哺乳動物基因組三維結構首次確定
英國醫學研究理事會網站日前報道稱，英國科學家從單個細胞中確定出完整保存的哺乳動物基因組的首個3D結構，顯示了細胞核內所有染色體中的DNA是如何復雜地折疊在一起的。該項研究成果發表在近日出版的《自然》雜志上。 很多人對于呈現“X”形狀的染色體十分熟悉，但事實上，染色體僅在細胞分裂時呈現這種形態。英國劍橋大學和英國醫學研究理事會分子生物學實驗室的研究人員，利用一種圖像組合和對DNA不同部位多達1萬個測量結果，對實驗鼠胚胎干細胞內的基因組進行了研究。 利用這種新方法，研究人員目前已能確定細胞內部各種活躍染色體的結構，以及它們之間是如何相互作用并形成完整的基因組。關于細胞內部DNA折疊方式的知識，能夠使科學家們深入研究某些特定基因和控制其DNA的間隔區是如何相互作用的。染色體的結構控制基因（特定的DNA間隔區）在何時、以何種強度被“打開”或者“關閉”，在生物發育過程中發揮關鍵作用，當這種功能出現差錯時將會產生疾病。 劍橋大學生......閱讀全文
哺乳動物基因組三維結構首次確定
英國醫學研究理事會網站日前報道稱，英國科學家從單個細胞中確定出完整保存的哺乳動物基因組的首個3D結構，顯示了細胞核內所有染色體中的DNA是如何復雜地折疊在一起的。該項研究成果發表在近日出版的《自然》雜志上。 很多人對于呈現“X”形狀的染色體十分熟悉，但事實上，染色體僅在細胞分裂時呈現這種形態。
哺乳動物基因組三維結構首次確定
英國醫學研究理事會網站日前報道稱，英國科學家從單個細胞中確定出完整保存的哺乳動物基因組的首個3D結構，顯示了細胞核內所有染色體中的DNA是如何復雜地折疊在一起的。該項研究成果發表在近日出版的《自然》雜志上。 很多人對于呈現“X”形狀的染色體十分熟悉，但事實上，染色體僅在細胞分裂時呈現這種形態。
基因組的三維結構
摘要： 闡明染色質復雜結構的技術有染色質構象捕獲(chromatin conformation capture, 3C)及更高通量的衍生技術4C、5C，這些提供了長距離的染色質相互作用，但不能擴展到整個染色質相互反應組。在2009年末，兩種新方法的迸發，有望繪出全基因組范圍的相互作用圖譜。
Nature：哺乳動物著床前胚胎染色體三維結構重編程
2017年7月13日，清華大學-北京大學生命科學聯合中心頡偉研究組在《自然》雜志（Nature）上發表了題為《哺乳動物早期胚胎發育過程中染色體三維結構的親本特異重編程》（Allelic reprogramming of 3D chromatin architecture during earl
Cell：基因組三維結構存在細胞異質性
美國國家癌癥研究所、哈佛大學、馬薩諸塞大學和麻省理工學院聯合開展的一項研究發現，不同細胞和不同等位基因之間的基因組組織結構存在很大差異。這項研究成果于本周發表在《Cell》雜志上。 研究人員利用高通量的染色質構象捕獲（Hi-C）和高通量的熒光原位雜交（hiFISH）光學圖譜繪制來分析人包皮成纖
我科學家－揭示哺乳動物胚胎染色體三維結構奧秘
人類DNA如果拉成一條直線，長度大約為2米，但普通細胞核的直徑卻僅有5微米至10微米。因此，基因組DNA如何合理的折疊存放到細胞核里，是一個非常重要的科學問題。現有研究表明，在細胞核指揮細胞發揮功能的過程中，基因組DNA的三維空間折疊對此起到關鍵作用。 對于大多數動物包括我們人類來講，生命起始
研究揭示擬南芥基因組加倍導致的三維染色質結構
6月11日，《核酸研究》（Nucleic Acids Research）雜志在線發表了中國科學院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所植物分子遺傳國家重點實驗室方玉達研究組題為The effects of Arabidopsis genome duplication on the chro
哺乳動物中制備基因組DNA實驗
制備DNA ? ? ? ? ? ? 實驗材料 動物組織 試劑、試劑盒
哺乳動物中制備基因組DNA實驗
實驗材料 動物組織試劑、試劑盒 PBS乙酸銨乙醇酚氯仿異戊醇TE儀器、耗材 離心機搖床研缽實驗步驟 1. ?切下組織并立即剪成小塊，置于液氮中凍結。?2. ?將200 mg~1 g 的組織用預冷的研缽和研杵研碎，或用錘子將其搗為細粉末，每100 mg 組織用1. 2 ml 消化緩沖液懸浮。?3. ?
哺乳動物“共同祖先”基因組重建完成
從鴨嘴獸到藍鯨，每一種現代哺乳動物都是生活在大約1.8億年前的“共同祖先”的后裔。人們對“共同祖先”知之甚少，現在，一個國際研究小組通過計算重建了其基因組。該成果將發表在《美國國家科學院院刊》上，對理解哺乳動物的進化和保護工作具有重要意義。 研究人員利用了來自32個活物種的高質量基因組序列，這
Nature子刊：癌癥基因組三維結構和拷貝數變異關系
來自北京大學生命科學學院，清華-北大生命科學聯合中心等處的研究人員發表了題為“3D genome of multiple myeloma reveals spatial genome disorganization associated with copy number variations”的
植物和哺乳動物線粒體基因組的差異
植物細胞植物細胞的線粒體基因組的大小差別很大，最小的為100kb左右，大部分由非編碼的DNA序列組成，且有許多短的同源序列，同源序列之間的DNA重組會產生較小的亞基因組環狀DNA，與完整的“主”基因組共存于細胞內，因此植物線粒體基因組的研究更為困難。哺乳動物哺乳動物的線粒體基因DNA沒有內含子，幾乎
擬南芥基因組加倍導致的三維染色質結構及基因表達調控
6月11日，《核酸研究》（Nucleic Acids Research）雜志在線發表了中國科學院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所植物分子遺傳國家重點實驗室方玉達研究組題為The effects of Arabidopsis genome duplication on the chro
三維染色質結構與基因組功能及進化的關系獲揭示
辣椒是世界上種植最廣泛的蔬菜之一，也是重要的調味料作物。近日，華南農業大學園藝學院辣椒課題組研究揭示了辣椒三維染色質結構與基因組功能及進化的關系。相關研究發表于Nature Communications。 我國辣椒生產和消費量居全球之首，種植面積超過3000萬畝，產量4000多萬噸，年逾700
哺乳動物中制備基因組DNA實驗——制備DNA
在DNA提取過程中應盡量避免使DNA斷裂和降解的各種因素，以保證DNA的完整性，為后續的實驗打下基礎。一般真核細胞基因組DNA有107-9bp，可以從新鮮組織、培養細胞或低溫保存的組織細胞中提取，常是采用在EDTA以及SDS等試劑存在下用蛋白酶K消化細胞，隨后用酚抽提而實現的。實驗材料動物組織試劑、
三維基因組（HiC）技術解析
Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整個細胞核為研究對象，利用高通量測序技術，結合生物信息分析方法，研究全基因組范圍內整個染色質DNA在空間位置上的關系，獲得高分辨率的染色質調控元件相互作用圖譜。Hi-C可以與RNA-Seq
三維基因組（HiC）技術解析
Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整個細胞核為研究對象，利用高通量測序技術，結合生物信息分析方法，研究全基因組范圍內整個染色質DNA在空間位置上的關系，獲得高分辨率的染色質調控元件相互作用圖譜。Hi-C可以與RNA-S
三維基因組（HiC）技術解析
Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整個細胞核為研究對象，利用高通量測序技術，結合生物信息分析方法，研究全基因組范圍內整個染色質DNA在空間位置上的關系，獲得高分辨率的染色質調控元件相互作用圖譜。Hi-C可以與RNA-Seq
破解整合酶的三維結構
英國和研究人員在1月31日的《》雜志上報告說，他們合作進行的一項最新研究模擬出的。整合酶在包括艾滋病等逆轉錄酶病毒中可以找到，并且充當了艾滋病病毒在人體內復制時的“幫兇”。這項重大突破有助于家解決困擾了艾滋病研究領域長達20年的一個難題，從而找到更好的治療艾滋病的方法。 當艾滋病病毒感染人體時，
線粒體基因組的植物細胞和哺乳動物相關介紹
植物細胞 植物細胞的線粒體基因組的大小差別很大，最小的為100kb左右，大部分由非編碼的DNA序列組成，且有許多短的同源序列，同源序列之間的DNA重組會產生較小的亞基因組環狀DNA，與完整的“主”基因組共存于細胞內，因此植物線粒體基因組的研究更為困難。 哺乳動物 哺乳動物的線粒體基因DNA
哺乳動物精子的頂體的結構特點
哺乳動物精子的頂體是—個膜性帽狀結構，覆蓋著精子核的前端。頂體是膜包裹的溶菌體樣結構，含有許多水解酶類．如放射冠穿透酶、透明質酸酶、頂體素．蛋白酶、脂解酶、神經酰胺酶和磷酸酶等，其中以放射冠穿透酶．透明質酸酶及頂體素與受精關系最為密切。
重要癌癥靶標三維結構獲解析
上海科技大學iHuman研究所徐菲課題組與復旦大學、美國南加州大學和斯克瑞普斯研究所等單位合作，解析了重要癌癥靶標人源Smoothened受體的多結構域晶體結構，分辨率達到2.9埃（1埃=10-10米），相關成果日前在線發表于《自然—通訊》。 Smoothened受體是Hedgehog信號通路
迄今最大哺乳動物基因組庫為進化提供新見解
當21世紀初，小鼠、人類、大鼠和黑猩猩的完整基因組首次發表后，遺傳學家通過比較基因序列為了解哺乳動物進化打開了大門。為什么一些哺乳動物嗅覺特別靈敏？為什么有些哺乳動物要冬眠？為什么一些哺乳動物的大腦發更大？20年后的今天，由美國麻省理工學院、哈佛大學等單位的科學家牽頭的大型國際研究項目——“Zoon
中科院、上科大：受精卵如何發育成多功能個體
來自中科院北京基因組研究所，上海科技大學的研究人員發表了題為“3D Chromatin Structures of Mature Gametes and Structural Reprogramming during Mammalian Embryogenesis”的文章，揭示了哺乳動物成熟精子
研究發展出新型三維基因組成像系統
4月7日，《細胞研究》發表了中國科學院生物物理研究所劉光慧課題組和徐濤課題組，以及中科院動物研究所曲靜課題組合作的題為Visualization of Aging-Associated Chromatin Alterations with an Engineered TALE System的研究
研究發展出新型三維基因組成像系統
4月7日，《細胞研究》發表了中國科學院生物物理研究所劉光慧課題組和徐濤課題組，以及中科院動物研究所曲靜課題組合作的題為Visualization of Aging-Associated Chromatin Alterations with an Engineered TALE System的研究
Cell－Res封面文章：新型三維基因組成像系統
來自中科院生物物理研究所，中科院動物研究所等處的研究人員發展了一種新型三維基因組活細胞成像工具TTALE，并利用該系統實現了對端粒縮短和著絲粒構象變化等衰老伴隨的染色質結構改變的精準成像。此外，該研究發現了核仁區核糖體DNA拷貝數減少可以作為人類衰老的新型分子標志物。上述成果為在遺傳和表觀遺傳水
哺乳動物生命樹演化結構研究取得新成果
在爬行動物到哺乳動物的演化過程中，存在兩個重要的形態和功能變化，即牙齒從簡單到復雜以增加食物的攝取能力，以及下頜頭骨關節變為中耳聽骨組合以提高聽覺效力。近期，中國科學院古脊椎動物與古人類研究所研究員毛方園和張馳，聯合內蒙古自然博物館、云南祿豐自然資源局、楚雄祿豐恐龍化石保護研究中心以及美國和澳大利亞
血栓形成關鍵受體三維結構被揭示
中科院上海藥物所趙強研究組與美國國立衛生研究院等機構合作，揭示了血栓形成過程中關鍵受體——嘌呤能受體P2Y12R的三維結構。5月1日，兩篇獨立的研究論文同時發表于《自然》雜志。據悉，這是中國科研人員極其罕見地在頂級學術期刊上“背靠背”同期發表科研論文，第一作者為藥物所的張凱華和張進。 據介紹，
研究測定血栓形成關鍵因子三維結構
記者日前從中科院上海藥物所獲悉，該所科學家在嘌呤能受體P2Y1R結構生物學領域再次取得突破性進展，首次測定了該受體蛋白的高分辨率三維結構，并揭示了P2Y1R抑制劑分子的作用機理，為研究治療血栓性疾病新藥提供了重要依據，同時將開啟G蛋白偶聯受體（GPCR）藥物研發的新方向。相關成果以長文形式在線發