA實現精準蛋白質組學發現
2024年10月22日,在2024年第23屆國際人類蛋白質組(HUPO)大會上,全球生命科學分析技術創新者SCIEX通過推出高分辨質譜ZenoTOF 7600+系統,進一步拓展了其高分辨率精確質量質譜系列產品,并宣布了三項新的合作以提升蛋白質組學能力。 作為ZenoTOF高分辨質譜系列的最新系
AB-SCIEX:為您帶來突破性的質譜技術
創新的蛋白質組學質譜應用新技術SWATH采集方法 視頻播放 SWATH 采集方法是一項重大技術突破,它的推出是蛋白質組學技術發展的一個里程碑,有取代目前DDA技術的可能性。利用此項技術,科學家有史以來首次可在單次進樣分析中同時對所有蛋白質與多肽進行定量與定性檢測。 技術優勢
什么是全信息串聯質譜(MSE)?
MS E 是在一次液質分析中同時獲得高精確的母離子及碎片離子信息的串聯質譜方法。? 2. MS E 由“無碰撞能”與“高碰撞能”兩種掃描交替構成,分別記錄母離子及碎片信息。? 3. MS E 通過母離子與其碎片離子具有相同色譜行為的特性進行母-子離子的關聯歸屬。
專訪蘇黎世聯邦理工學院Ruedi-Aebersold教授
蘇黎世聯邦理工學院的Ruedi Aebersold團隊一直致力于蛋白質組學的研究,其中包括開發將蛋白質組作為一個完整實體加以研究的相關技術。通過與SCIEX合作,該團隊開發了SWATH? 質譜采集技術,這是一種能夠同時碎裂多種多肽的數據非依賴性采集(DIA) 方法。得到的全面數據集可以通過回溯進
一種新的具有高檢測覆蓋面的靶向代謝組學方法
文章題目為SWATHtoMRM: Development of High-Coverage Targeted Metabolomics Method Using SWATH Technology for Biomarker Discovery,是由中科院生物與化學交叉研究中心的朱正江研究員課題組
通過Zeno-SWATH-DIA,SCIEX宣布推出下一代數據獨立采集技術
近日,丹納赫公司(NYSE:DHR)旗下公司SCIEX推出Zeno SWATH DIA,這是生物標志物發現和翻譯工作流程的重要一步。 Zeno SWATH DIA 是樣本的最終數字記錄,可以使研究人員發現更多的潛在生物標志物,可用于臨床試驗的開發和新療法的發現。通過將 ZenoTOF 7600
特殊人群,質譜保障-|-SCIEX保健食品解決方案合集
SCIEX亮劍,讓保健品非法添加無處遁形?民以食為天,隨著國內經濟社會的快速發展,老百姓對美好生活的向往和對身體健康的需求越來越熱切,特別是越來越多的老年人愿意食用保健品調節身體機能,然而,一些不法分子、無良商家卻鋌而走險,利欲熏心,制售假冒偽劣產品,嚴重危害人民群眾身體健康和生命安全,損害消費者權
探索新污染物監測新境界丨高分辨質譜進階攻略
隨著《重點管控新污染物清單(2023版)》的全面實施,新污染物監測的重要性逐漸凸顯,引發了社會各界的廣泛關注。在當前的實驗室環境中,LC/MS檢測方案以其穩定可靠的性能,特別是三重四極桿液質檢測技術的廣泛應用,已成為新污染物檢測的主流方式。然而隨著檢測需求的不斷提升,我們面臨著新的挑戰:如何在常規檢
全信息串聯質譜(MSE)有哪些特點?
1.全面:所有的離子信息都被記錄,定量、定性更加準確。2. 精準:全部母離子與碎片離子信息都是高精度、高分辨的質譜數據。3. 簡單:方法設置僅需:質量范圍、采集時間、碰撞能量三個參數。4. 靈活:碰撞能量為線性升高的方式,因此不同分析物可在其最佳碰撞能下實現碎裂。
液質聯用中的質譜——串聯質譜篇(下)
本文舉幾例常見的串聯質譜儀,篇幅較長分為上、中、下三篇。 串聯質譜掃描方式 串聯質譜的掃描方式包括以下幾種: 1、子離子掃描/產物離子掃描/碎片離子掃描(Product Ion Scan/Fragment Ion Scan): 選擇某一質量的母離子進入碰撞室,與碰撞室內的碰撞氣體發生解離
創新數據非依賴性采集用于復雜基質目標蛋白質...(一)
創新數據非依賴性采集用于復雜基質目標蛋白質的定量分析摘要 數據非依賴性采集(DIA)是隨著定量蛋白質組學而建立的質譜掃描技術。DIA 能夠獲得掃描范圍內所有母離子及二級子離子信息,不會造成低豐度離子信息的丟失,同時突破了高分辨質譜二級定量的通量限制。本研究基于靜電場軌道阱Q-qIT-OT 三
與常規的DDA串聯質譜法比較,MSE的優點是什么?
數據依賴型串聯質譜法(DDA. Data Dependent Acquisition)是通過選擇特定母離子進入碰撞池,從而采集相應的碎片離子。而MSE 并不選擇特定母離子進行單獨碎裂,而是同時采集了所有母離子的碎片離子。這樣MS E 就避免了由于DDA采集速率的限制而造成的信息采集不全的問題。此外,
沃特世全信息串聯質譜—MSE簡介
未知物的(一級)母離子與(二級)碎片離子數據是對其進行質譜分析所必須的信息。除了具備DDA串聯質譜采集方法外,沃特世質譜更提供了獨有的全信息串聯質譜(MSE)技術。那么MSE技術是如何獲得串聯信息,并做到信息收集的最優化與最大化呢?全信息串聯質譜(MSE)能提供什么樣的信息?1. 未知分析物的定性與
Spectronaut?軟件支持Q-Exactive?質譜IDA采集模式
新型Spectronaut?軟件支持賽默飛Q Exactive?質譜采集的DIA數據 2013年8月28日—瑞士蛋白質組學公司Biognosys AG今天宣布推出新版Spectronaut?軟件,可進行超級反應監測(HRM)數據分析。HRM技術能夠在一次進樣分析中,重復并精確
精確修飾位點譜圖庫的建立與磷酸化蛋白質組的-DIA-解析3
結果顯示,從 DIA 數據中提取、定量到 6401 條可信的磷酸化肽,占譜圖庫磷酸化肽總數(6505 條)的 98.4%(圖 5)。磷酸化肽的豐度和離子化效率普遍較低,本實驗如此高的解析成功率表明,基于 Orbitrap 的 DIA 數據具有極高的譜圖質量和出色的靈敏度。??圖5. DIA可
SCIEX中國與應脈醫療簽署戰略合作協議
——攜手共推高深度高通量蛋白質組學體系創新 2022年7月1日,中國醫療器械和生命科學領域創新企業應脈醫療科技(上海)有限公司(下稱:應脈醫療)與全球生命科學和技術創新者SCIEX(下稱:SCIEX中國)在上海簽署戰略合作協議。雙方將在高深度高通量體液蛋白質組學領域展開多項深入合作,扎根中國市場,
一小時DDA鑒定DIA定量4000個Hela蛋白(一)
引言數據非依賴性的掃描模式(data-independent acquisition, DIA)是近幾年來發展的一種新的質譜數據采集方式[1]。它的理念是用二級碎片離子進行蛋白相對/絕對定量。 DIA 掃描模式中,超高分辨質譜對特定質量范圍內的所有母離子進行碎裂,采集所有母離子的碎片離子,并