用PCR來制備編碼隨機肽的雙鏈DNA文庫實驗
試劑、試劑盒 限制性內切酶和緩沖液滅菌雙蒸水Tris-HCl生物素標記的 PCR 引物儀器、耗材 鏈霉抗生物素蛋白磁性珠瓊脂糖凝膠電泳所需的試劑和設備實驗步驟 一、材料1. 緩沖液、溶液和試劑滅菌雙蒸水(ddH20)10 mmol/LTris-HCl,pH8.02. 酶和酶緩沖液限制性內切酶和緩沖液(見第 9 步)10XVent 緩沖液VentDNA 聚合酶3. 核酸和寡核苷酸生物素標記的 PCR 引物,長度至少 15bp,5'末端進行了生物素修飾(見圖 26-1)。編碼 12 個氨基酸的 NNK 庫。庫的設計如圖 26-1(a) 所示。合成的鏈含有一個隨機多肽庫,它們的 3'末端和 5‘末端都加了一個特定的側翼序列,作為引物結合的位點,并且含有限制性內切酶的識別位點,以方便將文庫 DNA 克隆進合適的載體系統。側翼序列長度至少應該有 15bp,并且設計時應該有 3 個標準:......閱讀全文
用-PCR-來制備編碼隨機肽的雙鏈-DNA-文庫實驗
? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 限制性內切酶和緩沖液 滅菌雙蒸水 Tris-HCl 生物素標記的 PCR 引物 儀器、耗材
用-PCR-來制備編碼隨機肽的雙鏈-DNA-文庫實驗
試劑、試劑盒?限制性內切酶和緩沖液滅菌雙蒸水Tris-HCl生物素標記的 PCR 引物儀器、耗材?鏈霉抗生物素蛋白磁性珠瓊脂糖凝膠電泳所需的試劑和設備實驗步驟?一、材料1. 緩沖液、溶液和試劑滅菌雙蒸水(ddH20)10 mmol/LTris-HCl,pH8.02. 酶和酶緩沖液限制性內切酶和緩沖液
用-PCR-來制備編碼隨機肽的雙鏈-DNA-文庫實驗
使用合成的寡核苷酸構建文庫時,PCR 有兩個重要的作用。第一,用與特定側翼序列退火的引物來擴增文庫,僅用少量的不同模板,就可以得到大量的 PCR 產物。第二,若要產生文庫 DNA 的復雜互補鏈,PCR 合成法是有效的方法。本實驗來源于 PCR 實驗指南(第二版),作者:種康,瞿禮嘉。試劑、試劑盒限制
用-PCR-對一個隨機多肽-DNA-文庫的質量進行控制實驗
? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 ddH20 Vent 緩沖液 Vent DNA 聚合酶 dNTP 引物 質粒 DNA
用-PCR-對一個隨機多肽-DNA-文庫的質量進行控制實驗
試劑、試劑盒 ddH20Vent 緩沖液Vent DNA 聚合酶dNTP引物質粒 DNA儀器、耗材 瓊脂糖凝膠電泳所需的試劑和設備熱循環儀實驗步驟 一、材料1. 緩沖液、溶液和試劑ddH202. 酶和酶緩沖液10X Vent 緩沖液Vent DNA 聚合酶3. 核酸和寡核苷酸dNTP,各 20 mm
用-PCR-對一個隨機多肽-DNA-文庫的質量進行控制實驗
該方案中,用 PCR 分析由質粒載體編碼的隨機多肽文庫。該文庫是由連接反應的產物轉化細菌后得到的,方案 2 已經介紹過,然后再用標準的程序對質粒進行擴增和純化。本實驗來源于 PCR 實驗指南(第二版),作者:種康,瞿禮嘉。試劑、試劑盒ddH20Vent 緩沖液Vent DNA 聚合酶dNTP引物質粒
建立隨機重疊DNA插入文庫實驗
下面的方案描述了鳥槍法測序的起始步驟,從靶 DNA 的剪切到用 M13 噬菌體載體構建 DNA 片段文庫,也包括斷裂靶 DNA 的兩種方法--超聲法和噴霧法,以及用 DNA 聚合酶修復片段末端的技術要點。本實驗來源于分子克隆實驗指南(第三版)下冊,作者:〔美〕J. 薩姆布魯克 D.W.拉塞爾。試劑、
建立隨機重疊DNA插入文庫實驗
? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 乙酸銨 ATP 乙醇 甘油 蒸餾水 IPTG MgCl2 NaCl 酚
雙鏈DNA探針隨機引物合成法
? 隨機引物合成雙鏈探針是使寡核苷酸引物與DNA模板結合,在Klenow酶的作用下,合成DNA探針。合成產物的大小、產量、比活性依賴于反應中模板、引物、dNTP和酶的量。通常,產物平均長度為400-600個核苷酸。利用隨機引物進行反應的優點是:(1)Klenow片段沒有5'→3'外切
用-PCR-控制基因組-DNA-文庫的質量實驗
試劑、試劑盒?ddH20Vent 緩沖液Vent DNA 聚合酶 dNTP質粒 DNAPCR 引物儀器、耗材?瓊脂糖凝膠電泳所需的試劑和設備熱循環儀實驗步驟?一、材料1. 緩沖液、溶液和試劑ddH202. 酶和酶緩沖液10X Vent 緩沖液Vent DNA 聚合酶3. 核酸和寡核苷酸dNTP,各
用-PCR-控制基因組-DNA-文庫的質量實驗
? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 ddH20 Vent 緩沖液 Vent DNA 聚合酶 dNTP 質粒 DNA PCR 引物
用-PCR-控制基因組-DNA-文庫的質量實驗
在該方案中,用限制性內切酶的混合物處理人類基因組 DNA(內切酶混合物的識別位點為 4bp),產生大概 50?500bp 的片段。最終使用這一類型的表達文庫,是通過利用表型的和生化的篩選方法,分離編碼功能多肽或蛋白片段的基因片段。用KlenowDNA 聚合酶處理后,基因組 DNA 片段成為平末端,然
單鏈DNA文庫的SELEX篩選實驗
實驗方法原理 SELEX 技術除了可以使用 RNA 文庫以外,還可以使用單鏈 DNA 文庫進行篩選。單鏈 DNA 形成高級結構的豐富性也足夠用于對許多靶分子的篩選,而且 DNA 文庫具有更好的穩定性,操作也相對簡便。實驗材料 3' 引物鏈親和素磁珠儀器、耗材 電泳儀PCR 儀離心機凝膠成像儀
單鏈DNA文庫的SELEX篩選實驗
單鏈DNA文庫的SELEX篩選實驗可用于:(1)體外診斷;(2)體內治療等。實驗方法原理SELEX 技術除了可以使用 RNA 文庫以外,還可以使用單鏈 DNA 文庫進行篩選。單鏈 DNA 形成高級結構的豐富性也足夠用于對許多靶分子的篩選,而且 DNA 文庫具有更好的穩定性,操作也相對簡便。實驗材料3
單鏈DNA文庫的SELEX篩選實驗
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 SELEX 技術除了可以使用 RNA 文庫以外,還可以使用單鏈 DNA 文庫進行篩選。單鏈 DNA 形成高級結構的豐富性也足夠用于對許多靶分子的篩選,而且 DNA 文庫具有更好的穩定性,操作也相對簡便。
隨機引物合成法雙鏈DNA探針標記法
隨機引物合成雙鏈探針是使寡核苷酸引物與DNA模板結合,在Klenow酶的作用下,合成DNA探針。合成產物的大小、產量、比活性依賴于反應中模板、引物、dNTP和酶的量。通常,產物平均長度為400-600個核苷酸。利用隨機引物進行反應的優點是:(1)Klenow片段沒有5'→3'外切酶活
制備DNA測序模板實驗——雙脫氧測序的雙鏈質粒DNA的堿變性
實驗材料DNA試劑、試劑盒NaOHEDTA乙酸鈉乙醇儀器、耗材離心管離心機搖床實驗步驟1. ?加入約0.5 pmol 重組質粒DNA于0.5 ml 微量離心管中,如果體積大于20 μl 應以乙醇沉淀,重溶于20 μl 水。2. ?如果體積小于20 μl,用水補足20 μl。3. ?加入2 μl 2
基于-PCR-的-DNA-文庫篩選實驗方法
? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 PCR 混合物 PCR 引物寡核苷酸 雜交寡核苷酸 PCR 正對照 PCR 主要混合物 蒸餾水
基于-PCR-的-DNA-文庫篩選實驗方法
試劑、試劑盒PCR 混合物PCR 引物寡核苷酸雜交寡核苷酸PCR 正對照PCR 主要混合物蒸餾水儀器、耗材瓊脂糖凝膠電泳設備實驗步驟一、材料1. 緩沖液、溶液和試劑蒸餾水2. 酶和酶緩沖液PCR 混合物(可以放在一起冰凍),對于 lml 反應,包括:200nmol 的各種 dNTP;1XVent 溶
基于-PCR-的-DNA-文庫篩選實驗方法
試劑、試劑盒 PCR 混合物PCR 引物寡核苷酸 雜交寡核苷酸PCR 正對照PCR 主要混合物蒸餾水儀器、耗材 瓊脂糖凝膠電泳設備實驗步驟 一、材料1. 緩沖液、溶液和試劑蒸餾水2. 酶和酶緩沖液PCR 混合物(可以放在一起冰凍),對于 lml 反應,包括:200nmol 的各種 dNTP;1XVe
隨機RNA文庫的SELEX篩選實驗
實驗方法原理 SELEX 技術是一種利用隨機寡核苷酸(DNA 或 RNA)文庫篩選靶分子的特異性配基的組合化學技術。最常用的是隨機 RNA 文庫,因為 RNA 分子中除 G-C、A-U 堿基對以外,還有 G-U 等變偶堿基對的存在,可以形成發夾、假結、凸環、G-四聚體等多種空間結 構,它
隨機RNA文庫的SELEX篩選實驗
隨機RNA文庫的SELEX篩選實驗可用于:(1)體外診斷;(2)體內治療等。實驗方法原理SELEX 技術是一種利用隨機寡核苷酸(DNA 或 RNA)文庫篩選靶分子的特異性配基的組合化學技術。最常用的是隨機 RNA 文庫,因為 RNA 分子中除 G-C、A-U 堿基對以外,還有 G-U 等變偶堿基對的
隨機RNA文庫的SELEX篩選實驗
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 SELEX 技術是一種利用隨機寡核苷酸(DNA 或 RNA)文庫篩選靶分子的特異性配基的組合化學技術。最常用的是隨機 RNA 文庫,因為 RNA 分子中除 G-C、A-U 堿基對以外,還有 G-U 等變偶堿基對的存在,可以形
新一代高通量測序技術SOLiD簡介
目前市場上有四種高通量測序儀,分別是Solexa,454 (GS-FLX),SOLiD和Polonator。根據測序原理,它們可以被分為兩大類:使用合成法測序(Sequencing by Synthesis)的Solexa和454,及使用連接法測序(Sequencing by Ligation
新一代高通量測序技術SOLiD簡介
目前市場上有四種高通量測序儀,分別是Solexa,454 (GS-FLX),SOLiD和Polonator。根據測序原理,它們可以被分為兩大類:使用合成法測序(Sequencing by Synthesis)的Solexa和454,及使用連接法測序(Sequencing by Ligation
高通量測序技術SOLiD簡介
目前市場上有四種高通量測序儀,分別是Solexa,454 (GS-FLX),SOLiD和Polonator。根據測序原理,它們可以被分為兩大類:使用合成法測序(Sequencing by Synthesis)的Solexa和454,及使用連接法測序(Sequencing by Ligat
用于-PCR-的模板-DNA-制備實驗
酚-氯仿法提取石蠟組織中 DNA 改進的石蠟切片 DNA 提取方法 直接法(DNA 免提法) 冰凍片 含血標本 胸腹水或尿液 ? ? ? ? ? ?
用于-PCR-的模板-DNA-制備實驗
實驗方法原理 實驗步驟 1. 10 mm 厚石蠟切片 10~15 張,置入消毒后的 1.5 ml Eppendorf 管中。2. 脫蠟 二甲苯 1200 μl,9000 r/min,8 min×3。3. 脫水無水乙醇 1200 μl,9000 r/min,5 min×3。4. 打開 Eppendor
核糖體失活展示系統實驗
實驗材料 RTA 基因試劑、試劑盒 結合(或漂洗)緩沖液生物素瓊脂糖洗脫緩沖液儀器、耗材 RNeasy?mini 試劑盒實驗步驟 這里介紹的方法概括了表達載體的構建以及篩選功能蛋白的 RIDS 循環系統的構建。3.1 RIDS 表達載體的構建首先,需要準備含編碼 T7 啟動子、蛋白質文庫、連接子
核糖體失活展示系統實驗
核糖體失活展示系統 ? ? ? ? ? ? 實驗材料 RTA 基因 試劑、試劑盒