FDA斥資17000萬購Illumina測序儀檢測病原體
美國FDA采購Illumina公司1700萬美元MiSeq測序儀及試劑用于病原體檢測 2012年9月18日，來自美國圣地亞哥BUSINESS WIRE的消息 C Illumina公司（納斯達克代碼：ILMN）今天宣布，它贏得了一份來自美國食品藥品監督管理局（FDA）的合同，為該機構提供MiSeq測序系統及試劑，以便開展食品安全相關的沙門氏菌和產志賀毒素大腸桿菌的全基因組分析進行病菌爆發的溯源。這份五年期的合同價值1700萬美元。 FDA已有的幾臺MiSeq系統正在用于加強建設其現有資源和培訓方面的能力，進一步展現全基因組測序技術在病原檢測概念驗證方面的優勢。近期，FDA希望在食品安全相關的沙門氏菌上獲得數據，這對未來疫情的爆發的追蹤溯源將具有非常重要的意義。 FDA的國立及州立實驗室檢測、分離并處理各種各樣的腸道病原體。利用MiSeq，他們能從以往的病原體采集物以及全國各地農產品中采集而來的細菌中產生高質量的全......閱讀全文
全基因組測序助力食源性疾病檢測
CDC研究人員檢查用于全基因組測序的電腦芯片。 李斯特菌暴發致3人死亡并且迫使美國得克薩斯州藍鈴冰淇淋公司在上個月底召回其全部產品，這是遺傳流行病學如何正在改變食源性疾病檢測的最新例子。兩年前，位于亞特蘭大的美國疾病控制和預防中心（CDC）啟動一項試點計劃，測序與某種疾病相關聯的每個李斯特菌樣品的
首個基于全基因組測序技術的食源性疾病分子溯源網絡
食源性疾病是全球范圍內重要的食品安全問題，早期發現和查明病因是防控食源性疾病的重要保證。隨著新一代基因組測序技術的發展，基于全基因組測序（WGS）的分子分型技術在食源性疾病聚集性病例識別和暴發溯源調查中已顯示出極大的應用價值和發展潛力，逐漸成為國際研究熱點，歐美相關國家已相繼開展研究和布局。在國
首個基于全基因組測序技術食源性疾病分子溯源網絡建成
食源性疾病是全球范圍內重要的食品安全問題，早期發現和查明病因是防控食源性疾病的重要保證。隨著新一代基因組測序技術的發展，基于全基因組測序（WGS）的分子分型技術在食源性疾病聚集性病例識別和暴發溯源調查中已顯示出極大的應用價值和發展潛力，逐漸成為國際研究熱點，歐美相關國家已相繼開展研究和布局。在國
FDA斥資17000萬購Illumina測序儀檢測病原體
美國FDA采購Illumina公司1700萬美元MiSeq測序儀及試劑用于病原體檢測 2012年9月18日，來自美國圣地亞哥BUSINESS WIRE的消息 C Illumina公司（納斯達克代碼：ILMN）今天宣布，它贏得了一份來自美國食品藥品監督管理局（FDA）的合同，為該機構提供MiSe
美國FDA采購Illumina公司1700萬美元MiSeq測序儀及試劑用于病原體
2012年9月18日，來自美國圣地亞哥BUSINESS WIRE的消息 C Illumina公司(納斯達克代碼：ILMN)今天宣布，它贏得了一份來自美國食品藥品監督管理局(FDA)的合同，為該機構提供MiSeq測序系統及試劑，以便開展食品安全相關的沙門氏菌和產志賀毒素大腸桿菌的全基因組分析進
OPGEN全基因組圖譜應用系列——鞭蟲全基因組測序
鞭蟲是一種常見的土壤傳播寄生蟲，地理分布廣，感染率高，寄生于人體盲腸，導致人體慢性感染，對人類危害巨大。鞭蟲的全基因組測序研究由著名的桑格研究院（Wellcome Trust Sanger Institute）完成，發表在世界頂級期刊《Nature Genetics》上。該研究通過對2種不同
人類全基因組測序計劃
全基因組測序是對未知基因組序列的物種進行個體的基因組測序。 1986年， Renato Dulbecco是Z早提出人類基因組測序的科學家之一。他認為如果能夠知道所有人類基因的序列，對癌癥的研究將會很有幫助。美國能源部（DOE）與美國國家衛生研究院（NIH），分別在1986年與1987年加入人類基
AJMG：全基因組測序方法破解兒童罕見疾病大難題
近日，來自美國翻譯基因組學研究院(Translational Genomics Research institute)的研究人員通過研究鑒別出了能夠引發兒童機體異常和發育遲緩的基因突變，相關研究刊登于國際雜志American Journal of Medical Genetics上。基于對6歲兒
全基因組測序的診斷價值
根據《Nature Genetics》上發表的一項新成果，全基因組測序有望用于臨床上的遺傳病診斷。這項研究評估了影響全基因組測序在臨床診斷中取得成功的因素。 這個國際研究小組由英國的研究人員領導，對156個病例或家庭開展了臨床基因組測序。這些病例有著遺傳疾病的特征，但無法通過之前的篩查檢測來解
全基因組測序各步驟工具
全基因組測序（WGS）是下一代測序技術，用于快速，低成本地確定生物體的完整基因組序列。基因組的深度測序對于臨床研究的意義重大，解讀WGS數據并了解基因組突變在健康和疾病中的重要性是精準醫療的基石。WGS分析流程能分為三大塊，數據處理、檢測變異和綜合分析，具體如下圖所示：由于WGS現在已經非常成熟了，
全基因組測序在臨床感染疾病研究中的應用
感染病分子診斷中，PCR是公認的首選技術。然而全基因組測序（WGS）可能會超越PCR成為首選。在今年舉行的歐洲臨床微生物學和感染病大會（ECCMID）上，關于該技術的科學研究展示數量迅速增長，正好證明了這一點。 大會上研究人員從多個方面探討了WGS在臨床中的應用，包括幫助預測耐藥性，促進流感疫
全基因組測序鑒定非洲結核桿菌病原體早期感染情況
最近，發表在《PNAS》雜志上的一項研究檢查了南非地區爆發的廣泛耐藥結核病流行株LAM4 / KZN的進化和流行病學歷史。 該菌株首次報道于2005年在夸祖魯-納塔爾省的圖格拉渡輪，此后已在全省廣泛傳播。這項新研究確定了促進XDR-TB菌株疫情爆發的關鍵宿主，病原體和環境因素，以及可以采
PNAS：全基因組測序鑒定非洲結核桿菌病原體早期感染
最近，發表在PNAS的一項研究檢查了南非地區爆發的廣泛耐藥結核病流行株LAM4 / KZN的進化和流行病學歷史。 該菌株首次報道于2005年在夸祖魯-納塔爾省的圖格拉渡輪，此后已在全省廣泛傳播。這項新研究確定了促進XDR-TB菌株疫情爆發的關鍵宿主，病原體和環境因素，以及可以采取的早期發現和遏
Cell新文章：癌癥全基因組測序
根據華盛頓大學醫學院的一項新研究，具有吸煙史的肺癌患者相比于不吸煙的肺癌患者腫瘤中的遺傳突變要多10倍。這一研究在線發表在9月13日的《細胞》(Cell)雜志上。 論文的資深作者、華盛頓大學基因組研究所主任Richard K. Wilson 說：“吸煙者基因組具有比不吸煙的肺癌患者基因
我國率先完成棗樹全基因組測序
在科技部“十一五”和“十二五”科技支撐計劃項目的持續資助下，河北農業大學劉孟軍教授研究團隊在世界上率先完成了棗樹的高質量全基因組測序，組裝出總長4.38億個堿基的棗基因組序列，達估測基因組的98.6%，使棗樹成為世界鼠李科植物（近千種）和我國干果樹種中第一個完成基因組測序的物種。 相關論文
我國率先完成菊花全基因組測序
中國中醫科學院中藥研究所和安利植物研發中心對外發布消息稱，由他們共同發起的科研團隊，在菊花全基因組計劃獲重大進展的同時，還完成了重要的藥用菊花品種——杭白菊的全長轉錄組遺傳信息發掘。此舉使我國成為世界上首次完成菊屬植物菊花全基因組測序的國家。 據了解，菊屬植物染色體結構復雜，包含從2n=18到
在一種食源性病原體沙門氏菌的基因組中發現了mcr9
康奈爾大學的食品科學家們發現了mcr-9，這是一種新的隱形跳躍基因，具有惡魔般的強大功能，可抵抗世界上為數不多的最后抗生素之一。 當所有其他抗感染選項用盡時，醫生會使用抗生素粘菌素。但是，全球范圍內出現了對粘菌素的抵抗，威脅到其療效。 “這種最后的抗生素被聯合國世界衛生組織指定為最優先的抗生
Nature－Genetics：全基因組測序的診斷價值
根據《Nature Genetics》上發表的一項新成果，全基因組測序有望用于臨床上的遺傳病診斷。這項研究評估了影響全基因組測序在臨床診斷中取得成功的因素。 這個國際研究小組由英國的研究人員領導，對156個病例或家庭開展了臨床基因組測序。這些病例有著遺傳疾病的特征，但無法通過之前的篩查
Science：全基因組測序探究瘧疾傳播機制
近日，發表在國際雜志Science上的一篇研究論文中，來自加拿大西蒙弗雷澤大學等處的研究人員對可傳播瘧疾的16種按蚊進行了遺傳測序，從而為揭示人類為何對其易感提供了新的思路和線索。 文章中，研究者Cedric Chauve表示，我們利用計算機方法來重新構建蚊子祖先的基因組，并且分析在過去1億年
動物全物種基因組測序仍有很大空白
近日，美國華盛頓州立大學領導的一項研究發現，目前對動物基因組進行的測序多數集中在與人類相似的動物上，研究人員警告稱，該現狀可能會忽視大量的生物多樣性和機會。相關研究結果發表于美國《國家科學院院刊》。 研究人員分析發現，近3300種動物的基因組已被測序。雖然動物物種測序工作一直在進行，但與世界
Nature－Genetics：全基因組測序的診斷價值
根據《Nature Genetics》上發表的一項新成果，全基因組測序有望用于臨床上的遺傳病診斷。這項研究評估了影響全基因組測序在臨床診斷中取得成功的因素。 這個國際研究小組由英國的研究人員領導，對156個病例或家庭開展了臨床基因組測序。這些病例有著遺傳疾病的特征，但無法通過之前的篩查檢測來解
全基因組測序提高罕見病診斷率
每4300人中就有1人患有線粒體疾病，并會導致進行性的不治之癥。這種疾病是最常見的遺傳疾病之一，但對臨床醫生來說很難診斷，這是因為它們可以影響許多不同的器官，并與許多其他疾病相似。而其中40%的患者未能被目前的基因檢測制度診斷。 近日，英國研究人員的一項新研究為尚不能被確診的患者帶來了希望。該
全基因組測序解密慢性高原病
8月16日，由加州大學圣地亞哥分校、華大基因等單位共同完成的安第斯高地人慢性高原病全基因組測序及相關研究，在《美國人類遺傳學雜志》上發表。研究為探索高原適應性的遺傳機制提供了基礎理論，也為慢性高山病的機理研究及治療提供了科學依據。 全球約有1.4億人世居高原。對于高原低氧環境的不適，通常會
全基因組測序確定腦瘤的基因變異
日前，圣猶達兒童研究醫院（St. Jude Children's Research Hospital）的研究人員在新研究中鑒別出了一種兒童腦瘤亞型一半以上患者的致病性突變。此外他們還證實這些腫瘤對已經在研發中的一些藥物敏感。這項研究論文刊登在了近期出版的《自然-遺傳學》（Nature Genet
科學家完成玉米全基因組測序
美國研究人員11月19日宣布，他們已經完成了玉米的全基因組測序工作，這一成果有望用于培育更高產的玉米品種。 來自美國圣路易斯華盛頓大學、亞利桑那大學等機構的150名研究人員歷時4年多完成了這一項目。他們以代號為B73的玉米品種為研究對象進行測序。結果顯示，玉米共有10對染色體，約3.2
全基因組及轉錄組測序案例分析
案例：應用全基因組測序和 RNA 測序來描繪常見的變異型免疫缺陷綜合癥（CVIDs）的基因圖譜 背景：常見的變異型免疫缺陷綜合癥（CVIDs）是機體免疫應答反應中不能產生抗體的最主要原因。CVIDs 變異度很高，大概 5% 的病人是由基因改變引起的。 目的：利用 Illumina HiSeq25
全基因組測序提高罕見病診斷率
每4300人中就有1人患有線粒體疾病，并會導致進行性的不治之癥。這種疾病是最常見的遺傳疾病之一，但對臨床醫生來說很難診斷，這是因為它們可以影響許多不同的器官，并與許多其他疾病相似。而其中40%的患者未能被目前的基因檢測制度診斷。 近日，英國研究人員的一項新研究為尚不能被確診的患者帶來了希望。該研
Nature：全基因組測序重新定義癌癥之王基因組突變藍圖
近日，一項發表于國際著名雜志Nature上的研究論文中，來自英國和澳大利亞的研究人員對100位胰腺癌患者癌癥組織的基因組進行了深入分析，結果發現了4種不同的亞型，這或許可以幫助后期開發治療胰腺癌患者的新型療法。文章中研究人員利用全基因組測序技術揭示了腫瘤基因組結構性改變的光譜模式，該技術可以幫助
全基因組測序，把你身體里的疾病都扼殺在搖籃里
下午三點多，我剛上班，就接了好幾個電話。最近體檢人數較多，他們大多數咨詢的都是腫瘤標志物。其中一個體檢者語氣尤其焦急：“醫生，我不會得癌癥了吧？腫瘤標志物有幾項都高。”我問了她的姓名，然后從電腦調出她的結果：AFP：5.3（參考值0-10）CEA：9.6(參考值0-6)CA19-9：4
基因組測序
如果樓主指的是人類基因組計劃，那時用的方法叫做雙脫氧終止法，也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成過程中，DNA聚合酶能夠使用ddNTP(雙脫氧核苷酸）來作為原料，但它的反應會在加入ddNTP的時候終止。具體實驗是通過PCR來完成的，但與普通PCR不同，它只需要一個引物而不是一對。在4個相同的