NGS文庫制備的方法比較
近年來，新一代測序(NGS)技術的應用日益廣泛。隨著測序技術的不斷改進，制備核酸和構建NGS文庫的方法也在改進。對于各種文庫制備方法，我們該如何選擇?近日，美國斯克里普斯研究所的研究人員在《Biotechniques》上發表文章，比較了各種文庫制備策略。 總的來說，在NGS分析之前，制備RNA或DNA的主要步驟包括：片段化和/或篩分指定長度的目標序列;將目標片段轉化成雙鏈DNA;在片段末端連上寡核苷酸接頭;以及定量最終的文庫。 DNA片段的大小是NGS文庫構建的主要因素。DNA片段化主要是通過物理方法(如超聲破碎)或酶學方法(即非特異的核酸內切酶處理)來實現的。作者將這兩種方法進行了比較，發現它們都很有效。不過，與物理方法相比，酶學方法(Fragmentase)產生更多人為的插入缺失。作者還提到了Illumina的Nextera技術，認為它能夠減少樣品處理并節約時間。 作者提到，在制備DNA樣品的文庫時，應......閱讀全文
科學狂人：文庫制備對宏基因組測序影響很大
我們體內生活著不計其數的微生物，它們組成的生態系統就是微生物組。近年來人們發現這些微生物對人體健康有著重要的影響，微生物組研究因此受到了極大的重視，甚至被稱為是人體的“第二基因組”。 微生物組參與了許多重要的機體功能，比如消化食物、合成營養物質和抵御疾病。許多人類疾病都與微生物組失衡有關。科學
安捷倫：用于RNA測序的文庫制備與靶向序列捕獲解決方案
簡化的RNA和DNA測序解決方案，用于精簡臨床NGS 2020年9月1日，北京——安捷倫科技公司（紐約證交所：A）今日宣布推出SureSelect XT HS2 RNA試劑盒。該解決方案采用模塊化設計，為RNA 和 DNA樣品提供了一種簡單的平行分析方法，從而確保客戶能夠簡化并整合其工作流程，而無
液體處理專家如何自動化、標準化捕獲測序文庫制備
目標區域捕獲測序技術，是根據已知特定基因組區域序列設計寡核苷酸探針，通過雜交將目標區域捕獲富集進行二代測序。其針對目標區域深度測序，增加了檢查靈敏度和準確性。既滿足研究需求，又降低測序成本，在科研、臨床中均備受關注。液體處理專家貝克曼庫爾特推出Biomek 自動化捕獲測序方案，幫助您實現自動化、標準
NGS文庫制備的方法比較
近年來，新一代測序(NGS)技術的應用日益廣泛。隨著測序技術的不斷改進，制備核酸和構建NGS文庫的方法也在改進。對于各種文庫制備方法，我們該如何選擇?近日，美國斯克里普斯研究所的研究人員在《Biotechniques》上發表文章，比較了各種文庫制備策略。 總的來說，在NGS分析之前，制備R
基因文庫制備儀簡介
基因文庫制備儀是一種用于基礎醫學領域的分析儀器，于2015年11月1日啟用。 技術指標 通量為10M，100M和1G測序芯片可以任意選擇；標準測序時間為2~3小時；使用無標記的核苷酸及酶進行測序。 主要功能 新一代測序技術，基因組DNA序列測定（微生物基因組測序、線粒體測序、靶向測序）、
DNA文庫構建和Illumina測序化學原理
單細胞測序方法和原理系列：所謂DNA文庫，實際上是許多個DNA片段，在兩端接上了特定的DNA接頭，形成的DNA混合物。文庫有2個特點：1. 當中這一段插入的DNA，它的序列是各種各樣的。2. 它的兩頭的街頭序列，是人工特異加上去的，是已知的。要構建文庫，首先需要把基因組DNA用超聲波打斷，之后把兩端
NGS文庫制備新品實現5hmC分析
近年來，新一代測序(NGS)平臺在甲基化研究中開始嶄露頭角。它們帶來了非常靈敏的DNA甲基化圖譜，以單分子分辨率覆蓋整個CpG島。然而，對于時下熱門的5-hmC研究，似乎還缺乏專門的樣品制備工具。為此，Zymo Research公司近日推出兩款新的NGS文庫制備試劑盒，適用于全基因組范圍的5
Agilent－SureSelectQXT－WGS－文庫制備的質量控制
摘要 本應用簡報按照 Agilent SureSelectQXT WGS 文庫制備方案，介紹了 Agilent 4200 TapeStation 系統在工作流程中的樣品質量控制 (QC) 性能。基因組 DNA ScreenTape 分析法是對基因組 DNA 起始材料進行系列定量分析并提供完
cDNA文庫組標準流程四:載體制備
1．pBlueScriptII的提取1．取1ul商品的pBlueScriptII，轉化入大腸桿菌宿主菌中，取5ul轉化產物均勻涂布在含AMP的LB平板上，37℃培養過夜。2．第二天取一只無菌的50ml離心管，加入10ml AMP抗性的LB液體培養基，挑單克隆于離心管中，37℃，250rpm，培養過夜
文庫甘油儲存料中噬菌體抗體的制備
實驗概要本實驗從文庫甘油儲存料中制備了噬菌體抗體。主要試劑1. 2×TY/amp/glu培養基2. TYE/amp/glu平板3. 含有25ug/ml卡那霉素和2％葡萄糖的TYE平板(TYE/kan/glu)4. 含100ug/ml氨芐青霉素和25ug/ml卡那霉素的2×TY培養基(2×TY/amp
Agilent－SureSelectQXT－WGS－文庫制備的質量控制
本應用簡報按照 Agilent SureSelectQXT WGS 文庫制備方案，介紹了 Agilent 4200 TapeStation 系統在工作流程中的樣品質量控制 (QC) 性能。基因組 DNA ScreenTape 分析法是對基因組 DNA 起始材料進行系列定量分析并提供完整性信息的可
文庫甘油儲存料中噬菌體抗體的制備
實驗概要本實驗從文庫甘油儲存料中制備了噬菌體抗體。主要試劑1. 2×TY/amp/glu培養基2. TYE/amp/glu平板3. 含有25ug/ml卡那霉素和2％葡萄糖的TYE平板(TYE/kan/glu)4. 含100ug/ml氨芐青霉素和25ug/ml卡那霉素的2×TY培養基(2×TY/amp
揭秘NGS全自動文庫制備系統Magnis－BR
近年來，NGS技術的進步加速了基因組學研究的腳步，也為腫瘤等疾病的精準診斷提供極大助力。NGS檢測的推廣既是客觀需要，也是大勢所趨。作為NGS的前期關鍵步驟，文庫制備的質量對測序結果可產生決定性的影響。近日，第九屆中國病理年會上，廣州燃石醫學檢驗所有限公司（以下簡稱“燃石醫學”）與安捷倫科技有限公司
Agilent－SureSelectQXT－WGS－文庫制備的質量控制（一）
摘要本應用簡報按照 Agilent SureSelectQXT WGS 文庫制備方案，介紹了 Agilent 4200 TapeStation 系統在工作流程中的樣品質量控制 (QC) 性能。基因組 DNA ScreenTape 分析法是對基因組 DNA 起始材料進行系列定量分析并提供完整性
Agilent－SureSelectQXT－WGS－文庫制備的質量控制（二）
gDNA 的數量和完整性SureSelectQXT WGS 方案需要高質量的 DNA 樣品，以獲得最佳性能和 gDNA 起始材料的精確定量結果。按照該方案使用配有 dsDNA BR 分析試劑盒的 Qubit 儀器進行系列定量分析。將相同的樣品在 4200 TapeStation 系統和 Nano
Agilent－SureSelectQXT－WGS－文庫制備的質量控制（三）
不同 gDNA 起始量的電泳疊加圖顯示，使用 2100 生物分析儀 (A) 和 4200 TapeStation (B) 系統，文庫片段分子量分布（圖 5）呈現出不同的彌散條帶曲線。50 ng 的最佳 gDNA 起始量可得到平均分子量在 600–1000 bp 之間的文庫曲線。最小的 gDN
關于DNA測序技術的測序凝膠板的制備
一、玻璃板的處理 銀染測序的玻璃板一定要非常清潔，一般先用溫水和去污劑洗滌，再用去離子水沖洗玻璃板，除去殘留的去污劑，最后用乙醇清洗玻璃板。玻璃板上遺留的去污劑微膜可能導致凝膠染色時背景偏高(棕色)。短玻璃板經粘合溶液處理可將凝膠化學交聯于玻璃板上。這一步對于在銀染操作過程中防止凝膠撕裂至關重
制備DNA測序模板實驗
實驗材料 大腸桿菌試劑、試劑盒 LBTEM13聚乙二醇容易讓頂層瓊脂乙酸鈉乙醇儀器、耗材 巴斯德吸管試管離心機實驗步驟 1. ?如果起始用M13復制型DNA或M13單鏈DNA，以0.5 ng 重組M13mp復制型DNA或5~10 ng 單鏈DNA轉化40 μl ?感受態大腸桿菌DH5αF'株
制備DNA測序模板實驗
制備單鏈M13噬菌體DNA 小量裂解物中制備λ噬菌體DNA 雙脫氧測序的雙鏈質粒DNA的堿變性 ? ? ? ? ? ? 實驗材料 大腸桿菌
DNA測序電泳的樣品制備
當在預電泳時，即可進行樣品的制備，將反應完畢的樣品在沸水浴中加熱1～3分鐘，立即置于冰上即可。如果樣品長時間不用，則應重新處理。可使用4～6%聚丙烯酰胺凝膠，膠厚0.4 mm。厚度小于0.4 mm的膠可能導致信號太弱。加樣時不必吸去上層覆蓋的礦物油，但要小心地吸取礦物油下的藍色樣品。
消減－cDNA－或基因組－DNA－文庫的制備實驗
一次雙向消減，需要總量為 2ug 的基因組 DNA 或 cDNA。大多數分離 RNA 和基因組DNA 的方法都適用于本實驗（Sambrooketal.1989;ChomczynskiandSacchi1987;Farrell1993)。本實驗來源于 PCR 實驗指南（第二版），作者：種康，瞿禮嘉。試
消減－cDNA－或基因組－DNA－文庫的制備實驗
試劑、試劑盒 緩沖液、溶液和試劑酶和酶緩沖液核酸和寡核苷酸放射性化合物酚儀器、耗材 熱循環儀水浴箱瓊脂糖凝膠電泳所需的試劑與設備實驗步驟 第1階段：RNA和DNA的分離一次雙向消減，需要總量為2ug的基因組DNA或cDNA。大多數分離RNA和基因組DNA的方法都適用于本實驗（Sambrooketal
消減－cDNA－或基因組－DNA－文庫的制備實驗
? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 緩沖液、溶液和試劑 酶和酶緩沖液 核酸和寡核苷酸 放射性化合物 酚 儀器、耗材
Biomek－NGenius下一代文庫制備系統發布
Beckman Coulter Life Sciences 推出了 Biomek NGenius 液體處理系統。該公司表示，該儀器具有集成的熱循環儀、實驗室器皿運輸和試劑分裝功能，可實現手動文庫構建和試劑轉移的自動化。據該公司稱，它還通過利用 Dynamic DeckOptix 技術的光學分析來
重磅|華大智造首度公開旗下測序儀文庫構建核心序列
2018年9月8日，在華大基因集團19周年慶前夕，華大智造首次向業內公開華大智造測序儀文庫構建核心序列，致敬華大基因集團。華大智造成立于2016年，一直致力于研發和生產基因測序設備。如行業內小伙伴們所知，華大智造已擁有四款高通量測序儀——BGISEQ-500、BGISEQ-50、MGISEQ-2
Illumina推出Nextera－DNA－Flex全基因組測序制備產品
近日，Illumina宣布推出一款全新的全基因組測序(WGS)文庫制備產品——Nextera DNA Flex，它讓全血和唾液樣本省去了樣本制備，也讓文庫制備流程跳過了一些繁瑣步驟，比如DNA的機械片段化、定量和歸一化。Nextera DNA Flex提供了一個快速、整合的流程，適合廣泛的應用，
DNA測序的凝膠的制備介紹
（1）玻璃板經粘合硅膠和Sigmacote處理后，即可固定玻璃板。該方法是用0.2 mm或0.4 mm厚的邊條置于玻璃板左右兩側，將另一塊玻璃板壓于其上。在長玻璃板的一側插入鯊魚齒梳平的一面邊緣，用夾子固定住。 （2）根據所需要的凝膠濃度，按下表制備測序凝膠，一般6%～8%的膠濃度可獲得較好的
CDNA文庫
?CDNA文庫（主要內容如下）·?????????Construction of cDNA Library·?????????Construction of Genome DNA Library·?????????Library Screening??OthersConstruction of cD
用－PCR－來制備編碼隨機肽的雙鏈－DNA－文庫實驗
使用合成的寡核苷酸構建文庫時，PCR 有兩個重要的作用。第一，用與特定側翼序列退火的引物來擴增文庫，僅用少量的不同模板，就可以得到大量的 PCR 產物。第二，若要產生文庫 DNA 的復雜互補鏈，PCR 合成法是有效的方法。本實驗來源于 PCR 實驗指南（第二版），作者：種康，瞿禮嘉。試劑、試劑盒限制
用－PCR－來制備編碼隨機肽的雙鏈－DNA－文庫實驗
試劑、試劑盒?限制性內切酶和緩沖液滅菌雙蒸水Tris-HCl生物素標記的 PCR 引物儀器、耗材?鏈霉抗生物素蛋白磁性珠瓊脂糖凝膠電泳所需的試劑和設備實驗步驟?一、材料1. 緩沖液、溶液和試劑滅菌雙蒸水（ddH20)10 mmol/LTris-HCl，pH8.02. 酶和酶緩沖液限制性內切酶和緩沖液