華大基因再發Science進行基因組比對
來自深圳華大基因研究院，丹麥哥本哈根大學，澳洲科學院等處的研究人員利用Illumina的 HiSeq 系統，完成了兩種蝙蝠的高通量全基因組測序分析，并進行了基因比對，為解析蝙蝠的飛行起源，以及蝙蝠為何會攜帶多種致病性強的病毒，提出了新的觀點。相關成果公布在Science雜志上。 文章的通訊作者分別是深圳華大基因王俊研究員，張國捷博士，以及澳洲科學院(CSIRO)王林發教授。 蝙蝠屬于翼手目(Order CHIROPTERA)，翼手目是哺乳動物中僅次于嚙齒目動物的第二大類群。作為世界上唯一能夠持續飛行的哺乳動物，蝙蝠的名聲并不好，常攜帶一些致病性最強的病毒，比如Nipah病毒，Ebola病毒，還有當年令世人聞之變色的SARS病毒。 由于蝙蝠化石時至今日保存的不多，因此科學家們對于這類動物的家族和進化樹了解的并不多，05年一組研究人員通過DNA測序分析了來自所有蝙蝠家族的17個核基因，解析了其進化歷史，......閱讀全文
哺乳動物“共同祖先”基因組重建完成
從鴨嘴獸到藍鯨，每一種現代哺乳動物都是生活在大約1.8億年前的“共同祖先”的后裔。人們對“共同祖先”知之甚少，現在，一個國際研究小組通過計算重建了其基因組。該成果將發表在《美國國家科學院院刊》上，對理解哺乳動物的進化和保護工作具有重要意義。 研究人員利用了來自32個活物種的高質量基因組序列，這
哺乳動物中制備基因組DNA實驗
實驗材料 動物組織試劑、試劑盒 PBS乙酸銨乙醇酚氯仿異戊醇TE儀器、耗材 離心機搖床研缽實驗步驟 1. ?切下組織并立即剪成小塊，置于液氮中凍結。?2. ?將200 mg~1 g 的組織用預冷的研缽和研杵研碎，或用錘子將其搗為細粉末，每100 mg 組織用1. 2 ml 消化緩沖液懸浮。?3. ?
哺乳動物中制備基因組DNA實驗
制備DNA ? ? ? ? ? ? 實驗材料 動物組織 試劑、試劑盒
植物和哺乳動物線粒體基因組的差異
植物細胞植物細胞的線粒體基因組的大小差別很大，最小的為100kb左右，大部分由非編碼的DNA序列組成，且有許多短的同源序列，同源序列之間的DNA重組會產生較小的亞基因組環狀DNA，與完整的“主”基因組共存于細胞內，因此植物線粒體基因組的研究更為困難。哺乳動物哺乳動物的線粒體基因DNA沒有內含子，幾乎
研究人員繪出蘋果基因組草圖
一個國際科研小組8月29日在英國《自然—遺傳學》（Nature Genetics）雜志上報告說，他們繪出了蘋果的基因組草圖，這將有助于從基因水平上分析蘋果性狀，培育更多蘋果新品種。 意大利、美國、新西蘭等國研究人員報告說，他們繪出的是廣受人們喜愛的“金冠蘋果”的基因組草圖。結果
哺乳動物中制備基因組DNA實驗——制備DNA
在DNA提取過程中應盡量避免使DNA斷裂和降解的各種因素，以保證DNA的完整性，為后續的實驗打下基礎。一般真核細胞基因組DNA有107-9bp，可以從新鮮組織、培養細胞或低溫保存的組織細胞中提取，常是采用在EDTA以及SDS等試劑存在下用蛋白酶K消化細胞，隨后用酚抽提而實現的。實驗材料動物組織試劑、
哺乳動物基因組三維結構首次確定
英國醫學研究理事會網站日前報道稱，英國科學家從單個細胞中確定出完整保存的哺乳動物基因組的首個3D結構，顯示了細胞核內所有染色體中的DNA是如何復雜地折疊在一起的。該項研究成果發表在近日出版的《自然》雜志上。 很多人對于呈現“X”形狀的染色體十分熟悉，但事實上，染色體僅在細胞分裂時呈現這種形態。
哺乳動物基因組三維結構首次確定
英國醫學研究理事會網站日前報道稱，英國科學家從單個細胞中確定出完整保存的哺乳動物基因組的首個3D結構，顯示了細胞核內所有染色體中的DNA是如何復雜地折疊在一起的。該項研究成果發表在近日出版的《自然》雜志上。 很多人對于呈現“X”形狀的染色體十分熟悉，但事實上，染色體僅在細胞分裂時呈現這種形態。
華大基因再發Science進行基因組比對
來自深圳華大基因研究院，丹麥哥本哈根大學，澳洲科學院等處的研究人員利用Illumina的 HiSeq 系統，完成了兩種蝙蝠的高通量全基因組測序分析，并進行了基因比對，為解析蝙蝠的飛行起源，以及蝙蝠為何會攜帶多種致病性強的病毒，提出了新的觀點。相關成果公布在Science雜志上。 文章的
北京鴨基因組研究或助力抗擊“禽流感”
2013年6月10日，由中國農業大學、深圳華大基因研究院和英國愛丁堡大學等多家單位合作完成的北京鴨基因組研究成果在《自然·遺傳學》(Nature Genetics)雜志上在線發表。這項研究鑒定了鴨子對禽流感產生免疫反應的相關遺傳基因，將有助于進一步了解鳥類的免疫機制，同時為深入解析禽流感病毒
研究人員系統鑒定出哺乳動物生精細胞RNA結合蛋白
南京醫科大學教授鄭科、郭雪江和副教授林明焰與中南大學教授、中信湘雅生殖與遺傳專科醫院副院長譚躍球等課題組合作，系統鑒定了哺乳動物生精細胞RNA結合蛋白、RNA結合結構域和非結構域元件，構建其男性不育相關基因突變圖譜，并揭示一非結構域元件增強RNA結合和調節精子發生的功能機制。近日，該成果在線發表于S
線粒體基因組的植物細胞和哺乳動物相關介紹
植物細胞 植物細胞的線粒體基因組的大小差別很大，最小的為100kb左右，大部分由非編碼的DNA序列組成，且有許多短的同源序列，同源序列之間的DNA重組會產生較小的亞基因組環狀DNA，與完整的“主”基因組共存于細胞內，因此植物線粒體基因組的研究更為困難。 哺乳動物 哺乳動物的線粒體基因DNA
癌癥研究人員聯手匯集腫瘤基因組數據
研究人員希望，數據分享將為利用諸如這些腦部腺癌細胞等腫瘤的基因組信息帶來更好的方法。 這是為大型癌癥研究中心的很多病人提供的最新希望：“讓我們測序你的腫瘤，或許我們能將其同擊敗這種惡性疾病的藥物匹配。”不過，現實是基因組分析仍然僅為癌癥病人提供了一小部分幫助。“我們多半時候不知道如何處理這些
迄今最大哺乳動物基因組庫為進化提供新見解
當21世紀初，小鼠、人類、大鼠和黑猩猩的完整基因組首次發表后，遺傳學家通過比較基因序列為了解哺乳動物進化打開了大門。為什么一些哺乳動物嗅覺特別靈敏？為什么有些哺乳動物要冬眠？為什么一些哺乳動物的大腦發更大？20年后的今天，由美國麻省理工學院、哈佛大學等單位的科學家牽頭的大型國際研究項目——“Zoon
研究人員破譯香蕉“美食蕉”品種香蕉基因組
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/512730.shtm廣東省農業科學院研究員易干軍領銜的香蕉遺傳改良團隊與廣西大學教授陳玲玲團隊合作，破譯了香蕉“美食蕉”品種香蕉基因組，首次在國際上組裝染色體級別的異源三倍體香蕉栽培種（AAB）參考基因
研究人員成功構建首個圭亞那柱花草基因組
在國家自然科學基金等項目的資助下，華南農業大學副教授陳曙團隊成功完成首個圭亞那柱花草染色體水平基因組組裝，從基因組、轉錄組及表觀遺傳組多維度解析其抗逆分子機制，為熱帶牧草分子育種與抗逆研究提供關鍵理論支撐與基因資源。相關成果近日發表于《植物雜志》（The Plant Journal）。圭亞那柱花草比
任兵教授最新Cell文章點評CRISPR重要成果
細胞的染色質結構控制著基因的表達，決定著細胞的生理狀態。在人類基因組中，結構變異是很常見的。不過，人們一直難以確定這些變異在人類疾病中起到了什么樣的作用。 日前，科學家們在CRISPR技術的幫助下發現，一些結構變異會干擾染色質拓撲結構，使增強子-啟動子互作發生異常，基因表達的時空模式發生改變，
Nature－Genetics－：發現鴨對禽流感產生免疫反應的基因
近日，《自然—遺傳學》期刊發表了鴨基因組的全序列，并找出令鴨子對禽流感產生免疫反應的遺傳基因。此一發現將有助科學家進一步了解水禽的免疫保護機制。 最近出現的H5N1亞型禽流感病毒已在家禽中廣泛散布，而鴨子更被視為此病毒的天然宿主。早期的研究顯示，鴨子能在毫無癥狀的情況下傳播流感病毒。
研究人員發現：霍亂正改變人類基因組
生命演化到今天，人類似乎已經進入最完美的狀態。我們的基因組是否已經穩定?改變是否還在發生?科學家們一直在尋找答案。一項新研究表明，當代人類也在進化，而引發這種進化的，竟然是霍亂。研究人員發現的證據證明：在霍亂流行的孟加拉國，人們的基因已經找到了對抗霍亂的辦法。這是發生在當代的人類進化案
研究人員發布最新版樹鼩基因組注釋
樹鼩是一種與實驗大鼠差不多大小的小型哺乳動物，是靈長類的近親。由于其繁殖周期短（約6周），飼養成本低，單胎產仔數較高（每胎2-5只）等特點，在某些方面有望替代非人靈長類用于生物醫學研究和應用。目前，樹鼩已被用于多種感染性疾病模型創建，是研究視覺系統與功能的很好的動物。中國科學院昆明動物研究所研究
研究人員首次破譯艾滋病病毒完整基因組
新華網華盛頓8月6日電 美國北卡羅來納大學6日報告說，該校的一個科研小組成功破譯了艾滋病病毒的完整基因組。這對于人類理解艾滋病病毒感染人體的機制，尋找抗“艾”新療法提供了有力幫助。 相關論文發表在6日出版的英國《自然》雜志上。研究小組負責人凱文·威克斯介紹說，艾滋病病毒的遺傳信息由單鏈核糖
研究人員構建人類陰道微生物基因組庫
6月21日，深圳市寶安中醫院（集團）副院長黃鏈莎、轉化醫學中心助理研究員孫文與大連醫科大學副教授鄢秋龍等課題組的最新合作成果發表于《自然—微生物學》。人類女性陰道是一個包括細菌、真菌和病毒在內的復雜微生態系統，各微生物之間是相互制約、相互作用、相互依賴、對立統一的關系，其間的平衡關乎女性生殖健康及胎
安捷倫授予臨床基因組研究人員Peter－Robinson“思想領袖獎”
分析測試百科網訊 2016年11月29日，安捷倫科技宣布將安捷倫思想領袖獎授予給Peter Robinson, M.D., MSC，以表彰其對臨床基因組學和計算生物學的貢獻。在今年早些時候，中國中醫科學院中藥研究所所長陳士林（詳見本網報道：中藥研究所所長陳士林獲得“安捷倫思想領袖獎”）和癌癥研究
日本研究人員首次成功繪制日本人基因組圖譜
據日本共同社報道，日本理化學研究所基因組醫科學研究中心日前通過新一代DNA測序儀成功繪制出首份日本人基因組圖譜。該成果10月24日發表在美國《自然—遺傳學》雜志網絡版上。 DNA一共有4種堿基排列組合，人類大約有30億對堿基對。新一代測序儀可將DNA進行極其精細的切片，對大量切片同時
研究人員完成棗和酸棗單倍型基因組組裝
近日，西北農林科技大學林學院紅棗團隊黃建研究員課題組以我國制干棗主栽品種‘駿棗’和著名“秦藥”代表清澗酸棗為研究材料，整合了PacBio HiFi、ONT ultra-long和Hi-C等多種先進測序技術以及多種組裝策略完成了棗和酸棗T2T gap-free和T2T gap-free單倍型基因組的組
研究人員成功測序蒙特莫朗西酸櫻桃基因組
密歇根州的酸櫻桃產量在全美名列前茅，密歇根州立大學的一個研究小組啟動了一個項目，旨在確定與酸櫻桃樹晚開有關的基因，以滿足不斷變化的氣候的需要。他們首先將晚開的櫻桃樹的DNA序列與一個相關物種--桃子的基因組測序進行了比較。他們首先將開花遲緩的酸櫻桃樹的DNA序列與它們的親戚桃子的基因組序列進行比較。
哺乳動物調控DNA復制起始以維持基因組穩定性的機理
DNA是主要的遺傳物質，也是中心法則的源頭。DNA代謝包括DNA復制、轉錄及DNA修復等。其中，DNA復制保證了遺傳信息精確完整地傳遞，而轉錄則是細胞身份維持和功能調控的關鍵。DNA復制發生在整個染色質上，而轉錄則只發生在染色質上的轉錄區。如果這兩個關鍵的細胞過程碰撞，猶如獨木橋上獅虎相遇，會發
研究人員觀測到人類基因組新的“暗物質”
人類對基因組變異的認識又向前推進一大步：西安交通大學日前傳出消息，該校葉凱青年科學家工作室團隊與荷蘭、美國、德國的20個科研機構，通過開發新的計算機算法和分析處理流程，分析并報道了在250個健康家庭的基因組中的所有類型變異，其中包括以前從未觀測到的大量復雜型變異，即基因組中的“暗物質”。 據介
研究人員解析人類基因組計劃的贏利奧秘
人類基因組計劃(genome project)為美帶來1萬億美元經濟增長。 美國巴特爾紀念研究所6月12日發布的一份頗具爭議的報告指出，解碼人類基因組項目的經濟收益持續增長。該項目結束10年后，目前其帶來的收益已接近1萬億美元。 1988~2003 年進行的人類基因組計劃(genom
基因組所重復序列與哺乳動物內含子擴張關系研究獲進展
近日，在中國科學院北京基因組研究所副所長、基因組科學與信息重點實驗室主任于軍研究員和“百人計劃”雷紅星研究員的指導下，基因組所王大鵬博士、博士研究生蘇堯等科研人員在哺乳動物基因組內含子擴張與基因功能關系研究，以及突變和自然選擇在基因組進化中的作用研究中取得新進展。相關學術論文在Ev