蔣華良研究組合作發表最新PNAS文章：蛋白互作界面預測
來自中科院上海藥物研究所，美國萊斯大學的研究人員報道了最新研究成果，在可藥性蛋白質-蛋白質相互作用（PPI）界面預測與識別計算方法發展方面取得重要進展。這一研究成果公布在《美國國家科學院院刊》（PNAS）雜志上，文章的通訊作者是上海藥物研究所蔣華良研究員，以及萊斯大學José N. Onuchic博士。蔣華良研究組主要從事藥物設計、藥物新靶標的發現、藥物靶標構象變化與藥理功能關系等研究，曾在Nature等多份期刊上發表重要成果。蛋白質-蛋白質相互作用在細胞命運決定、信號轉導等重要生命過程中起重要作用，也是疾病發生和發展的重要環節。因此，蛋白質-蛋白質相互作用界面已經成為新藥發現的重要靶標。然而，蛋白質界面具有作用面積大、相對平坦等特點，不利于藥物分子、特別是小分子藥物結合，使得基于蛋白質-蛋白質界面的藥物設計面臨嚴峻挑戰。因此，發展蛋白質-蛋白質界面預測理論計算方法及其相應的藥物設計方法，用于細胞信號通路研究和靶向蛋白質-蛋白質......閱讀全文
蔣華良研究組合作發表最新PNAS文章：蛋白互作界面預測
來自中科院上海藥物研究所，美國萊斯大學的研究人員報道了最新研究成果，在可藥性蛋白質-蛋白質相互作用（PPI）界面預測與識別計算方法發展方面取得重要進展。這一研究成果公布在《美國國家科學院院刊》（PNAS）雜志上，文章的通訊作者是上海藥物研究所蔣華良研究員，以及萊斯大學José N. Onuchic博
化學生物學助力新藥研究模式轉變
專家們認為，這些研究不僅為腫瘤、炎癥等生物學基礎研究提供了小分子化合物工具，也將推動疾病治療領域創新藥物的發現。 “基于化學小分子探針的信號轉導過程研究”重大研究計劃（以下簡稱“重大計劃”）是國家自然科學基金委員會在“十一五”期間啟動的第一個重大計劃，也是化學生物學領域第一個重大計劃。 在
上海藥物所蔣華良院士榮獲“安捷倫思想領袖獎”
分析測試百科網訊 2019年9月19日，安捷倫思想領袖獎頒獎典禮暨創新藥物研發研討會在中科院上海藥物研究所隆重舉行。迄今為止，全球范圍內已有46位科研人員獲得這個獎項。安捷倫將第47個“安捷倫思想領袖獎”頒發給中國科學院上海藥物研究所蔣華良院士，以表彰蔣華良院士在原創藥物研發以及糖類藥物研究領域
蔣華良等離子通道結構功能研究與藥物設計獲進展
GPCR和激酶等靶標存在較為明確的內源性配體結合口袋，其激動劑類藥物一般是作用于該口袋，在一定程度上取代(模仿)內源性激動劑的功能。針對 GPCR和激酶開展的基于結構的藥物設計已有很多成功案例。與這些受體和激酶不同，電壓門控通道是被電壓激活，沒有明確的常規內源性配體結合口袋。確證激動劑的作用
《中國科學報》藥物設計新方法可預測藥效
3月5日，《中國科學報》記者撰文，介紹了我校課題組與美國Rice大學José N.Onuchic課題組合作,在藥物設計理論計算新方法發展研究中獲得重要成果的情況，全文轉載如下： 本報訊(記者黃辛)近日，中科院上海藥物研究所蔣華良課題組、華東理工大學李洪林課題組和美國Rice大學José
蔣華良，李洪林等PNAS獲研究新技術
來自華東理工大學，大連理工大學，中科院上海藥物研究所等處的研究人員發表了題為“Free energy landscape for the binding process of Huperzine A to acetylcholinesterase”的文章，研發出了配體-受體結合自由能全景
上海藥物所研究員蔣華良解讀2013年諾貝爾獎
為深入解讀2013年諾貝爾獎的成就對當前自然學科發展的貢獻，激發公眾對科學的興趣和關注，鼓勵更多科研人員發揮探索和創新精神，上海市科協于12月5日至12月10日在上海科學會堂二樓盧浮宮舉辦了三場報告會，由相關領域的科研一線科學家分別解讀2013年諾貝爾“物理學獎”、“生理學獎”和“化學
蛋白質蛋白質相互作用理論預測和藥物設計新法獲進展
11月29日，《美國國家科學院院刊》（PNAS）在線發表了中國科學院上海藥物研究所蔣華良課題組和美國萊斯大學（Rice University）José N. Onuchic 課題組合作的論文Elucidating the druggable interface of protein-protei
上海藥物所蛋白質折疊計算模擬研究取得進展
在生物體系中，蛋白質通過折疊成特定的三維結構發揮功能。這種折疊過程可能受到不同因素的影響，如配體結合、聚合狀態等。充分理解蛋白質折疊過程對于藥物分子設計、蛋白質突變所導致致病機理的預測、深入了解細胞功能以及進化都至關重要。大規模計算機模擬有潛力從原子水平捕捉整個蛋白系統的動態過程，但是
中科院上海藥物所等單位確證腎癌治療新靶點
中科院上海藥物所蔣華良課題組、楊財廣課題組及北京基因組所劉江課題組在一項合作研究中確證了腎癌治療新靶點SPOP。9月12日，相關成果在線發表于《癌癥細胞》雜志。 以索拉非尼和舒尼替尼為代表的靶向抗腫瘤藥物是晚期腎癌的一線治療藥物，但對轉移性腎癌的療效十分有限，并且容易產生耐藥。因此，當前亟待發
研究人員創建精準N糖蛋白質組學分析方法
復旦大學化學系教授楊芃原團隊、中科院計算技術研究所研究員賀思敏團隊、國家蛋白質科學中心（上海）研究員黃超蘭團隊合作，創建了基于質譜的高通量糖基化肽段分析方法，為精準N糖蛋白質組學提供了新技術。9月5日，相關研究成果發表于《自然—通訊》。 糖基化是最復雜的蛋白后修飾之一。與其他蛋白后修飾相比
上海藥物所計算機靶標預測及發現技術研究取得新進展
中科院上海藥物所蔣華良課題組與華東理工大學藥學院李洪林課題組合作，繼反向對接方法——TarFisDock后，該研究團隊構建了藥效團靶標庫—PharmTargetDB（包含7000余個重要靶標結構的信息和藥效團模型，涵蓋了349種生物功能和110種臨床適應癥）。通過藥效團匹配方法，課
中科院上海藥物所等單位抗菌感染靶標確證研究獲進展
中科院上海藥物所楊財廣課題組、蔣華良課題組與美國芝加哥大學合作，針對耐藥金黃色葡萄球菌轉肽酶SrtA發展了小分子抑制劑，并探索了小分子的作用機制及其治療耐藥菌感染小鼠的效果。相關成果日前在線發表于美國《國家科學院院刊》。 芝加哥大學Olaf Schneewind課題組長期研究發現，轉肽酶Srt
中國科學家最新Science獲艾滋病研究突破
來自中國科學院上海藥物研究所，美國Scripps研究所等處的研究人員發表了題為“Structure of the CCR5 Chemokine Receptor–HIV Entry Inhibitor Maraviroc Complex”的文章，解析了CCR5蛋白質分子的高分辨率三維結構
上海藥物所表觀遺傳分子機制合作研究取得新進展
中科院上海藥物研究所蔣華良課題組與美國芝加哥大學化學系何川課題組合作，針對胸腺嘧啶DNA糖苷化酶及細菌轉錄因子AgrA在表觀遺傳與轉錄調控中的作用開展研究，取得了良好進展。研究論文分別于2012年2月及2012年5月在線發表在Nature Chemical Biology和PNA
人工智能將成藥物研發關鍵工具
“AI（人工智能）技術應用于藥物研發已經引起研究院所和制藥行業高度重視，AI開始賦能藥物研發的靶標發現和確證、藥物先導化合物的發現和優化、藥物藥代和毒性評價等各個階段，將成為未來藥物研發的關鍵核心技術之一。”7月12日，中國科學院院士、中國科學院上海藥物研究所研究員蔣華良在2022《理解未來》科
上海藥物所在抗菌感染靶標確證合作研究中取得進展
中國科學院上海藥物研究所楊財廣課題組、蔣華良課題組與美國芝加哥大學微生物學系Olaf Schneewind課題組合作，針對耐藥金黃色葡萄球菌轉肽酶SrtA發展小分子抑制劑，探索小分子的作用機制以及治療耐藥菌感染小鼠的效果，取得較好進展。研究論文于9月2日在線發表在美國科學院院刊Proceedin
方案12－通過陣列檢測來研究蛋白質小分子相互作用
實驗材料用于標記的小牛血清白蛋目標小分子載有蛋白質陣列的玻片試劑、試劑盒單功能活性染料Cy-3或Cy-5磷酸鹽緩沖溶液含有 500mmol L甘氨酸的 PBS二琥珀酰亞胺戊二酸（DSG)NN’-二琥珀酰亞胺碳酸鹽硫代琥珀酰亞胺酯含 0.01g ml小牛血清白蛋白（BSA)的 PBST儀器、耗材熒光玻
中外科學家開辟抗腫瘤藥物研發新方向
銅離子是人體內的“危險分子”，絕大多數情況下都必須有伴侶蛋白陪護，而不少腫瘤少了銅離子就會生長停滯。中科院上海藥物研究所蔣華良課題組與芝加哥大學何川課題組、艾默里大學陳靖課題組合作，經過三年多研究發現，細胞內有多種銅離子伴侶蛋白，只要控制住它們的行動，就可讓肺癌、血液病、胰腺癌、乳腺癌等惡性腫瘤
類似Google的蛋白功能搜索引擎研究進展
細胞通過成千上萬控制其生長和分化的蛋白相互協作而發揮功能，關鍵蛋白功能失常常會導致疾病。目前已經有許多關于探索所有人類蛋白功能的大規模研究項目。最近，de Recherches Cliniques de Montréal (IRCM)研究所Benoit Coulombe博士率領的研究小組新發展了一套
Cell提出一個新“組學”：蛋白質代謝小分子互動組學
科學家們提出了一個新的“組學”——一個處理蛋白質和小分子之間相互作用的互動組學（protein-metabolite interactomics）。此前系統生物學家專注于基因組學或蛋白質組學，現在他們日益發現了蛋白質-代謝小分子之間相互作用的重要性。 基因組學針對的是生物體基因的系統分析，而蛋
張麗華：搭建蛋白質組學研究平臺
分析測試百科網訊 自然科學研究，原則上應該是理性思辨能力更強的男性占優；而從屠呦呦獲得了諾貝爾獎可以推斷，女性從事科學研究同樣可以做得出色。在分析化學領域，有這樣一位女性。她曾榮獲2015年“中國青年女科學家獎”；在和男性同臺競爭的舞臺上，她2014年入選了中組部“萬人計劃”； 2017年獲得了
蛋白質相互作用組研究獲進展
蛋白質相互作用組是指蛋白質之間的基本相互作用，對于大多數物種而言，其在很大程度上都是未知的。因而，研究探索膜蛋白潛在的相互作用組必然是一項極具挑戰性的工作。 美國斯坦福大學卡耐基科學研究所Jones等研究人員，使用構建好的分裂泛素化酵母試驗系統，從擬南芥中篩選鑒定出超過3000個膜蛋白之間的相
Nature：中國科學家揭示SARSCoV2主要蛋白酶的結構
一種新的冠狀病毒(SARS-CoV-2)被鑒定為COVID-19病毒，它是引起2020年初COVID-19全球大流行的罪魁禍首。但是目前還沒有針對性的治療方法，且有效的治療選擇仍然非常有限。 為了快速發現用于臨床的先導化合物，來自上海科技大學的饒子和/楊海濤課題組與上海藥物所的蔣華良課題組及其
研究人員開發定量蛋白質組學數據的下游分析工具
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/507985.shtm
上海藥物所小分子調控核酸去甲基化研究取得階段進展
中科院上海藥物研究所楊財廣課題組與蔣華良課題組合作，基于mRNA中N6位甲基化修飾的腺嘌呤(N6-methyladenosine, m6A)去甲基化酶FTO結構開展小分子調控研究，首次獲得了對核酸去甲基化酶，例如FTO具有酶活和細胞活性的小分子抑制劑。論文于10月11日在線發表于《美國化學會
09候選院士最新PLoS－Biology文章
摘要： 記者報道，09候選院士中科院上海生科院上海藥物研究所蔣華良課題組和神經科學研究所徐天樂課題組在《PLoS Biology》上聯合發表了關于離子通道門控機制研究的論文(PLoS Biology, 2009, 7: e1000151)，Inherent Dynamics of the Aci
血栓形成關鍵受體三維結構被揭示
中科院上海藥物所趙強研究組與美國國立衛生研究院等機構合作，揭示了血栓形成過程中關鍵受體——嘌呤能受體P2Y12R的三維結構。5月1日，兩篇獨立的研究論文同時發表于《自然》雜志。據悉，這是中國科研人員極其罕見地在頂級學術期刊上“背靠背”同期發表科研論文，第一作者為藥物所的張凱華和張進。 據介紹，
上海藥物所靶標發現技術取得突破
中科院上海藥物所蔣華良研究員與大連理工大學力學系王希誠教授合作，針對尋找藥物作用新靶標的需求，帶領博士后李洪林和高振霆等，發展了以活性小分子為探針、搜尋潛在結合蛋白質的“反向分子對接”方法，相關結果發表在Nucl. Acids Res. (2006, 34, W219-224)，并建立了相應的公共網
蔣華良院士團隊開發可解釋性深度神經網絡分子表征模型
近日，上海科技大學免疫化學研究所特聘教授蔣華良院士團隊在《Journal of Medicinal Chemistry》發表封面文章“Pushingthe Boundaries of Molecular Representation for Drug Discovery with the Gra