PCR實驗技術(三)
【注意事項】1. PCR引物設計:引物設計可能是PCR擴增成功最關鍵的因素。如引物設計欠佳,可能導致擴增產物不足,甚至擴增失敗,其原因是設計欠佳的引物可導致非特異擴增和/或形成引物二聚體,此又成為PCR反應的競爭性產物,從而進一步抑制PCR產物形成。在引物設計時必須考慮以下幾個因素,其中最重要的是引物長度、溶解溫度(Tm)、特異性、引物序列互補問題、G/C 含量和多嘧啶(T,C) 或多嘌呤(A, G)延伸、3’-末端序列等。 (1)引物長度:由于PCR反應的特異性、退火溫度以及時間均至少部分與PCR引物長度相關聯,因此引物長度是PCR擴增是否成功關鍵的因素。一般PCR引物長度為15-30核苷酸。(2)溶解溫度(Tm):因加熱而斷開H鍵,使雙鏈DNA分開或“溶解”為單鏈DNA。溶解溫度(Tm)即指使一半雙鏈DNA變為單鏈DNA的溫度。Tm可采用下列公式計算:Tm=2(A+T)&nb......閱讀全文
實時-PCR-實驗
? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 PCR Super Mix-UDG ROX 染料 蒸餾水 反向引物 正向引物 儀器
降落PCR實驗
實驗材料 基因樣品儀器、耗材 PCR實驗步驟 1. ?反應體積為50 μl。2. ?人CD137胞膜外區基因的PCR擴增體系:CD137-pCDNA3質粒4 μl,P1,P2各0.5 μmol/L,MgCl2 2 mmol/L,dNTP 0.4 mmol/L,Taq 5 U。3. ?hIgG1Fc片
誘變-PCR-實驗
試劑、試劑盒?氯仿 異戊醇乙醇礦物油或者一個蠟珠3mol L NaOAc5 mmol L MnCl2突變 PCR 緩沖液DNA 聚合酶Native Taq 或 AmpliTaq DNA 聚合酶高純度的脫氧核苷 5'-三磷酸dNTP 混合物模板 DNA引物瓊脂糖凝膠用溴化乙錠染色儀器、
雙重PCR實驗
隨著轉基因農作物的大量種植,其安全性問題也日益受到人們的重視。2002年我國要求對轉基因農作物實行標簽管理。抗草甘膦(glyphosate)大豆 (商品名,roundup ready soybean)是在傳統大豆株Variety A5403中轉入外源基因CAMV-35S啟動子、抗草甘膦基因CP4-E
PCR實驗操作
PCR實驗操作???? PCR是極為重要的DNA增殖技術,應用層面非常廣,其中包括了核酸探針的制備。如果一段DNA已經被次選殖至載體上,要以PCR擴增這段DNA時,可根據質體multiple cloning sites兩邊的序列,選用適當的核酸引子 (universal primers) 進行擴增反
誘變-PCR-實驗
? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 氯仿 異戊醇 乙醇 礦物油或者一個蠟珠 3mol L NaOAc 5 mmol L MnCl2 突變 PCR 緩沖液
誘變-PCR-實驗
誘變 PCR 最大的優勢是以一種沒有偏好的方式引入了各種類型的突變,而不是獲得高水平的單一的擴增。本實驗來源于 PCR 實驗指南(第二版),作者:種康,瞿禮嘉。試劑、試劑盒氯仿 異戊醇乙醇礦物油或者一個蠟珠3mol L NaOAc5 mmol L MnCl2突變 PCR 緩沖液DNA 聚合酶Nati
PCR實驗操作
PCR是極為重要的DNA增殖技術,應用層面非常廣,其中包括了核酸探針的制備。如果一段DNA已經被次選殖至載體上,要以PCR擴增這段DNA時,可根據質體multiple cloning sites兩邊的序列,選用適當的核酸引子 (universal primers) 進行擴增反應;比較常用的引子包括S
實時-PCR-實驗
本方法運用 PlatinumQuantitativePCRSuperMix-UDG。進行實時 PCR 時,應該有一套設備可以檢測每次 PCR 循環時釋放的熒光信號。并且還能檢測 FAM 和 JOE 激發后分別釋放出的 520mn 和 550nm 的發射波。本實驗來源于 PCR 實驗指南(第二版),作
實時-PCR-實驗
試劑、試劑盒 PCR Super Mix-UDGROX 染料蒸餾水反向引物正向引物儀器、耗材 ABIPRISM7700 型號系列檢測系統實驗步驟 一、材料1. 緩沖液、溶液和試劑以 50ul 反應體系為例。Platinum Quantitative PCR Super Mix-UDG(Invitro
PCR實驗技術
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? PCR實驗技術?PCR(聚合酶鏈式反應)?【原理】?PCR(polymerase?chain?reaction)用于在體外將微量的目標DNA大量擴增,以便進行分析。反應體系:①樣品DNA;②引物(primer),是人工合成的一對寡核苷酸
定量PCR實驗
實驗材料?限制性內切核酸酶反轉錄酶熱穩定 DNA 聚合酶dCTP靶核酸試劑、試劑盒?擴增緩沖液dNTP 貯存液胎盤 RNase 抑制劑儀器、耗材?瓊脂糖凝膠或聚丙烯酰胺凝膠屏蔽型槍頭離心管正向排液式移液器PCR 儀實驗步驟?一、材料1. 緩沖液與溶液10X 擴增緩沖液4 種 dNTP 貯存液(20
pcr實驗步驟
一、 樣品RNA的抽提1. 取凍存已裂解的細胞,室溫放置5分鐘使其完全溶解。2. 兩相分離 每1 ml的TRIZOL試劑裂解的樣品中加入0.2 ml的,蓋緊管蓋。手動劇烈振蕩管體15秒后,15到30℃孵育2到3分鐘。4℃下12 000 rpm離心15分鐘。離心后混合液體將分為下層的紅色酚相,中間層以
免疫PCR實驗
實驗方法原理 免疫PCR主要由兩個部分組成,第一部分的免疫反應類似于普通的酶聯免疫吸附試驗(ELISA)的測定過程;第二部分即通常的PCR檢測,抗原分子的量最終由PCR產物的多少來反映。第一步中,首先用待測抗原(如牛血清白蛋白(ESA))包被微滴板孔,再加入相應的特異抗體,于是抗體就與固相上的抗原結
菌落PCR實驗
菌落PCR標簽: 菌落 PCR菌落PCR(Colony PCR)可不必提取基因組DNA,不必酶切鑒定,而是直接以菌體熱解后暴露的DNA為模板進行PCR擴增,省時少力。建議使用載體上的通用引物。通常利用此方法進行重組體的篩選或者DNA測序分析。最后的PCR產物大小是載體通用引物之間的插入片斷大小。
反向PCR-(inversePCR)實驗步驟
nverse-PCR是克隆插入片段側翼序列非常有效的方法。通常采用的Tail-PCR假陽性太多,而Inverse-PCR一般只要有特異條帶,基本上就是目的片段。基本步驟如下:1、反向PCR(Inverse PCR)原理:反向PCR是克隆T-DNA插入位點側翼DNA序列非常有效的方法。a. 選擇合適的
定量PCR實驗技術-QPCR
Quantitative PCRJoseph SambrookPeter Maccallum Cancer Institute and The University of Melbourne, AustraliaDavid W. RussellUniversity of Texas Southwes
反向PCR-(inversePCR)實驗步驟
inverse-PCR是克隆插入片段側翼序列非常有效的方法。通常采用的Tail-PCR假陽性太多,而Inverse-PCR一般只要有特異條帶,基本上就是目的片段。基本步驟如下:1、反向PCR(Inverse PCR)原理:反向PCR是克隆T-DNA插入位點側翼DNA序列非常有效的方法。a. 選擇合適
反向PCR-(inversePCR)實驗步驟
inverse-PCR是克隆插入片段側翼序列非常有效的方法。通常采用的Tail-PCR假陽性太多,而Inverse-PCR一般只要有特異條帶,基本上就是目的片段。基本步驟如下:1、反向PCR(Inverse PCR)原理:反向PCR是克隆T-DNA插入位點側翼DNA序列非常有效的方法。a. 選擇合適
PCR實驗如實預防實驗污染
進行PCR操作時,操作人員應該嚴格遵守一些操作規程,最大程度地降低可能出現的PCR污染或杜絕污染的出現。劃分操作區:目前,普通PCR尚不能做到單人單管,實現完全閉管操作,但無論是否能夠達到單人單管,均要求實驗操作在三個不同的區域內進行,PCR的前處理和后處理要在不同的隔離區內進行:(1)標本處理區,
PCR實驗如實預防實驗污染
進行PCR操作時,操作人員應該嚴格遵守一些操作規程,zui大程度地降低可能出現的PCR污染或杜絕污染的出現。1.劃分操作區:目前,普通PCR尚不能做到單人單管,實現完全閉管操作,但無論是否能夠達到單人單管,均要求實驗操作在三個不同的區域內進行,PCR的前處理和后處理要在不同的隔離區內進行:(1)標本
FDDPCR-實驗
? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 cDNA 礦物油 儀器、耗材 熱循環儀 薄壁 PC
多元實時-PCR-實驗
試劑、試劑盒 PCR Super Mix-UDGROX 染料蒸餾水反向引物正向引物 儀器、耗材 ABIPrism7700型號系列檢測系統 實驗步驟 一、材料 1. 緩沖液、溶液和試劑 以50ul反應體系為例。 Platinum Quantitative PCR Su
FDDPCR-實驗
本方案設計為 24 個 PCR 反應,使用 3 種 cDNA 亞群(利用方案 3 中的 H-T11M 引物進行 RT 反應),引物為熒光染料標記的錨定引物(FH-T11M) 與 24 種上游任意引物 (HAP) 的組合。本實驗來源于 PCR 實驗指南(第二版),作者:種康,瞿禮嘉。試劑、試劑盒cDN
多元實時-PCR-實驗
多元實時 PCR 時,在一個反應管中加入不同標記的成對引物,從而可以同時分析多個不同的基因。在許多反應中,用 JOE 標記看家基因對模板定量,用 FAM 標記目的基因,證明 LUX 引物非常有效。在標準的多元體系中,使用的引物濃度和加入的體積與進行一元反應時相同,如下。本實驗來源于 PCR 實驗指南
PCR實驗技巧5
Trouble shooting guide?1.假陰性,不出現擴增條帶?PCR反應的關鍵環節有①模板核酸的制備,②引物的質量與特異性,③酶的質量, ④PCR循環條件。尋找原因亦應針對上述環節進行分析研究。?模板:①模板中含有雜蛋白質,②模板中含有Taq酶抑制劑,③模板中蛋白質沒有消化除凈,特別是染
PCR實驗技巧5
Trouble shooting guide?1.假陰性,不出現擴增條帶?PCR反應的關鍵環節有①模板核酸的制備,②引物的質量與特異性,③酶的質量, ④PCR循環條件。尋找原因亦應針對上述環節進行分析研究。?模板:①模板中含有雜蛋白質,②模板中含有Taq酶抑制劑,③模板中蛋白質沒有消化除凈,特別是染
FDDPCR-實驗
試劑、試劑盒 cDNA礦物油儀器、耗材 熱循環儀薄壁 PCR 管實驗步驟 一、材料1. 緩沖液、溶液和試劑礦物油(可選)2. 核酸和寡核苷酸來自方案 3 的 cDNA3. 專用設備熱循環儀 [推薦使用 GeneAmpPCRSystem9600(Perkin-Elmer),或者 Mastercyder
PCR-擴増實驗
這一方案設計包含 10 個反應還多 10%, 每次奇數循環之后相應地從 PCR 儀中取出樣品,由第 15 個循環起始,到第 35 個循環終止。本實驗來源于 PCR 實驗指南(第二版),作者:種康,瞿禮嘉。試劑、試劑盒dNTP混合物基因特異的正向引物基因特異的反向引物單鏈cDNATaqDNA聚合酶RT
原位PCR實驗相關
所需設備 原位PCR反應是在載玻片的平面上進行,保持水平可以使反應各組分均勻地分布在組織切片上,所以須在原位PCR儀上進行,該儀器不但可以使載玻片保持水平,而且還可以給載玻片進行均勻地加熱,保證擴增反應的順利進行。 探針種類 與原位雜交一樣,檢測原位PCR結果的探針可以是DNA探針,也可以