植物所揭示萊茵衣藻m6A表觀轉錄組圖譜
m6A是廣泛存在于真核生物mRNA中的表觀修飾，與RNA命運相關。近年來，m6A修飾在植物胚胎發育、莖尖分生組織的命運決定、表皮毛發生、根部發育、葉形態發生、開花轉變、脅迫響應、果實成熟及孢子發生等多個生物學過程中發揮重要功能。然而，m6A在藻類中的功能尚不清楚。藻類包含從單細胞到多細胞的多種細胞結構的物種，在進化中具有重要地位。綠藻門的萊茵衣藻是一種單細胞、單倍體、且兼具動植物屬性的藻類，是常被用作研究有性生殖、光合作用和代謝等重要生物學過程的模式生物。目前，在基因表達水平和蛋白水平的研究揭示了萊茵衣藻有性生殖過程中的許多重要調控蛋白，但關于m6A修飾是否參與萊茵衣藻有性生殖的調控仍然未知。 中國科學院植物研究所楊文強研究組通過MeRIP-seq結合轉錄組分析，闡明了萊茵衣藻有性生殖過程中m6A表觀轉錄組與轉錄組的特征，并發現m6A修飾廣泛存在于萊茵衣藻的轉錄本中。進一步的分析顯示，m6A修飾在萊茵衣藻轉錄本......閱讀全文
轉錄圖譜的轉錄圖譜的意義
在于它能有效地反應在正常或受控條件中表達的全基因的時空圖。通過這張圖可以了解某一基因在不同時間不同組織、不同水平的表達；也可以了解一種組織中不同時間、不同基因中不同水平的表達，還可以了解某一特定時間、不同組織中的不同基因不同水平的表達。人類基因組是一個國際合作項目：表征人類基因組，選擇的模式生物的D
家蠶絲腺單細胞轉錄組圖譜繪成
中新網重慶6月15日電 (記者 鐘旖)記者15日從家蠶基因組生物學國家重點實驗室(西南大學)獲悉，我國家蠶研究又有新進展。該實驗室徐漢福教授課題組近日在國際知名期刊Nature Communications《自然通訊》上發表相關主題研究論文，以單細胞分辨率揭示了家蠶絲腺的全細胞異質性及其基因轉
人腦多區域時空發育轉錄組圖譜獲解析
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/12/514996.shtm
人腦多區域時空發育轉錄組圖譜獲解析
科學家通過單細胞和時空轉錄組研究，首次解析迄今為止跨時間點最廣（GW6-GW23）、面積最大（最大4cm x 3cm）的人腦多區域時空發育轉錄組圖譜，為解碼人腦發育及區域特化研究提供了新見解。日前，相關研究成果發表在《細胞》上。 腦是人類最復雜和神秘的器官。解剖學上，腦可以被劃分為不同的區域，
Science：構建出真渦蟲細胞類型轉錄組圖譜
真渦蟲是一類相對簡單的動物，具有不同尋常的生物學特征：成年真渦蟲維持著其他有機體僅在胚胎中短暫存在的發育信息和祖細胞（progenitor cell）。真渦蟲獲得人們的大量研究，部分原因在于它們具有再生丟失的或受損的身體部位的獨特能力。圖片來自Christopher Fincher/Whiteh
靈長類原腸胚期至早期器官發育轉錄組圖譜繪制
安徽醫科大學國家衛生健康委配子及生殖道異常研究重點實驗室教授蔣祥祥，與中科院動物研究所王紅梅、郭帆團隊，美國得克薩斯大學西南醫學中心吳軍團隊合作，繪制了食蟹猴CS8-CS11時期（E20-E29）胚胎的單細胞轉錄組圖譜。相關研究成果近日發表于《自然》。 上世紀早期，科學家將人類胚胎發育的前60
復旦大學Nature子刊繪制大鼠轉錄組圖譜
來自復旦大學、美國食品藥品監督管理局(FDA)國家毒理學研究中心、洛馬林達大學等機構的研究人員，成功繪制出了涵蓋11種器官和4個發育階段的大鼠RNA測序轉錄組圖譜，這一重要的研究成果發表在2月10日的《自然通訊》(Nature Communications)雜志上。 復旦大學的石樂明(
楊樹次生木質部單細胞轉錄組圖譜建立
近日，北京林業大學教授張德強團隊在《植物生物技術雜志》發表研究論文。該研究以楊樹為研究模式，利用單細胞測序技術、基因組分析、RNA原位雜交、愈傷組織遺傳轉化等技術建立了楊樹次生木質部的單細胞轉錄組圖譜，重構了完整的楊樹次生木質部細胞類群，鑒定了調控木質部發育過程的關鍵轉錄因子，系統解答了次生木質
轉錄圖譜的原理
所有生物性狀和疾病都是由結構或功能蛋白質決定的，而已知的所有蛋白質都是由mRNA編碼的，這樣可以把mRNA通過反轉錄酶合成cDNA或稱作EST的部分的cDNA片段，也可根據mRNA的信息人工合成cDNA或cDNA片段，然后，再用這種穩定的cDNA或EST作為“探針”進行分子雜交，鑒別出與轉錄有關的基
轉錄圖譜的定義
轉錄圖譜是在識別基因組所包含的蛋白質編碼序列的基礎上繪制的結合有關基因序列、位置及表達模式等信息的圖譜。在人類基因組中鑒別出占具2%~5%長度的全部基因的位置、結構與功能，最主要的方法是通過基因的表達產物mRNA反追到染色體的位置。
上海生科院等建立小鼠早期胚胎空間轉錄組圖譜
3月22日，國際學術期刊《細胞》子刊《發育細胞》在線發表了中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所景乃禾研究組與中國科學院-馬普學會計算生物學伙伴研究所韓敬東研究組合作的最新研究成果“Spatial Transcriptome for the Molecular Annotatio
研究人員繪制七鰓鰻單細胞轉錄組圖譜
雷氏七鰓鰻作為現存的無頜脊椎動物代表，是一種由無脊椎動物向脊椎動物進化的過渡類型，被視為研究脊椎動物演化的重要模式生物。近日，華大生命科學研究院聯合遼寧師范大學七鰓鰻研究中心等單位在《自然—通訊》發表最新研究成果，團隊基于華大自主研發的DNBelab C4和 DNBSEQ測序平臺，采用單細胞RNA測
單細胞轉錄組測序構建胸腺器官發生的分子圖譜
2019年10月8日，四川大學胡洪波研究組、解放軍總醫院第五醫學中心劉兵研究組與暨南大學基礎醫學院蘭雨研究組合作在Immunity雜志在線發表了題為“Single-cell RNA Sequencing Resolves Spatiotemporal Development of Pre-thy
花生光暗幼苗的單細胞轉錄組圖譜構建成功
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/518535.shtm近日，廣東省農業科學院作物研究所花生研究團隊與合作者，在花生光暗形態轉變的單細胞基因表達譜研究方面取得進展，成功構建的花生光暗幼苗的單細胞轉錄組圖譜。相關成果發表于《植物生物技術雜志》
植物所揭示萊茵衣藻m6A表觀轉錄組圖譜
m6A是廣泛存在于真核生物mRNA中的表觀修飾，與RNA命運相關。近年來，m6A修飾在植物胚胎發育、莖尖分生組織的命運決定、表皮毛發生、根部發育、葉形態發生、開花轉變、脅迫響應、果實成熟及孢子發生等多個生物學過程中發揮重要功能。然而，m6A在藻類中的功能尚不清楚。藻類包含從單細胞到多細胞的多種細
研究成果：靈長類海馬衰老的單細胞轉錄組圖譜繪制
海馬體作為腦的重要組成部分，在學習和記憶中發揮重要作用。隨著年齡增長，海馬功能逐漸退化，導致認知功能的減退以及多種人類神經退行性疾病發生。由于海馬結構復雜，細胞組成具有高度異質性，傳統研究技術難以精確揭示海馬衰老過程中不同細胞類型的衰老規律及分子調控網絡。此外，由于倫理及樣本來源的限制，不同年齡
轉錄組測序和全轉錄組測序的區別
全轉錄組廣義上是指細胞在特定狀態下所能轉錄出來的?所有RNA的總和，包括mRNA和非編碼RNA?。借助高通量測序技術，可以全面獲取樣本中轉錄產物信息，結合競爭性內源RNA ( ceRNA)機制， 進行聯合分析，深入挖掘轉錄水平調控網絡。轉錄組測序的研究對象為特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有
科學家發表跨物種小腦皮層單細胞空間轉錄組圖譜
9月27日，《科學》（Science）在線發表了題為Cross-species single-cell spatial transcriptomic atlases of the cerebellar cortex的研究論文。該成果由中國科學院腦科學與智能技術卓越創新中心聯合杭州華大生命科學研究院、
轉錄組測序原理
而轉錄組測序即是利用高通量測序技術，將細胞或組織中的全部或部分mRNA, miRNA, lnc RNA 進行測序分析的技術。通過RNA-seq，也就是轉錄組測序，可以幫助我們了解各種比較條件下所有基因的表達差異包括：正常組織與腫瘤組織；藥物治療前后的表達差異；發育過程中，不同發育階段，不同組織的表達
北京基因組所構建出多物種轉錄圖譜綜合數據庫
隨著高通量測序技術的發展，轉錄組測序（RNA-seq）已成為系統研究基因轉錄及轉錄后水平調控狀態的常規方法，并在多個物種中得到廣泛應用。海量轉錄組數據以前所未有的速度產生，以數據驅動為導向的大規模數據整合、挖掘與解析面臨挑戰。為更充分展現轉錄組數據蘊含的豐富信息，服務生物醫學基礎研究領域需求，構
我國科學家成功獲得長春花葉片單細胞轉錄組圖譜
長春花為夾竹桃科長春花屬植物，在中草藥用途上，全草入藥有止痛、消炎等功效。單萜類吲哚生物堿（MIAs）是植物中最多樣的特殊代謝產物，具有重要的藥用價值。長春花能夠合成130多種MIAs，是研究單萜吲哚生物堿合成的模式藥用植物，其所含生物堿，如長春花堿、長春新堿等被用來臨床治療白血病、霍奇金淋巴瘤
我國學者發表基于單細胞轉錄組測序數據的小鼠細胞圖譜
在國家自然科學基金項目（項目編號：31722027）等資助下，浙江大學醫學院干細胞與再生醫學中心郭國驥教授團隊在單細胞組學技術及哺乳動物全細胞表達譜系分析研究中取得突破性進展。相關成果以“Mapping the Mouse Cell Atlas by Microwell-seq”（利用微孔板測序
我國學者發表基于單細胞轉錄組測序數據的小鼠細胞圖譜
在國家自然科學基金項目（項目編號：31722027）等資助下，浙江大學醫學院干細胞與再生醫學中心郭國驥教授團隊在單細胞組學技術及哺乳動物全細胞表達譜系分析研究中取得突破性進展。相關成果以“Mapping the Mouse Cell Atlas by Microwell-seq”（利用微孔板測序
轉錄物組的定義
轉錄組也稱“轉錄物組”。是一個基因組轉錄的所有RNA。
轉錄組高通量測序
（第二代高通量測序技術-454） 轉錄組即特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和，是研究細胞表型和功能的一個重要手段。與基因組不同的是，轉錄組的定義中包含了時間和空間的限定。同一細胞在不同的生長時期及生長環境下，其基因表達情況是不完全相同的。羅氏GS-FLX-Titaniu
轉錄物組的定義
轉錄組也稱“轉錄物組”。是一個基因組轉錄的所有RNA。
轉錄組測序流程步驟
以真核轉錄組測序為例，實驗流程為總RNA提取-mRNA分離-建庫試劑-定量-文庫回收-橋式擴增-上機測序；項目分析流程為數據產出數據=數據去雜-轉錄組拼接-SSR分析及SNP分析-基因功能注釋-基因表達差異分析-差異基因表達模式聚類-差異基因富集分析。
轉錄組高通量測序
（第二代高通量測序技術-454） 轉錄組即特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和，是研究細胞表型和功能的一個重要手段。與基因組不同的是，轉錄組的定義中包含了時間和空間的限定。同一細胞在不同的生長時期及生長環境下，其基因表達情況是不完全相同的。羅氏GS-FLX-Titaniu
轉錄組高通量測序
（第二代高通量測序技術-454） 轉錄組即特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和，是研究細胞表型和功能的一個重要手段。與基因組不同的是，轉錄組的定義中包含了時間和空間的限定。同一細胞在不同的生長時期及生長環境下，其基因表達情況是不完全相同的。羅氏GS-FLX-Titaniu
轉錄組高通量測序
（第二代高通量測序技術-454） 轉錄組即特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和，是研究細胞表型和功能的一個重要手段。與基因組不同的是，轉錄組的定義中包含了時間和空間的限定。同一細胞在不同的生長時期及生長環境下，其基因表達情況是不完全相同的。羅氏GS-FLX-Titanium第二代